| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 216,145 | (C)6→7 | intergenic (+166/+34) | cutF → / ← yaeF | copper homeostasis protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 216,139 | 1 | . | C | 97.2% | 657.7 / 10.5 | 212 | intergenic (+160/+40) | cutF/yaeF | copper homeostasis protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/3); new base C (114/92); total (117/95) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CGTTTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑A‑CCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATAAATCCCAGG > NC_000913/216047‑216226 | tttGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑A‑ccc‑cc < 2:269003/93‑1 (MQ=255) tGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑A‑ccc‑cccc > 2:1361161/1‑92 (MQ=255) tGTAGGCCGAATAAGGCCTTACCGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAGCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑A‑ccc‑cccc < 2:3801770/93‑2 (MQ=18) aGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑A‑ccc‑cccctca < 1:1222102/93‑5 (MQ=255) aGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑A‑ccc‑cccctca < 2:6000270/93‑5 (MQ=255) ccGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATAc > 1:5086193/1‑93 (MQ=255) ccGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATAc > 1:6296433/1‑93 (MQ=255) ccGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATAc < 2:4424075/93‑1 (MQ=255) cGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATAcc > 2:5355549/1‑93 (MQ=255) ggATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCt > 2:6065976/1‑93 (MQ=255) ggATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCt > 1:1547260/1‑93 (MQ=255) gATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCtt < 2:2300351/93‑1 (MQ=255) gATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCtt > 2:3082884/1‑93 (MQ=255) gATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCtt > 1:2354872/1‑93 (MQ=255) aTAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGTGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTa > 1:496494/1‑93 (MQ=255) aTAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTa < 2:1439135/93‑1 (MQ=255) tAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTaa > 2:5606782/1‑93 (MQ=255) tAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTaa < 2:5929805/93‑1 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAg > 2:3640025/1‑93 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAg < 2:4276129/93‑1 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAg > 1:712186/1‑93 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAg < 1:539884/93‑1 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAg < 2:80303/93‑1 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAg < 1:2696581/93‑1 (MQ=255) aaGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAg > 1:2802791/1‑93 (MQ=255) aaGGCGTATACGCCTCATCCGGCAATGGTGCTCATCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAg < 1:1820564/93‑1 (MQ=21) ggCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGc < 1:601077/93‑1 (MQ=255) cGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCgg > 1:5624125/1‑93 (MQ=255) cGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCgg < 2:3416030/93‑1 (MQ=255) tttACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGAt > 2:2012774/1‑93 (MQ=255) tttACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGAt > 1:2761968/1‑93 (MQ=255) ttACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATa > 1:1330642/1‑93 (MQ=255) tACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATaa < 1:3253090/93‑1 (MQ=255) cgccccATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAgg < 1:192080/93‑1 (MQ=255) ccgcATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCa > 2:2974905/1‑93 (MQ=255) ccgcATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCa > 1:4814489/1‑93 (MQ=255) ccgcATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCATAAGGCGGATAACGCa > 2:6211235/1‑93 (MQ=25) cgcATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCAt < 1:2634540/93‑1 (MQ=255) cgcATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCAt < 2:1050518/93‑1 (MQ=255) gcATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCAtt > 2:2876698/1‑93 (MQ=255) gcATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCAtt > 2:3497324/1‑93 (MQ=255) cATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCAttt < 2:1654366/93‑1 (MQ=255) aTCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTa > 1:385458/1‑93 (MQ=255) tCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTAc > 2:2491374/1‑93 (MQ=255) cGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACtt < 2:5316336/93‑1 (MQ=255) cGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACtt > 2:1679337/1‑93 (MQ=255) cGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACtt < 1:1411397/93‑1 (MQ=255) ggCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACttt > 1:5765548/1‑93 (MQ=255) ggCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACttt < 2:687296/93‑1 (MQ=255) gCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATTATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCGTAAGGCTGATAAAGCATTTACTTTa > 2:4614544/1‑93 (MQ=25) gCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTa < 1:4518655/93‑1 (MQ=255) gCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTa < 2:3337821/93‑1 (MQ=255) cAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTAt > 2:3897223/1‑93 (MQ=255) aaTGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATc > 1:1035960/1‑93 (MQ=255) aaTGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATc > 2:4220612/1‑93 (MQ=255) aTGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCa > 1:353202/1‑93 (MQ=255) aTGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCa < 2:541659/93‑1 (MQ=255) ggTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCAcc < 2:584095/93‑1 (MQ=255) gTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCg < 1:5549249/93‑1 (MQ=255) cTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGt < 2:5008782/93‑1 (MQ=255) tCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTc > 1:5256833/1‑93 (MQ=255) cAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCa > 1:3946567/1‑93 (MQ=255) cAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCa > 1:2246852/1‑93 (MQ=255) aaCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCaa > 1:4377901/1‑93 (MQ=255) aaCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCaa > 2:5531483/1‑93 (MQ=255) aCGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCaaa > 1:572675/1‑93 (MQ=255) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAAcc < 2:2542493/93‑1 (MQ=255) cTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACcaa > 2:4765478/1‑93 (MQ=255) tGATGCGACGCTGGCGCGTCTTAGCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATGCCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGGCAAACcaac > 2:5073387/1‑93 (MQ=37) gATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACcaaca < 1:2536842/93‑1 (MQ=255) gATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACcaaca > 1:2026982/1‑93 (MQ=255) gATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACcaaca > 1:4657611/1‑93 (MQ=255) aTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACcaacaa > 1:900125/1‑93 (MQ=255) aTGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCAGGTCAAACcaacaa < 2:1223530/93‑1 (MQ=255) tGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACaaa > 1:4308542/1‑93 (MQ=255) cGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGc > 2:3141559/1‑93 (MQ=255) cGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGAc > 1:3012015/1‑93 (MQ=255) cGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGAc < 2:5714834/93‑1 (MQ=255) cTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGAccc > 1:3597003/1‑93 (MQ=255) tGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCg > 1:4061529/1‑93 (MQ=255) gcgcGTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGcc < 1:4219328/93‑1 (MQ=255) cgTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTg < 1:502765/93‑1 (MQ=255) gTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGa > 2:1875244/1‑93 (MQ=255) gTCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGa > 1:4173199/1‑93 (MQ=255) tCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGat > 1:107869/1‑93 (MQ=255) tCTTATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGat > 1:5957114/1‑93 (MQ=255) ttATCATGCCTACA‑A‑CCCTCCCTCATACCTAAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGatat > 2:1729469/1‑93 (MQ=255) tATCATGCCTACACC‑CCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGAtata < 2:2743826/93‑1 (MQ=255) tATCATGCCTACACC‑CCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGAtata < 1:6833/93‑1 (MQ=255) tATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGAtata > 1:3410498/1‑93 (MQ=255) tATCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGAtata < 1:1721673/93‑1 (MQ=255) aTCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATaa > 2:4757280/1‑93 (MQ=255) tCATGCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATaaa > 1:4698142/1‑93 (MQ=255) gCCTACA‑CCCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATAAATccc < 2:3547484/93‑1 (MQ=255) gCCTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATAAATccc < 1:2138448/93‑1 (MQ=255) ccTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATAAATCCCa < 1:1434073/93‑1 (MQ=255) ccTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATAAATCCCa > 1:5796135/1‑93 (MQ=255) ccTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATAAATCCCa < 1:2857368/93‑1 (MQ=255) ccTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATAAATCCCa < 1:311824/93‑1 (MQ=255) ccTACA‑ACCCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATAAATCCCa < 1:1304562/93‑1 (MQ=255) | CGTTTTTTGTAGGCCGGATAAGGCGTTTACGCCGCATCCGGCAATGGTGCTCAACGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCATGCCTACA‑A‑CCC‑CCCTCATACCTTAAGGCGGATAAGGCATTTACTTTATCACCGGGTCAAACCAACAAAGCGACCCGCCTTGATATAAATCCCAGG > NC_000913/216047‑216226 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |