Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,958,258 | 1 | . | C | 70.7% | 347.2 / 163.2 | 157 | intergenic (‑827/‑34) | ppiC/rep | peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C/rep helicase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (27/19); new base C (60/51); total (87/70) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.24e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 201 total aligned reads displayed.
CCGATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CT‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCC > NC_000913/3958166‑3958346 | ccGATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCCCATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t > 2:5470311/1‑93 (MQ=255) ccGATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t > 1:532459/1‑93 (MQ=255) ccGATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t > 1:2289082/1‑93 (MQ=255) cGATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t‑‑c > 2:912489/1‑93 (MQ=255) cGATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t‑‑c < 1:6206404/93‑1 (MQ=255) cGATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t‑‑c > 2:4526575/1‑93 (MQ=255) gATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t‑‑c‑c < 1:3129436/93‑1 (MQ=255) gATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t‑‑c‑c < 1:3419073/93‑1 (MQ=255) aTTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t‑‑c‑cc > 1:1944727/1‑92 (MQ=255) ttCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑t‑‑c‑cc‑c‑c < 2:3222436/93‑1 (MQ=255) tCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑c‑cc‑c‑cc < 1:1517268/93‑1 (MQ=255) tCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑c‑cc‑c‑cc < 2:3397415/93‑1 (MQ=255) tCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑c‑cc‑c‑cc < 2:5152281/93‑1 (MQ=255) cGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑cc‑c‑ccc > 1:3908619/1‑93 (MQ=255) gTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑cc‑c‑ccccc > 2:4730720/1‑93 (MQ=255) tcttctCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑cc‑c‑cccccc < 2:5059227/93‑2 (MQ=255) cttctCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑cc‑c‑ccccccg > 1:866272/1‑91 (MQ=255) ttctCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑cc‑c‑ccccccgt > 2:5494984/1‑90 (MQ=255) tctctctGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑g < 2:5461188/93‑1 (MQ=255) tctctctGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑Ga > 1:4568525/1‑93 (MQ=255) tctctGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑Gaa < 1:2366751/93‑1 (MQ=255) tctctGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAg > 2:6033048/1‑93 (MQ=255) ctctGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAg > 1:780701/1‑93 (MQ=255) ctctGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAg < 2:5180754/93‑1 (MQ=255) tctGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGa < 2:2286477/93‑1 (MQ=255) tctGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGa > 2:1054372/1‑93 (MQ=255) tctGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑CACC‑C‑CCCCCGGTC‑GAAGa > 2:1028135/1‑93 (MQ=255) tGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGAtt > 1:569238/1‑93 (MQ=255) tGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGAtt > 1:508031/1‑93 (MQ=255) gATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGa < 1:5813985/93‑1 (MQ=255) atatAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGACTTACACGCGGTCACATACAAATGTGATTTTACTACAAA‑C‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGa < 2:2096987/90‑1 (MQ=255) ttAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGc < 1:4460096/93‑1 (MQ=255) ttAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCCTTC‑GAAGATTGAga > 2:1924796/1‑92 (MQ=255) tAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAgga > 1:4938165/1‑91 (MQ=255) aaCATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAAt < 2:296505/93‑1 (MQ=255) aaCATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAAt > 1:1884909/1‑93 (MQ=255) aaCATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCCTTC‑GCAGATTGTGCaca > 1:2233134/1‑91 (MQ=255) aCATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATa > 2:1975649/1‑93 (MQ=255) cATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATac < 2:5343172/93‑1 (MQ=255) cATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATaa > 2:2008983/1‑92 (MQ=255) aTCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATaca > 1:1652218/1‑93 (MQ=255) aTCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATacac > 2:4689968/1‑93 (MQ=255) tCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGCTTGGGAAATaaac > 2:394526/1‑93 (MQ=255) tCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATacac < 1:3734966/93‑1 (MQ=255) ccGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACAcc < 2:4651119/93‑1 (MQ=255) ccGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACAcc < 1:1426890/93‑1 (MQ=255) ccGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCt < 1:3480332/93‑1 (MQ=255) cGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTa < 2:865186/93‑1 (MQ=255) gCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCtt > 2:4942509/1‑92 (MQ=255) gCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTAt > 1:4219998/1‑93 (MQ=255) ccAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTa < 2:3698042/92‑1 (MQ=255) cAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTAt < 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ggTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑CTCCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTaaa > 1:3523298/1‑93 (MQ=255) gTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAAc < 2:1672674/93‑1 (MQ=255) gTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAAc > 1:1000689/1‑93 (MQ=255) ttAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTGC‑GAATGTTTAGCACTACACCTCTGCGGCTAAAcc > 2:2488272/1‑93 (MQ=255) ttAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAAccc < 2:1620070/93‑1 (MQ=255) gtAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TCCC‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAAc < 1:180257/92‑1 (MQ=255) cTTACACGTGGTCACATTCTAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGACCAAAAAACCAATGCGTCTAAACCCCCGCca > 2:6111400/1‑93 (MQ=255) ttACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCcaac > 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gTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCccacaaa‑aaaaag > 1:4651800/1‑89 (MQ=255) tCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCCGCCAACAAC‑AAACTGt > 1:1206886/1‑93 (MQ=255) cacaTTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGt < 1:2736851/93‑1 (MQ=255) caTTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATTCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTgccc > 1:4770735/1‑90 (MQ=255) caTTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGa > 1:5114309/1‑93 (MQ=255) ttaaaaTGCAATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGaa < 2:3969260/90‑1 (MQ=255) aaTGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCCTTC‑CAAGGCTTCGCAATACCCCTATACCGCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AATCTGGCGAATTCg > 2:6005001/1‑93 (MQ=255) aTGCGATTGTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGt < 1:5853371/93‑1 (MQ=255) aTGCGATTCTGCTAC‑AACC‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGt < 2:4577520/93‑1 (MQ=255) aTGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTCAGAAAAACACCTTGGGGTTTAAACCCCGGCC‑ACAACAAAGCTGCCGAATTCGt > 2:1857355/1‑93 (MQ=255) aTGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCATTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGt > 1:2830557/1‑93 (MQ=255) tGCGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGtt < 2:2859425/93‑1 (MQ=255) gCGATTCTGCTAC‑AACC‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTa < 2:3531313/93‑1 (MQ=255) gCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTAc < 1:6103262/93‑1 (MQ=255) cGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTAc > 1:930036/1‑93 (MQ=255) cGATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTAc < 1:3151731/93‑1 (MQ=255) gATTCTGCTAC‑AACC‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTAcc < 2:1375154/93‑1 (MQ=255) gATTCTGCTAC‑AACC‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTAcc < 1:5403388/93‑1 (MQ=255) gATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGTTTGAGCAAAACACCAATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTTTCGAATTGGTTaac > 2:4876620/1‑91 (MQ=255) gATTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTAcc < 1:1059755/93‑1 (MQ=255) aTTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTACCg < 2:3181492/93‑1 (MQ=255) aTTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTACCg < 2:1767840/93‑1 (MQ=255) aTTCTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTACCg > 1:2116777/1‑93 (MQ=255) ttCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTACCGGc > 1:3348598/1‑93 (MQ=255) cTGCTAC‑AA‑TC‑C‑CC‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTACCGGcc > 1:1919533/1‑93 (MQ=255) cTAC‑AA‑T‑‑C‑CCCC‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAAAAAC‑CAGCTGTCGAATTTGTTACCCGccccc > 1:2560929/1‑92 (MQ=255) | CCGATTTCGGTCTTCTCTCTCTGATTTAAACATCCGCAGCCAACCGGTTAGCGGCTTACACGCGGTCACATTCAAATGCGATTCTGCTAC‑AA‑T‑‑C‑CT‑C‑CCCCCGTTC‑GAAGATTGAGCAATACACCTATGCGTCTAAACCCCGGCCAACAAC‑AAGCTGTCGAATTCGTTACCGGCCCCTGCC > NC_000913/3958166‑3958346 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |