Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,249,909 | +C | intergenic (+47/‑176) | yjbI → / → ubiC | hypothetical protein/chorismate lyase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,249,905 | 1 | . | C | 99.6% | 753.8 / ‑4.2 | 235 | intergenic (+43/‑180) | yjbI/ubiC | hypothetical protein/chorismate lyase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (121/113); total (122/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
Only 100 of 253 total aligned reads displayed.
TTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATG‑CCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGATTGTTGCGTTTT > NC_000913/4249813‑4249991 | tttttACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATg > 1:239999/1‑93 (MQ=255) ttttACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATG‑c > 1:49193/1‑93 (MQ=255) tttACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATG‑cc > 2:5855598/1‑93 (MQ=255) aCTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATG‑ccccc < 2:1969559/93‑2 (MQ=255) aCTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATG‑ccccc > 2:170523/1‑92 (MQ=255) gAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACgg < 2:2271303/93‑1 (MQ=255) aGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGt > 1:6270445/1‑93 (MQ=255) tGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGc < 1:3807327/93‑1 (MQ=255) tGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCAGCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGc < 1:3868686/93‑1 (MQ=255) gAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTc < 1:742130/93‑1 (MQ=255) gAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTc > 1:3487891/1‑93 (MQ=255) aGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCg > 1:3192697/1‑93 (MQ=255) gCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGc < 2:2474637/93‑1 (MQ=255) gCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGc > 1:5525578/1‑93 (MQ=255) cTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGcc > 2:5755704/1‑93 (MQ=255) cATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAg > 2:296103/1‑93 (MQ=255) cATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGACGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAg < 2:6074265/93‑1 (MQ=255) aTCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCCCCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGc < 1:4488800/93‑1 (MQ=255) tCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCa < 2:1039190/93‑1 (MQ=255) tCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCa > 2:218147/1‑93 (MQ=255) tCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCa < 1:3022632/93‑1 (MQ=255) tCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTAGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCACGCCAGCa < 1:4064536/93‑1 (MQ=255) gTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACg > 1:1935559/1‑93 (MQ=255) tataATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACgg > 1:1988103/1‑93 (MQ=255) tataATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACgg < 2:5623862/93‑1 (MQ=255) ataATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACggg < 2:3351256/93‑1 (MQ=255) ataATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACggg < 2:4548882/93‑1 (MQ=255) taATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGc > 2:4218452/1‑93 (MQ=255) tGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATc > 2:4965150/1‑93 (MQ=255) gAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCg < 2:4635379/93‑1 (MQ=255) ttAAGGGTATTTTAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTCCGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGt < 2:6300124/92‑1 (MQ=255) tAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTa > 1:5901960/1‑93 (MQ=255) gggTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAg < 1:131299/93‑1 (MQ=255) gggTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAg > 1:5371728/1‑93 (MQ=255) gggTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAg > 1:1787591/1‑93 (MQ=255) gggTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAg < 2:5990155/93‑1 (MQ=255) gggTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAg > 1:3263093/1‑93 (MQ=255) gtTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTa > 2:5633064/1‑93 (MQ=255) tttAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTaa > 1:5057067/1‑93 (MQ=255) ttAAGTAAAGGAAAACATCCCCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAg < 1:1526050/93‑1 (MQ=255) ttAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAg < 2:3778449/93‑1 (MQ=255) ttAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAg > 2:3253388/1‑93 (MQ=255) aGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGtt > 1:4328485/1‑93 (MQ=255) aGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGtt < 2:3313909/93‑1 (MQ=255) aGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGtt < 1:776521/93‑1 (MQ=255) aaaGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTCCGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCaa < 1:4087810/93‑1 (MQ=255) aaaGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCaa < 1:5623706/93‑1 (MQ=255) aaaGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCaa > 2:4264795/1‑93 (MQ=255) aaaGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCaa > 1:4681762/1‑93 (MQ=255) aGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACa < 1:419148/93‑1 (MQ=255) ggAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACAt < 1:1023694/93‑1 (MQ=255) gAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCaagctc > 2:2105643/1‑89 (MQ=255) gAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATc < 1:3974349/93‑1 (MQ=255) gAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATc < 2:260280/93‑1 (MQ=255) aaaaCATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCg > 2:4902787/1‑93 (MQ=255) aaaaCATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCg > 2:5440776/1‑93 (MQ=255) aaaCATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGt > 2:1444784/1‑93 (MQ=255) aaaCATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGt < 2:1838063/93‑1 (MQ=255) aaaCATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGt > 2:3914775/1‑93 (MQ=255) aaCATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGtt > 2:3296386/1‑93 (MQ=255) aaCATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGtt > 1:2886828/1‑93 (MQ=255) aCATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGttt > 1:1196821/1‑93 (MQ=255) cATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTCCAACATCGtgtt > 1:1872621/1‑93 (MQ=255) tCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTAc > 2:3507557/1‑93 (MQ=255) tCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTAc > 2:3305627/1‑93 (MQ=255) ccGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCAc > 2:3166665/1‑93 (MQ=255) cGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGCTCAACATCGTTTTACCACt > 2:1074598/1‑93 (MQ=255) cGTTCCTGGCATCCTGGACGGAGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGGTCGACATCGTTTTAcgagt > 1:1306981/1‑89 (MQ=255) gTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACtt > 1:5273880/1‑93 (MQ=255) gTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACtt > 1:3700036/1‑93 (MQ=255) gTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACtt < 1:3465627/93‑1 (MQ=255) ttCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTc > 2:3025546/1‑93 (MQ=255) ttCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTc > 1:559570/1‑93 (MQ=255) tCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCa < 1:66872/93‑1 (MQ=255) tCCTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCa < 2:5372002/93‑1 (MQ=255) cTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATg > 2:5251714/1‑93 (MQ=255) cTGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGCCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGGTTTACCACTTCAtc > 1:3039612/1‑92 (MQ=255) tGGCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGc > 2:5144962/1‑93 (MQ=255) tGGCAACCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGc > 2:4107342/1‑93 (MQ=255) cggCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGc < 1:5856945/92‑1 (MQ=255) ggCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCg < 2:3089815/93‑1 (MQ=255) gCATCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGa > 2:2814485/1‑93 (MQ=255) aTCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAtt > 2:2124536/1‑93 (MQ=255) aTCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAtt > 2:1543875/1‑93 (MQ=255) aTCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAtt > 2:3416646/1‑93 (MQ=255) tCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAttg > 2:5774231/1‑93 (MQ=255) tCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAttg > 1:1042600/1‑93 (MQ=255) tCCTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAttg > 1:217270/1‑93 (MQ=255) ccTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAttgt < 2:2917137/93‑1 (MQ=255) ccTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAttgt < 1:252684/93‑1 (MQ=255) cTGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAttgtt > 1:2105682/1‑93 (MQ=255) tGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAttgttg > 2:3525464/1‑93 (MQ=255) tGGACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGAttgttg < 2:2537987/93‑1 (MQ=255) ggACGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGATTGTTGc < 2:4478054/93‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGATTGTTGCGt < 1:5123845/93‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGATTGTTGCGt < 1:2722645/93‑1 (MQ=255) aCGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGATTGTTGCGt < 2:850767/93‑1 (MQ=255) cGGTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGATTGTTGCGtt < 1:1638238/93‑1 (MQ=255) gTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGATTGTTGCGtttt > 2:4061786/1‑93 (MQ=255) gTGATGCCCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGATTGTTGCGtttt < 1:4831419/93‑1 (MQ=255) | TTTTTACTGCGAGTTGGCGAGCTCATCGTATAATGAATAAGGGTGTTTAAGTAAAGGAAAACATCACCGTTCCTGGCATCCTGGACGGTGATG‑CCCCTACGGTTGCCCTCGCCAGCACGGGCATCGGTAAAGCGTAAGGTTCAACATCGTTTTACCACTTCATGCGATTGTTGCGTTTT > NC_000913/4249813‑4249991 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |