| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,315,907 | +A | coding (436/759 nt) | phnK ← | ATP‑binding component of phosphonate transport |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,315,903 | 1 | . | A | 97.8% | 852.9 / 7.6 | 233 | coding (440/759 nt) | phnK | ATP‑binding component of phosphonate transport |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/3); new base A (121/106); total (124/109) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.68e-01 | |||||||||||
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
CATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑AAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGT > NC_000913/4315811‑4315990 | ccAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaa > 1:5897521/1‑93 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaag < 1:4599257/93‑3 (MQ=255) gCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaag > 2:3576526/1‑91 (MQ=255) ccccGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaag < 2:4478467/92‑3 (MQ=255) ccgcggGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCATACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaaggt < 2:4016947/93‑5 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaaggt > 1:1356786/1‑89 (MQ=255) ccgccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑aaaaaggt < 2:4553020/93‑5 (MQ=255) gccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAggtgg < 2:3852899/93‑1 (MQ=255) gccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAggtgg > 2:2165300/1‑93 (MQ=255) gccgGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAggtgg > 1:2487432/1‑93 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTc < 1:1196694/93‑1 (MQ=255) cggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTACGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTc < 2:2958203/93‑1 (MQ=255) ggtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCg < 2:5717367/93‑1 (MQ=255) gtcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCgg > 2:5495748/1‑93 (MQ=255) tcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGc < 2:4121723/93‑1 (MQ=255) tcggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGc < 2:4265324/93‑1 (MQ=255) cggtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCa > 1:5190046/1‑93 (MQ=255) gtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAgg > 2:72104/1‑93 (MQ=255) gtTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAgg < 2:1776600/93‑1 (MQ=255) ttCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAATGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgt > 2:1453066/1‑93 (MQ=255) ttCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGGGGTCGGCAGgt > 2:4394414/1‑93 (MQ=255) aTCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgt < 2:3760471/93‑1 (MQ=255) aTCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgt < 1:5799148/93‑1 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgtc < 2:860995/93‑1 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgtc > 1:3585640/1‑93 (MQ=255) tCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGgtcgtc < 2:2563403/93‑1 (MQ=255) cATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GTAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGa > 2:328477/1‑93 (MQ=255) tAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATc < 2:9384/93‑1 (MQ=255) tAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATc > 1:4528794/1‑93 (MQ=255) aaaCACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATcc < 2:3191438/93‑1 (MQ=255) acCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGtt > 2:1838499/1‑93 (MQ=255) cAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTgg < 2:5620518/93‑1 (MQ=255) cAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTgg > 1:913801/1‑93 (MQ=255) gCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCg < 1:1741284/93‑1 (MQ=255) ggATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAt < 2:3217556/93‑1 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc > 2:816477/1‑93 (MQ=255) gATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtc > 2:3377592/1‑93 (MQ=255) tGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtctc < 1:4407030/93‑1 (MQ=255) tGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAAtctc < 2:1410564/93‑1 (MQ=255) gCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTcc < 2:2745641/93‑1 (MQ=255) cGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCa < 2:4839293/93‑1 (MQ=255) cGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCa < 1:2335142/93‑1 (MQ=255) tCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCAcc > 2:5942019/1‑93 (MQ=255) tCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCAcc > 1:3441642/1‑93 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc > 2:1139005/1‑93 (MQ=255) aCCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctc < 2:6274325/93‑1 (MQ=255) ccAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACctct < 2:3474166/93‑1 (MQ=255) ggTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTcc > 1:2543116/1‑93 (MQ=255) ggTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTcc > 1:5633417/1‑93 (MQ=255) ggTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTcc > 1:5564038/1‑93 (MQ=255) ggTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTcc > 2:5656523/1‑93 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa < 1:4172658/93‑1 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa > 1:1641103/1‑93 (MQ=255) gTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCa > 1:3340238/1‑93 (MQ=255) ttGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAg > 1:1067447/1‑93 (MQ=255) ttGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAg > 2:1063704/1‑93 (MQ=255) cGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCa > 2:2379680/1‑93 (MQ=255) cGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCa < 1:1977057/93‑1 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCCCCTCTTCCAGCCAc < 1:2862543/93‑1 (MQ=255) gggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCAc > 2:2983157/1‑93 (MQ=255) ggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACt > 1:2236076/1‑93 (MQ=255) ggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACt > 1:4312009/1‑93 (MQ=255) ggCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGGTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACt > 1:5061168/1‑93 (MQ=255) cAATCTGCAAACGCTGCTGCATCCCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTc < 1:3918484/93‑1 (MQ=255) cAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTc > 1:109394/1‑93 (MQ=255) cAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTc < 2:2491755/93‑1 (MQ=255) aaTCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCt < 1:953653/93‑1 (MQ=255) aTCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTg < 2:1294620/93‑1 (MQ=255) tCTGCAACCGCTGCTGCATCCCGCGG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGAAATCCCCCCCTCTCCCAGCCACTTCTgc < 2:4992982/93‑1 (MQ=255) tCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgc > 2:5332427/1‑93 (MQ=255) tCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgc < 1:6109469/93‑1 (MQ=255) tCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgc < 2:2455268/93‑1 (MQ=255) tGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTgcgc > 1:500183/1‑93 (MQ=255) cAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCgg < 2:2841388/93‑1 (MQ=255) cAAACGCGGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCgg < 1:449684/93‑1 (MQ=255) aaaCGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGGCACTTCTGCGCggg > 2:5050203/1‑92 (MQ=255) aCGCTGCTGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTgg < 1:4090771/93‑1 (MQ=255) gctgctGCATACCGCCGAA‑AAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCa < 2:6041036/93‑1 (MQ=255) gctgctGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCa < 2:6178620/93‑1 (MQ=255) gctgctGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCa < 2:5151395/93‑1 (MQ=255) gctgctGCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCa < 2:4072515/93‑1 (MQ=255) ctgctgCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCAc < 1:3958614/93‑1 (MQ=255) ctgctgCATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCAc > 1:2628800/1‑93 (MQ=255) tgctgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACg < 1:6193535/93‑1 (MQ=255) tgctgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACg > 1:3252707/1‑93 (MQ=255) tgctgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCAACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACg > 1:1928581/1‑93 (MQ=255) ctgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGaa < 2:5825377/93‑1 (MQ=255) tgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAat > 2:1580291/1‑93 (MQ=255) tgcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGCGGCACGAat > 1:4923576/1‑93 (MQ=255) gcATGCCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCTATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata < 1:5532919/93‑1 (MQ=255) gcATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAata < 2:2070110/93‑1 (MQ=255) cATACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAatat < 2:1250131/93‑1 (MQ=255) aTACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc > 1:2994039/1‑93 (MQ=255) aTACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc > 1:4645889/1‑93 (MQ=255) aTACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATc < 1:759944/93‑1 (MQ=255) tACCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCg > 2:169869/1‑93 (MQ=255) aCCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGc > 1:1627/1‑93 (MQ=255) aCCGCCG‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGc < 1:1532433/93‑1 (MQ=255) ccgccg‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGcc > 2:4887792/1‑93 (MQ=255) gccg‑GAAAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGt < 2:1636942/93‑1 (MQ=255) | CATCCAGCCCGCCGGTCGGTTCATCCATAAACACCAGCTTCGGATGCGTCACCAGGTTGCGGGCAATCTGCAAACGCTGCTGCATACCGCCG‑G‑AAAAGGTGGTCGGCAGGTCGTCGATCCGGTTGGCGGGAATCTCCACCTCTTCCAGCCACTTCTGCGCGGTGGCACGAATATCGCCGT > NC_000913/4315811‑4315990 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |