Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 387,924 | (G)5→4 | intergenic (+54/+53) | tauD → / ← hemB | taurine dioxygenase/5‑aminolevulinate dehydratase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 387,920 | 0 | G | . | 99.1% | 467.3 / ‑3.6 | 106 | intergenic (+50/+57) | tauD/hemB | taurine dioxygenase/5‑aminolevulinate dehydratase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base . (94/11); total (94/12) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.13e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAGGGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGC > NC_000913/387828‑388010 | ggCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAg > 2:6245038/1‑93 (MQ=255) ggCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAg > 2:1919951/1‑93 (MQ=255) gCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAgg < 1:4777887/93‑1 (MQ=255) gCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAgg < 2:707244/93‑1 (MQ=255) gCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAgg > 2:4391219/1‑93 (MQ=255) gCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCCTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAgg > 2:1290588/1‑93 (MQ=255) gCGACGATCCGTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAgg < 1:4365535/93‑1 (MQ=255) gacgaTCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGGTAGGGTGAgggg > 2:5133448/1‑93 (MQ=255) acgaTCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAggggg > 2:5468727/1‑93 (MQ=255) acgaTCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGCGAggggc > 1:1692466/1‑92 (MQ=255) acgaTCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCCTGGGGAGGG‑GGGTAGGGTGAggggc > 2:3472948/1‑92 (MQ=38) cgaTCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAggggcg < 1:5123372/93‑3 (MQ=255) gaTCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGGTAGGGTGAggggcgt > 2:3747398/1‑90 (MQ=255) aTCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAggggcgtt > 1:4927224/1‑89 (MQ=255) tCCTGGGGTATAAACCGTTTTATGGGGCGGGGTAATAGGAGAGTGGACGGCCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTc < 2:3179973/93‑1 (MQ=25) ccTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCa > 1:3367577/1‑93 (MQ=255) cTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGCGA‑GGGG‑CGTTCAc > 1:5154668/1‑93 (MQ=255) ttGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCGCTCGCCCCCCTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGGTCAcc > 1:1825369/1‑93 (MQ=37) ttGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCAcc > 1:5037561/1‑93 (MQ=255) ttGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGGTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCAcc > 2:286789/1‑93 (MQ=255) ggggATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGt > 1:3422318/1‑93 (MQ=255) gATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACt > 2:5063322/1‑93 (MQ=255) aTAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACtt > 2:2770506/1‑93 (MQ=255) tAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACttt > 1:4700038/1‑93 (MQ=255) aaaaCAGTTTTATCGGGAGGGGTAATACGAGAGTGGACGGCCCCCTCGCCCCTTGGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACttt < 2:6309533/92‑1 (MQ=25) aaaCCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTc > 2:3059067/1‑93 (MQ=255) aaCCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGGGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCa > 1:5267653/1‑93 (MQ=255) aaCCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCa > 2:366410/1‑93 (MQ=255) aCCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCaa > 2:4376105/1‑93 (MQ=255) aCCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCaa > 1:821818/1‑93 (MQ=255) cGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACa > 2:3219335/1‑93 (MQ=255) cGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACa > 1:4925564/1‑93 (MQ=255) cGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACa > 1:6226085/1‑93 (MQ=255) gTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAg > 1:575164/1‑93 (MQ=255) ttttATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAgg > 1:1408462/1‑93 (MQ=255) ttttATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAgg > 2:239580/1‑93 (MQ=255) tttATGGGGCGGGTTAATACGAGAGTGGACGGCCCCCTCGCCCCTTGGGGGAGAG‑GGTAGGGGTG‑GGGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGt < 2:1032719/93‑1 (MQ=255) gggcgggGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTc > 1:1944886/1‑93 (MQ=255) ggcgggGTAATACGAGAGTGGACGTTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTcc < 2:1059945/93‑1 (MQ=255) gggTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGGTCACCGTACTTTCAACAGGTTAAATCCCCCt > 2:2632284/1‑93 (MQ=37) ggTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCtt > 1:5208854/1‑93 (MQ=255) gaaaTACGAGATGGGACGGCCCCCTCGCCCCCTGGGGGAGAG‑GGTTGGGGTG‑GGGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCttt < 2:3050022/91‑1 (MQ=255) gTAATACGAGAGGGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGGGAG‑GGTTAGGGTGA‑TGGG‑CGTTCACCGTACTTTGTATAGTCTAAATCCCCCttt > 2:1230171/1‑93 (MQ=21) tAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTc > 1:1120303/1‑93 (MQ=255) tAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTc > 1:3759951/1‑93 (MQ=255) tACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTga > 2:5854578/1‑93 (MQ=255) tACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTga > 1:2897278/1‑93 (MQ=255) cGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTgaga > 1:2116590/1‑93 (MQ=255) gagaGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGagag > 1:2542157/1‑93 (MQ=255) gTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGaaa > 2:605964/1‑93 (MQ=255) gTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGaaa > 2:2040394/1‑93 (MQ=255) tGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAAc > 2:5917864/1‑93 (MQ=255) ggACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACa > 2:4699550/1‑93 (MQ=255) gACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACaa > 2:3011577/1‑93 (MQ=255) gcGGCCCCCCCCCCCCGGTGGGGAG‑G‑GGGGGGGGGGGGGGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACaaa < 1:4803379/92‑1 (MQ=255) cGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACaaaa > 2:3818390/1‑93 (MQ=255) gTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAAtt > 2:5184027/1‑93 (MQ=255) gTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAAtt > 2:5428208/1‑93 (MQ=255) gTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAAtt > 1:2824472/1‑93 (MQ=255) tCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTa > 2:554590/1‑93 (MQ=255) tCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTa > 1:3722488/1‑93 (MQ=255) cccccTCGCCCCCTGGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGC‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTa < 2:2160282/92‑1 (MQ=37) ccccTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTaa > 2:3496458/1‑93 (MQ=255) ccTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACg > 2:4780440/1‑93 (MQ=255) ccTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACg > 2:6040561/1‑93 (MQ=255) cTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGc > 1:2906957/1‑93 (MQ=255) cTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGc < 1:4941769/93‑1 (MQ=255) cTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGc > 1:935423/1‑93 (MQ=255) cTCGCCCCCTGGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGc < 1:6276987/93‑1 (MQ=255) tCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCa > 2:1257673/1‑93 (MQ=255) cggCCCCTGTGGGGAGAG‑GGTTGGGGGGGGGGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGc < 2:1863462/91‑1 (MQ=255) cccccccTTGGGG‑GAGAGGTTTGGGGGGGGGGC‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCa < 2:4081540/91‑1 (MQ=255) cGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAg > 1:284333/1‑93 (MQ=255) cccccTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGaa < 1:2067257/93‑1 (MQ=255) cccccTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGaa > 2:5789574/1‑93 (MQ=255) ccccTTGGGGAGAG‑GGTTGGGGTG‑GGGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAt < 2:5131346/93‑1 (MQ=255) ccccTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAt > 1:6128098/1‑93 (MQ=255) cccTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtc < 2:4213992/93‑1 (MQ=255) ccTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtct > 1:4289547/1‑93 (MQ=255) ccTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtct > 2:5127623/1‑93 (MQ=255) cTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtctt > 1:1913377/1‑93 (MQ=255) ttGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTTCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtcttc > 1:1251169/1‑93 (MQ=255) ttGGGGAGAG‑GGTTAGGGTG‑GGGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtcttc < 1:1062507/93‑1 (MQ=255) tgggggAGAG‑GGTGGGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtcttc < 2:1758784/91‑1 (MQ=255) gggggggg‑ggTTGGGGGGGGGGGC‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtcttct < 2:3855230/93‑1 (MQ=255) ggggg‑ggTTGGGGGGGGGGGGCCGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtcttcttc < 1:3627888/89‑1 (MQ=255) gagaG‑GGTTGGGGGGA‑GGGC‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTtctc < 2:808100/93‑1 (MQ=255) gagaG‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑AGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAAtcttcttcta > 1:4093407/1‑92 (MQ=255) gag‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAg > 2:5445881/1‑93 (MQ=255) ag‑GGTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGc > 2:2451382/1‑93 (MQ=255) g‑ggTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGcc > 1:2649743/1‑93 (MQ=255) g‑ggTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGCACTCTCAACAAGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAGAATTAAGGCAGAATCTTCTTCTCAGcc > 2:2435005/1‑93 (MQ=255) ggTTAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCa > 2:3719114/1‑93 (MQ=255) ttAGGGTGA‑GGGC‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCaaa < 1:4247105/93‑1 (MQ=255) tAGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAAt > 2:447135/1‑93 (MQ=255) aGGGTGA‑GGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATc > 1:1516587/1‑93 (MQ=255) gggTGA‑GGGC‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATcc < 1:4942866/93‑1 (MQ=255) ggtgggggg‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCa < 1:2093463/89‑1 (MQ=255) gtgggggg‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAg < 1:6024284/90‑1 (MQ=255) ggggggg‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAgc < 1:3006622/91‑1 (MQ=255) | GGCGACGATCCTTGGGGATAAACCGTTTTATCGGGCGGGGTAATACGAGAGTGGACGGTCCCCTCGCCCCCTTGGGGAGAG‑GGTTAGGGTGAGGGGG‑CGTTCACCGTACTTTCAACAGGTTAACTCCCCCTTTCTGAGAGGAAACAAAATTAACGCAGAATCTTCTTCTCAGCCAAATCCAGC > NC_000913/387828‑388010 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |