Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,743,603 | Δ1 bp | coding (1171/1275 nt) | yiaN → | putative membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,743,603 | 0 | C | . | 99.6% | 1209.4 / ‑2.8 | 260 | coding (1171/1275 nt) | yiaN | putative membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base . (112/147); minor base A (0/1); total (112/148) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 261 total aligned reads displayed.
TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTC > NC_000913/3743515‑3743690 | tATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGc < 1:2206286/93‑1 (MQ=255) tATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGc < 2:1813406/93‑1 (MQ=255) tATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGc < 2:150007/93‑1 (MQ=255) aTCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGCT‑GATGCa < 2:5104041/93‑1 (MQ=255) tCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAg < 1:4364160/93‑1 (MQ=255) cATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGt > 1:5106801/1‑93 (MQ=255) cATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGt < 1:1878886/93‑1 (MQ=255) ttAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCa > 2:2848815/1‑93 (MQ=255) ttAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGCTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCa > 1:5633549/1‑93 (MQ=255) tAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCag < 1:5086780/93‑1 (MQ=255) tAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCag > 1:5757165/1‑93 (MQ=255) aaCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCaga < 2:5559020/93‑1 (MQ=255) aaCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCaga < 1:827357/93‑1 (MQ=255) aCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCagag < 2:2036384/93‑1 (MQ=255) aCTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCagag > 2:5364894/1‑93 (MQ=255) cTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAgg > 1:1002599/1‑93 (MQ=255) gCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCg < 1:4390448/93‑1 (MQ=255) gCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCg < 1:116540/93‑1 (MQ=255) cTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGt > 2:4847930/1‑93 (MQ=255) cTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGt > 2:5931943/1‑93 (MQ=255) tCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGtt < 1:619343/93‑1 (MQ=255) cAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGttt < 2:815493/93‑1 (MQ=255) cAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGttt < 1:2806289/93‑1 (MQ=255) aaTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGtttt > 1:2017582/1‑93 (MQ=255) aaTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGtttt > 2:2502813/1‑93 (MQ=255) aaTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGtttt > 2:1182339/1‑93 (MQ=255) aaTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGtttt < 1:2831593/93‑1 (MQ=255) aTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTc < 2:2988712/93‑1 (MQ=255) aTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTc > 1:3027359/1‑93 (MQ=255) aTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTc > 2:2667513/1‑93 (MQ=255) aTCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTc > 2:4497386/1‑93 (MQ=255) tCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTcc > 2:4674529/1‑93 (MQ=255) cGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTccc < 2:6201800/93‑1 (MQ=255) gCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCtt < 1:991161/93‑1 (MQ=255) ttAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTAc > 1:4062417/1‑93 (MQ=255) tAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACg < 2:1770056/93‑1 (MQ=255) aaTTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGt > 2:1085240/1‑93 (MQ=255) aaTTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGt > 1:2216704/1‑93 (MQ=255) aTTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTc < 1:2394438/93‑1 (MQ=255) ttACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTcc < 2:2174332/93‑1 (MQ=255) ttACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTcc < 1:4993274/93‑1 (MQ=255) tACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCt < 2:5176380/93‑1 (MQ=255) acacCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTg < 2:4977687/93‑1 (MQ=255) cacCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTgg < 2:658479/93‑1 (MQ=255) cacCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTgg < 1:784898/93‑1 (MQ=255) acCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAGATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGt < 1:3385653/93‑1 (MQ=255) acCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGt < 1:453823/93‑1 (MQ=255) cctccTATCGGTAATGTACGTAACGTTATTTCAGGGTTGGCAAAACTCAAATACGAT‑GATACAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGttt < 2:3841219/90‑1 (MQ=255) ccGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGtt > 2:4026738/1‑93 (MQ=255) gCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGtttt > 2:1475420/1‑93 (MQ=255) ccTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTta > 1:4586686/1‑93 (MQ=255) cTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtat < 1:1624982/93‑1 (MQ=255) tATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTtata < 2:724724/93‑1 (MQ=255) aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat < 1:1765036/93‑1 (MQ=255) aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat < 2:3733939/93‑1 (MQ=255) aTCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTatat > 2:5486541/1‑93 (MQ=255) tCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATAtt > 2:1571292/1‑93 (MQ=255) tCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATAtt > 2:2454481/1‑93 (MQ=255) tCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATAtt < 2:2320483/93‑1 (MQ=255) cGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTc < 1:4170738/93‑1 (MQ=255) ggTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCa > 1:4327072/1‑93 (MQ=255) gTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCat > 1:640351/1‑93 (MQ=255) gTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCat > 2:4520158/1‑93 (MQ=255) tAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatt > 1:3489650/1‑93 (MQ=255) tAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCatt < 1:4352312/93‑1 (MQ=255) gTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCAttatta < 2:4238342/93‑1 (MQ=255) tACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAg < 1:3800011/93‑1 (MQ=255) ttAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCg > 1:3668285/1‑93 (MQ=255) ttAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCg > 1:5982091/1‑93 (MQ=255) tAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGt > 2:3150972/1‑93 (MQ=255) tAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGt > 2:3393667/1‑93 (MQ=255) tAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGt > 1:5506202/1‑93 (MQ=255) aaCGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTa < 1:4820825/93‑1 (MQ=255) aaCGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTa > 1:5605655/1‑93 (MQ=255) aCGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTAt < 2:1362557/93‑1 (MQ=255) ttATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTg < 2:1393062/93‑1 (MQ=255) ttATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTg < 1:3975169/93‑1 (MQ=255) tATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGt < 2:2288641/93‑1 (MQ=255) aTTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGtt < 1:2294417/93‑1 (MQ=255) tttCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGttt < 1:5163453/93‑1 (MQ=255) ggggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTAtt > 1:3039089/1‑93 (MQ=255) ggggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTAtt > 2:3454397/1‑93 (MQ=255) gggTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTc < 1:3585821/93‑1 (MQ=255) gTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTccc < 1:3155569/93‑1 (MQ=255) gTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTccc < 1:486982/93‑1 (MQ=255) gTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTccc > 1:235126/1‑93 (MQ=255) gTGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTccc < 1:463302/93‑1 (MQ=255) tGGCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCg < 2:2241304/93‑1 (MQ=255) gCAAAACTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAt > 1:2945949/1‑93 (MQ=255) aaaaCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAtct > 1:3771404/1‑93 (MQ=255) aaaaCTCAAATTCGA‑AGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAtct < 2:5850792/93‑1 (MQ=255) aaaCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAtctc > 2:1418071/1‑93 (MQ=255) aaaCTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGAtctc > 1:3264668/1‑93 (MQ=255) cTCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGAGTTTTCCCTTACGTCCTGGATTTATATTCCTTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtcatc > 2:5257809/1‑93 (MQ=255) tCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtcatca > 2:568413/1‑93 (MQ=255) tCAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCtcatca < 1:1472263/93‑1 (MQ=255) cAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTcatcat < 2:3871411/93‑1 (MQ=255) cAAATTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTcatcat > 1:5414609/1‑93 (MQ=255) aTTCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAtcct > 1:6107550/1‑93 (MQ=255) ttCGAT‑GATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCAtcctc < 2:4089538/93‑1 (MQ=255) | TATCATTAACTGCTCAATCGGCTTAATTACACCGCCTATCGGTAATGTACTTAACGTTATTTCAGGGGTGGCAAAACTCAAATTCGATCGATGCAGTCAGAGGCGTTTTCCCTTACGTCCTGGTTTTATATTCATTATTAGTCGTATTTGTTTTTATTCCCGATCTCATCATCCTC > NC_000913/3743515‑3743690 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |