| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 528,636 | T→C | intergenic (+282/+233) | b0501 → / ← b0502 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 528,636 | 0 | T | C | 99.6% | 851.1 / ‑5.7 | 264 | intergenic (+282/+233) | b0501/b0502 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (127/136); total (128/136) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
TCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGTGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCATTAG > NC_000913/528546‑528725 | tCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACgcgt < 2:3307845/93‑1 (MQ=255) cAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGtt < 1:2642173/93‑1 (MQ=255) agagagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGttt < 1:3932887/93‑1 (MQ=255) gagagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTa > 2:4212770/1‑93 (MQ=255) gagagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTa < 1:2813923/93‑1 (MQ=255) agagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTaa < 2:1428430/93‑1 (MQ=255) gagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAt < 2:1828435/93‑1 (MQ=255) gagTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAt < 1:5494164/93‑1 (MQ=255) agTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtg < 1:897082/93‑1 (MQ=255) agTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtg < 2:1697208/93‑1 (MQ=255) gTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtgt < 1:4387379/93‑1 (MQ=255) tttACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAAtgtg < 2:2102134/93‑1 (MQ=255) aCATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGt > 2:4151828/1‑93 (MQ=255) cATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTc < 2:4322613/93‑1 (MQ=255) tAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTccc < 2:5313945/93‑1 (MQ=255) tAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTccc > 1:1383958/1‑93 (MQ=255) gAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTa > 1:5607327/1‑93 (MQ=255) gAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTa < 1:1515714/93‑1 (MQ=255) aaTTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTAt < 1:783801/93‑1 (MQ=255) aaTTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTAt < 2:3499053/93‑1 (MQ=255) ttGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCt > 2:1561120/1‑93 (MQ=255) ttGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCt > 1:1016597/1‑93 (MQ=255) tGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTg > 1:23494/1‑93 (MQ=255) tGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTg < 1:4935371/93‑1 (MQ=255) tGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTg > 2:5517770/1‑93 (MQ=255) tGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTg < 2:2741333/93‑1 (MQ=255) gCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGa > 2:1061452/1‑93 (MQ=255) gCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGa < 2:3757398/93‑1 (MQ=255) aCTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaa > 1:5718481/1‑93 (MQ=255) aCTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGaaa > 2:2543552/1‑93 (MQ=255) tGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaat > 1:4466988/1‑93 (MQ=255) tGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaat > 2:3172066/1‑93 (MQ=255) tGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaat > 1:1551643/1‑93 (MQ=255) tGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaat > 2:3980057/1‑93 (MQ=255) ggTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAaaata > 2:3907131/1‑93 (MQ=255) tttACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAataaataa > 1:6229190/1‑93 (MQ=255) ttACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAaataat < 2:3109716/93‑1 (MQ=255) ttACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAaataat < 2:1458361/93‑1 (MQ=255) tACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATc > 1:4426814/1‑93 (MQ=255) aCGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATcc < 2:3886181/93‑1 (MQ=255) cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt > 2:1511287/1‑93 (MQ=255) cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt < 1:1731452/93‑1 (MQ=255) cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt < 1:5375373/93‑1 (MQ=255) cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt < 1:3405873/93‑1 (MQ=255) cGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTGAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCt < 2:5863207/93‑1 (MQ=255) gATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCtt < 2:1012870/93‑1 (MQ=255) atatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTc < 1:3837/93‑1 (MQ=255) tatCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTcc < 2:1090945/93‑1 (MQ=255) atCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCg < 1:4165321/93‑1 (MQ=255) tCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCgg > 2:4857035/1‑93 (MQ=255) tCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCgg > 2:899551/1‑93 (MQ=255) tCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCgg > 2:3544826/1‑93 (MQ=255) tGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGAt > 1:194638/1‑93 (MQ=255) tGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGAt > 2:4292904/1‑93 (MQ=255) aCATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTa > 1:50676/1‑93 (MQ=255) aCATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTa > 2:2916849/1‑93 (MQ=255) cATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaa > 2:6189384/1‑93 (MQ=255) cATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaa > 2:3070138/1‑93 (MQ=255) ttGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTaaaa > 2:6082418/1‑93 (MQ=255) tgtgTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaat < 2:1303852/93‑1 (MQ=255) gtgtAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaata > 1:2098313/1‑93 (MQ=255) gtgtAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaata > 2:5658006/1‑93 (MQ=255) tgtAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaataa > 1:1241867/1‑93 (MQ=255) gtAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAaaataaa < 1:4884655/93‑1 (MQ=255) aCATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCtt < 1:3883090/93‑1 (MQ=255) atTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCg > 1:329400/1‑93 (MQ=255) ttCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCgg > 2:508085/1‑93 (MQ=255) ttCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCgg < 1:3134929/93‑1 (MQ=255) gcaaTGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaa < 1:2269888/90‑1 (MQ=255) gCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCgggcag > 2:4991937/1‑90 (MQ=255) gCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaa < 1:662971/93‑1 (MQ=255) gCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaa < 1:2028709/93‑1 (MQ=255) gCCATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaa < 2:1572409/93‑1 (MQ=255) cATGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaaga > 2:364403/1‑93 (MQ=255) aTGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaagaa > 2:2130390/1‑93 (MQ=255) aTGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaagaa < 1:5812174/93‑1 (MQ=255) aTGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaagaa > 1:2566431/1‑93 (MQ=255) aTGCATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGgaaagaa < 1:6037563/93‑1 (MQ=255) cATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAaagaaaga < 1:3001410/93‑1 (MQ=255) cATTAATTAAAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAaagaaaga < 1:6192500/93‑1 (MQ=255) ttaattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTTTTCCCGGGAAAGAAAGAgg > 2:5406464/1‑93 (MQ=255) ttaattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAgg > 1:5243504/1‑93 (MQ=255) ttaattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAgg < 1:4114018/93‑1 (MQ=255) taattaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGa < 2:2418611/93‑1 (MQ=255) ttaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAAt < 2:6245433/93‑1 (MQ=255) ttaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAAt > 2:795381/1‑93 (MQ=255) ttaaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAAt > 1:4091242/1‑93 (MQ=255) taaAATGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATa > 1:5970604/1‑93 (MQ=255) aaaaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATaa > 1:3335408/1‑93 (MQ=255) aaaaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATaa < 1:3730741/93‑1 (MQ=255) aaaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATaaa < 1:4287539/93‑1 (MQ=255) aaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAAc < 1:5899291/93‑1 (MQ=255) aaTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAAc < 2:2793381/93‑1 (MQ=255) aTGTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAAcc < 2:5999848/93‑1 (MQ=255) gTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAt < 1:3503146/93‑1 (MQ=255) gTTACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAt > 1:4766201/1‑93 (MQ=255) ttACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAtt > 1:4015499/1‑93 (MQ=255) ttACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAtt < 1:84094/93‑1 (MQ=255) ttACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAtt > 2:2477110/1‑93 (MQ=255) ttACGCGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCAtt > 1:1982913/1‑93 (MQ=255) | TCAGAGAGTTTACATAGAATTGCACTGGTCTTTTACGATATCTGACATTGTGTAATACATATTCAGCCATGCATTAATTAAAATGTTACGTGTTTAATGTGAGTCCCTATCTGAAAATAAATAATCCTTCCGGATTAAAATAAATTCTTGCCGGGAAAGAAAGAGGAAATAAACCATTAG > NC_000913/528546‑528725 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |