| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,896,819 | +C | coding (622/657 nt) | ygcU ← | putative oxidoreductase subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,896,818 | 1 | . | C | 99.5% | 675.5 / ‑5.6 | 211 | A208G (GCA→GGA) | ygcU | putative oxidoreductase subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); major base C (124/86); minor base T (1/0); total (125/86) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 | |||||||||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCT > NC_000913/2896726‑2896904 | cAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTG‑cc < 1:784841/93‑2 (MQ=255) cAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTG‑cc > 2:1738589/1‑92 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTG‑ccga < 2:3731440/93‑4 (MQ=255) ggATATAGCCGTAGAAGAGGTTGCTTTCCGGGGTGAATTTAAAGAATTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTG‑ccga > 2:5058673/1‑90 (MQ=255) gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTG‑ccgat > 2:6178179/1‑89 (MQ=255) gATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTG‑ccgat < 2:1628198/93‑5 (MQ=255) tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCgatga > 2:4165669/1‑93 (MQ=255) tataGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCgatga > 2:4087192/1‑93 (MQ=255) taGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCgatgatg > 2:5490189/1‑93 (MQ=255) gCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCgatgatgat < 2:1614221/93‑1 (MQ=255) gCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCgatgatgat < 2:390820/93‑1 (MQ=255) ccGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGatgatgatg > 1:4276873/1‑93 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGAtgt < 1:1512251/93‑1 (MQ=255) cGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGAtgt < 1:242596/93‑1 (MQ=255) gTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGAtgtg < 1:5083350/93‑1 (MQ=255) gTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGAtgtg > 1:4336950/1‑93 (MQ=255) tAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGa > 1:1015829/1‑93 (MQ=255) tAGAAGAGGTTGTTTACCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGa < 2:6308222/93‑1 (MQ=255) agaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGAc > 1:2077369/1‑93 (MQ=255) agaagaGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGAGGATGTGag > 1:1132502/1‑92 (MQ=255) agagGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGaa > 2:1949164/1‑93 (MQ=255) agGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATg < 2:2476556/93‑1 (MQ=255) ggTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGt > 2:5912808/1‑93 (MQ=255) ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTcc > 1:905408/1‑93 (MQ=255) ttgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTcc > 1:6146481/1‑93 (MQ=255) tgttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCg < 1:6226473/93‑1 (MQ=255) gttTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCgg < 1:3966630/93‑1 (MQ=255) gttTTCCGAGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCgg < 2:5126076/93‑1 (MQ=255) ttttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCggg > 1:4679155/1‑93 (MQ=255) ttCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGcc < 1:5326925/93‑1 (MQ=255) tCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCa > 2:3259120/1‑93 (MQ=255) cGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAAGGCACCTTCGTTTC‑CGATGATGATGTGTCGAATGTCCGGGCCAGc < 2:4464002/93‑1 (MQ=255) ggggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc > 1:2215947/1‑93 (MQ=255) ggggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc > 2:4780656/1‑93 (MQ=255) ggggAGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGcc > 1:5658573/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg > 2:6151095/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcg > 2:4023616/1‑93 (MQ=255) ggTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgc > 2:4319000/1‑93 (MQ=255) tGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcgc < 2:2961432/93‑1 (MQ=255) tGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCcgcgc < 1:4685125/93‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc > 2:3174896/1‑93 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc < 1:1438144/93‑1 (MQ=255) aTTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggc < 1:3186346/93‑1 (MQ=255) tttAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCgcggcg > 2:3057542/1‑93 (MQ=255) tAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTg > 1:4081693/1‑93 (MQ=255) tAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTg > 1:2296946/1‑93 (MQ=255) aGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCa < 1:1838300/93‑1 (MQ=255) aTTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACg > 2:1461021/1‑93 (MQ=255) ttttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGt > 1:5743714/1‑93 (MQ=255) tttCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGtt < 2:5832869/93‑1 (MQ=255) tCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGtttt < 2:3427239/93‑1 (MQ=255) cACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGttttt > 1:3136968/1‑93 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 2:3366041/1‑93 (MQ=255) aCTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTa > 2:6055674/1‑93 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa < 2:4789202/93‑1 (MQ=255) cTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTaa < 1:3969403/93‑1 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 2:346836/1‑93 (MQ=255) tGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAAt > 2:5308827/1‑93 (MQ=255) gTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATg < 2:4134875/93‑1 (MQ=255) ttACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGc < 2:4944713/93‑1 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg > 2:5165925/1‑93 (MQ=255) tACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCg > 1:1216193/1‑93 (MQ=255) aCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgt < 2:6049382/93‑1 (MQ=255) aCTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgt < 1:3259900/93‑1 (MQ=255) cTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtg > 2:5627119/1‑93 (MQ=255) ttCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCgtgt > 1:3820913/1‑93 (MQ=255) tCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGtgtg > 2:4901360/1‑93 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc > 1:2950244/1‑93 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc > 1:3515240/1‑93 (MQ=255) aGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGAc > 2:5226565/1‑93 (MQ=255) gTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACg > 1:176242/1‑93 (MQ=255) gTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACg < 1:1625988/93‑1 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg > 2:2172115/1‑93 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg < 1:2322584/93‑1 (MQ=255) tGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACgg < 1:6099889/93‑1 (MQ=255) gATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGt > 2:4414495/1‑93 (MQ=255) atatAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTg > 1:2206687/1‑93 (MQ=255) atatAGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTg > 1:2614159/1‑93 (MQ=255) tataGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGc > 2:3583661/1‑93 (MQ=255) tataGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGc > 1:5624581/1‑93 (MQ=255) tataGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGc > 1:1292232/1‑93 (MQ=255) tataGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGc > 2:1320068/1‑93 (MQ=255) tataGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGAGTGTGACGGTGc > 2:2772741/1‑93 (MQ=255) ataGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGcc > 2:2345600/1‑93 (MQ=255) aGCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCAt > 1:2749921/1‑93 (MQ=255) gCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc < 1:1913610/93‑1 (MQ=255) gCACAATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATc < 1:2997783/93‑1 (MQ=255) acaATGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAg > 2:2268309/1‑93 (MQ=255) aaTGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGcc > 2:2674862/1‑93 (MQ=255) aTGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCa > 2:537439/1‑93 (MQ=255) aTGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCa > 1:1482476/1‑93 (MQ=255) tGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa > 1:3739192/1‑93 (MQ=255) tGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa > 2:4690817/1‑93 (MQ=255) tGCACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCaa < 1:848167/93‑1 (MQ=255) cACCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATa > 2:1523692/1‑93 (MQ=255) aCCTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATAc > 1:6030118/1‑93 (MQ=255) ccTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACt < 1:5179835/93‑1 (MQ=255) ccTTCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACt > 2:1895154/1‑93 (MQ=255) ttCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGc < 2:5988944/93‑1 (MQ=255) tCG‑TTGCCGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCt < 2:1416248/93‑1 (MQ=255) | TCCAGGATATAGCCGTAGAAGAGGTTGTTTTCCGGGGTGAATTTAAAGATTTTCACTGTTACTTCAGTGATATAGCACAATGCACCTTCG‑TTG‑CGATGATGATGTGACGAATGTCCGGGCCAGCCGCGCGGCGTGGCACGTTTTTAATGCGTGTGACGGTGCCATCAGCCAATACTGCT > NC_000913/2896726‑2896904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |