BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	1,479,655	T→C	C241C (TGT→TGC)	ynbD →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	1,479,655	0	T	C	100.0%	632.1 / NA	194	C241C (TGT→TGC)	ynbD	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (96/98); total (96/98)

Only 100 of 195 total aligned reads displayed.

AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479565‑1479744

aGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTg                                                                                         <  1:6167493/93‑1 (MQ=255)

    cTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCa                                                                                     >  1:30162/1‑93 (MQ=255)

    cTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCa                                                                                     <  1:1713072/93‑1 (MQ=255)

    cTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCa                                                                                     <  1:745030/93‑1 (MQ=255)

      gCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGt                                                                                   <  2:2309117/93‑1 (MQ=255)

       cccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCGGGCCAGta                                                                                  <  2:3843962/93‑1 (MQ=255)

        ccTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtat                                                                                 <  2:6213089/93‑1 (MQ=255)

         cTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatt                                                                                <  1:1893657/93‑1 (MQ=255)

          tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               <  1:502283/93‑1 (MQ=255)

          tATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtatta                                                                               >  2:1154689/1‑93 (MQ=255)

           aTGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat                                                                              <  1:3146929/93‑1 (MQ=255)

           aTGCCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGCGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGtattat                                                                              >  1:1250416/1‑93 (MQ=255)

              tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc                                                                           >  2:2373860/1‑93 (MQ=255)

              tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc                                                                           >  2:2843075/1‑93 (MQ=255)

              tCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGc                                                                           >  2:3565949/1‑93 (MQ=255)

               cGTAGTCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCt                                                                          <  1:3308031/93‑1 (MQ=255)

                gTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCtc                                                                         >  1:4278309/1‑92 (MQ=255)

                gTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTa                                                                         >  2:3237072/1‑93 (MQ=255)

                 tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        >  2:1437564/1‑93 (MQ=255)

                 tAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTAc                                                                        >  1:1482401/1‑93 (MQ=255)

                   ggCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTc                                                                      >  1:3581745/1‑93 (MQ=255)

                     cgcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCAt                                                                    <  1:2246565/93‑1 (MQ=255)

                     cgcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCAt                                                                    <  1:5546904/93‑1 (MQ=255)

                      gcgGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGGTTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATa                                                                   >  1:4550681/1‑93 (MQ=255)

                       ggggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATaa                                                                  <  2:5879942/92‑1 (MQ=255)

                        gggCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAAt                                                                 >  2:86367/1‑93 (MQ=255)

                          gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg                                                               <  1:5872744/93‑1 (MQ=255)

                          gCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTg                                                               <  2:3882627/93‑1 (MQ=255)

                           gtCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTgg                                                              <  1:1371910/92‑1 (MQ=255)

                           cTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTgg                                                              <  1:5399770/93‑1 (MQ=255)

                            tCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGc                                                             >  1:1541935/1‑93 (MQ=255)

                            tCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGc                                                             <  1:4759759/93‑1 (MQ=255)

                              gTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCg                                                           >  2:4254044/1‑93 (MQ=255)

                               tGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGt                                                          <  1:5161628/93‑1 (MQ=255)

                               tGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGt                                                          <  2:1126453/93‑1 (MQ=255)

                                 cATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg                                                        >  2:337812/1‑93 (MQ=255)

                                 cATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTgg                                                        >  2:3168043/1‑93 (MQ=255)

                                  aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       <  2:1356148/93‑1 (MQ=255)

                                  aTTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTggg                                                       >  1:2499995/1‑93 (MQ=255)

                                     gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    >  2:4423656/1‑93 (MQ=255)

                                     gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    <  2:2561413/93‑1 (MQ=255)

                                     gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    <  2:6048075/93‑1 (MQ=255)

                                     gTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTAc                                                    >  2:2649856/1‑93 (MQ=255)

                                      tATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACg                                                   >  2:1217012/1‑93 (MQ=255)

                                      tATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACg                                                   >  2:278039/1‑93 (MQ=255)

                                        ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt                                                 <  1:4929759/93‑1 (MQ=255)

                                        ttGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGt                                                 >  1:764918/1‑93 (MQ=255)

                                         tGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTg                                                <  2:2413413/93‑1 (MQ=255)

                                           aTGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTggg                                              >  1:5492392/1‑93 (MQ=255)

                                             ggAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCt                                            <  1:3741258/93‑1 (MQ=255)

                                              gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt                                           >  1:2626955/1‑93 (MQ=255)

                                              gAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCtt                                           <  2:1099917/93‑1 (MQ=255)

                                               aGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTg                                          >  1:1914195/1‑93 (MQ=255)

                                                gCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTgg                                         >  1:1069117/1‑93 (MQ=255)

                                                   aaTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcgc                                      >  1:2781395/1‑93 (MQ=255)

                                                   aaTGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGgcgc                                      >  2:3994942/1‑93 (MQ=255)

                                                    atgatgatgATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGcgcg                                     >  1:3316558/1‑93 (MQ=255)

                                                      gatgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGAt                                   <  1:2442991/93‑1 (MQ=255)

                                                       atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa                                  >  1:71123/1‑93 (MQ=255)

                                                       atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa                                  >  1:4128968/1‑93 (MQ=255)

                                                       atgatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATa                                  >  2:187667/1‑93 (MQ=255)

                                                         gatgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaac                                >  2:2043422/1‑93 (MQ=255)

                                                          atgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaaca                               >  1:2584699/1‑93 (MQ=255)

                                                          atgatTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATaaca                               <  1:3118838/93‑1 (MQ=255)

                                                             atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca                            >  1:816961/1‑93 (MQ=255)

                                                             atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca                            >  1:3520946/1‑93 (MQ=255)

                                                             atTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAacaaca                            <  2:329773/93‑1 (MQ=255)

                                                              ttgaGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGCCTTGGCGCGATAACAACAg                           <  2:4177512/90‑1 (MQ=255)

                                                              ttCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAg                           <  2:6089674/93‑1 (MQ=255)

                                                               tCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAgg                          >  2:4053657/1‑93 (MQ=255)

                                                                 aGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGa                        <  2:715361/93‑1 (MQ=255)

                                                                  gTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaa                       >  1:1822986/1‑93 (MQ=255)

                                                                  gTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaa                       <  1:2369430/93‑1 (MQ=255)

                                                                   ttATGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGaaa                      <  2:5786189/93‑1 (MQ=255)

                                                                     aTGGTGGTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGa                    <  2:4774962/93‑1 (MQ=255)

                                                                      tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt                   <  1:2944841/93‑1 (MQ=255)

                                                                      tggtggTCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGAt                   <  2:5118885/93‑1 (MQ=255)

                                                                       ggtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATa                  <  2:5717543/93‑1 (MQ=255)

                                                                        gtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAg                 <  2:2683882/93‑1 (MQ=255)

                                                                        gtggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAg                 <  1:3463602/93‑1 (MQ=255)

                                                                         tggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGt                <  2:1456318/93‑1 (MQ=255)

                                                                          ggtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTc               >  1:4480188/1‑93 (MQ=255)

                                                                           gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa              <  2:4321016/93‑1 (MQ=255)

                                                                           gtCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCa              >  2:5053623/1‑93 (MQ=255)

                                                                            tCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAg             >  1:567310/1‑93 (MQ=255)

                                                                            tCAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAg             >  2:154260/1‑93 (MQ=255)

                                                                             cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg            <  2:1516296/93‑1 (MQ=255)

                                                                             cAGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgg            <  1:685338/93‑1 (MQ=255)

                                                                              aGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAggg           >  1:5989837/1‑93 (MQ=255)

                                                                              aGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAggg           >  1:4002395/1‑93 (MQ=255)

                                                                              aGTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAggg           <  1:834143/93‑1 (MQ=255)

                                                                               gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg          >  2:4650719/1‑93 (MQ=255)

                                                                               gTCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAgggg          <  1:3844147/93‑1 (MQ=255)

                                                                                tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa         <  1:4380090/93‑1 (MQ=255)

                                                                                tCTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGa         >  2:3772381/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 cTGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaa        >  1:3783641/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  tGGTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGaaa       >  1:5496441/1‑93 (MQ=255)

                                                                                    gTTATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACt     >  2:6109933/1‑93 (MQ=255)

                                                                                     ttATGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTa    >  1:2015607/1‑93 (MQ=255)

                                                                                       aTGCTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTAcc  >  2:5644514/1‑93 (MQ=255)

AGCACTGCCCTATGTCGTAGGCGCGGGCTCGTGCATTGTATTGATGGAGCTAATGATGATGATTCAGTTATGGTGGTCAGTCTGGTTATGTTGGCCAGTATTATCGCTACTCATAATTGGCCGTGGGTACGGTGGGCTTGGCGCGATAACAACAGGGAAAGATAGTCAGGGGAAACTACC  >  NC_000913/1479565‑1479744

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 23 ≤` `ATCG/ATCG` `< 30 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`