Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 3,991,539 | T→C | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) |
cyaY ← b3808 → |
hypothetical protein hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,991,539 | 0 | T | C | 100.0% | 869.1 / NA | 263 | N45S (AAT→AGT) I26T (ATT→ACT) | cyaY b3808 | hypothetical protein hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (127/136); total (127/136) |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
CCTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCATTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAGTCGATATCGCTGTCGCCATCCCAGTCGTCCAGGCGTTCTTCAATGGTC > NC_000913/3991449‑3991628 | ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc < 1:1003007/93‑1 (MQ=255) ccTTTCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtc < 2:3212708/93‑1 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 1:1280618/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc > 2:3600750/1‑93 (MQ=255) tttCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGCTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACtctc < 2:155849/93‑1 (MQ=255) tCAGGTCAAAATGGTAGCCGCCCTGTTTGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCaa < 1:1415711/93‑1 (MQ=255) 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ttttGGTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGt < 2:4626317/92‑1 (MQ=255) ggTTGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAt > 2:1723075/1‑93 (MQ=255) ttcccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 2:3461640/90‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCATACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGAttt < 2:2924250/93‑1 (MQ=255) tcccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTc < 2:4793902/91‑1 (MQ=255) ccagccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGc > 2:209168/1‑93 (MQ=255) agccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGATTTCGCAg < 1:1803173/93‑1 (MQ=255) gccaTACCTGGTGCAGCGGCTCCTGGCGGTTGATAATGATTTTGCTGCCACTCTCAAAGGTAATGGTCAGTACGCCGCCGTTGACTTCGCAGt < 2:6117908/93‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |