| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,312,469 | C→T | A321V (GCG→GTG) | yojN → | putative 2‑component sensor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,312,469 | 0 | C | T | 98.9% | 671.3 / NA | 184 | A321V (GCG→GTG) | yojN | putative 2‑component sensor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (98/84); minor base G (2/0); total (100/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
GCCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTGC > NC_000913/2312379‑2312558 | gcCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTTCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggggc > 1:2184888/1‑93 (MQ=255)gcCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgc > 2:3157458/1‑93 (MQ=255) cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg < 1:6153027/93‑1 (MQ=255) cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg > 1:5304/1‑93 (MQ=255) cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg > 2:1357297/1‑93 (MQ=255) cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg > 2:5260033/1‑93 (MQ=255) cTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctg < 1:3109037/93‑1 (MQ=255) tGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTtgctggtgctgg < 2:1647260/93‑1 (MQ=255) ggTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctggc < 1:2091700/93‑1 (MQ=255) ggTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTgctggtgctggc < 1:3214680/93‑1 (MQ=255) tGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTa > 2:2528339/1‑93 (MQ=255) ggCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAt > 2:1567881/1‑93 (MQ=255) gaaGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCTGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAtt > 2:3296549/3‑93 (MQ=255) gCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAtt > 2:1247579/1‑93 (MQ=255) cAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAttt < 2:2706746/93‑1 (MQ=255) cAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTAttt > 1:6160345/1‑93 (MQ=255) aGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTg > 2:1701556/1‑93 (MQ=255) aGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTg > 1:5680908/1‑93 (MQ=255) aGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGNTTGCTGGTGCTGGCGTTATNTg > 1:4382849/1‑93 (MQ=255) gTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGc < 2:1199568/93‑1 (MQ=255) ttCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCt > 1:3915866/1‑93 (MQ=255) tCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCta > 2:4036931/1‑93 (MQ=255) tCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCta < 2:3691172/93‑1 (MQ=255) ccTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTCGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCtat < 1:6061626/93‑1 (MQ=255) cTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCtata < 1:3431481/93‑1 (MQ=255) ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc < 1:3020526/93‑1 (MQ=255) ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc > 1:2444957/1‑93 (MQ=255) ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc < 2:4280738/93‑1 (MQ=255) ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc < 1:1283/93‑1 (MQ=255) ttATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATAc > 2:2843293/1‑93 (MQ=255) aTGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACca < 1:2756379/93‑1 (MQ=255) tGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACcac < 2:730581/93‑1 (MQ=255) tGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACcac > 1:2217984/1‑93 (MQ=255) ggCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACcaca < 2:1001571/93‑1 (MQ=255) gCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACAt < 2:2890019/93‑1 (MQ=255) aCCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTc > 1:1909338/1‑93 (MQ=255) ccTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTcc > 2:2203401/1‑93 (MQ=255) cTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCg > 1:4507970/1‑93 (MQ=255) cTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCg > 1:3750041/1‑93 (MQ=255) ttATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGc < 1:511011/93‑1 (MQ=255) ttATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGc > 1:2949771/1‑93 (MQ=255) tATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGcc < 2:279226/93‑1 (MQ=255) tATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGcc > 2:473578/1‑93 (MQ=255) tATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGcc > 2:6237868/1‑93 (MQ=255) aTTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCa > 2:4124105/1‑93 (MQ=255) aTTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCa > 2:837475/1‑93 (MQ=255) ttGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGccct > 1:3257073/1‑91 (MQ=255) ttGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAt > 1:5288926/1‑93 (MQ=255) ttGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAt < 1:1806856/93‑1 (MQ=255) gCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAttt < 2:6151087/93‑1 (MQ=255) gCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAttt > 2:1068999/1‑93 (MQ=255) gCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCAttt < 1:3160965/93‑1 (MQ=255) cTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTtc < 2:3569236/93‑1 (MQ=255) ggATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTtctc > 2:2331029/1‑93 (MQ=255) ggATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTtctc < 1:2569817/93‑1 (MQ=255) gATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTcc < 1:1029626/93‑1 (MQ=255) gATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTcc < 1:5558886/93‑1 (MQ=255) gATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTcc < 1:5455049/93‑1 (MQ=255) gATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTcc < 1:2287162/93‑1 (MQ=255) aTACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCa < 1:2579609/93‑1 (MQ=255) tACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAg < 1:5633485/93‑1 (MQ=255) tACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAg > 2:3505675/1‑93 (MQ=255) tGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCa < 1:4229446/93‑1 (MQ=255) aaaaCATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTa > 1:4626131/1‑93 (MQ=255) aaaCATTCTGCTGCCACTGCTGCTGCACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTAc > 2:5612556/1‑93 (MQ=255) aaaCATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTAc < 1:608489/93‑1 (MQ=255) aCATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGGTTGCTGGGGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAg > 2:4967053/1‑93 (MQ=255) cATTTTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa < 2:1877045/93‑1 (MQ=255) cATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa > 1:5943945/1‑93 (MQ=255) cATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGa < 1:5201365/93‑1 (MQ=255) tCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGaaaa < 1:416691/93‑1 (MQ=255) tCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGaaaa < 2:4427322/93‑1 (MQ=255) tgcCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcc < 1:3796928/93‑1 (MQ=255) gcCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTccc > 1:1619722/1‑93 (MQ=255) ccACTTCTGCTGAACATGGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcccc < 2:2263039/93‑1 (MQ=255) ccACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcccc < 2:5845200/93‑1 (MQ=255) ccACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcccc < 1:757241/93‑1 (MQ=255) ccACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTcccc < 1:5276227/93‑1 (MQ=255) aCTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAg > 1:2608147/1‑93 (MQ=255) aCTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAg > 1:3311047/1‑93 (MQ=255) tgctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCa < 1:4550370/93‑1 (MQ=255) tgctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCa < 2:5423963/93‑1 (MQ=255) gctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAc < 2:5223536/93‑1 (MQ=255) ctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcg > 2:5925574/1‑93 (MQ=255) ctgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcg < 2:5364148/93‑1 (MQ=255) tgctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcgg < 2:5767284/93‑1 (MQ=255) tctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTATCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcggc < 2:2981392/92‑1 (MQ=255) gctgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcggc < 2:2475827/93‑1 (MQ=255) tgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTTCCCAGCAcggcgg > 2:4353008/1‑93 (MQ=255) tgAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCAcggcgg > 1:1457390/1‑93 (MQ=255) gAACATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGt > 2:4002582/1‑93 (MQ=255) aCATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCa > 1:4031812/1‑93 (MQ=255) aCATCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCa > 2:5730070/1‑93 (MQ=255) aTCGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAAt > 1:3627407/1‑93 (MQ=255) cGGTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATaa < 2:1962406/93‑1 (MQ=255) cGGTTTGCGGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATaa < 2:3220519/93‑1 (MQ=255) ggTTTGCTGGTGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAAc < 1:1228448/93‑1 (MQ=255) gTTTGCTGGGGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACg > 2:4480699/1‑93 (MQ=255) tgctggtgctggCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAAt < 2:1829373/93‑1 (MQ=255) tggtgctggcgTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTgc > 1:5766097/1‑93 (MQ=255) | GCCTGGTCTGGCAGGTTCCTTATGGCACCTTATTGCTGGATACGTTGCAAAACATTCTGCTGCCACTGCTGCTGAACATCGGTTTGCTGGCGCTGGCGTTATTTGGCTATACCACATTCCGCCATTTCTCCAGCCGCAGTACAGAAAACGTCCCCAGCACGGCGGTCAATAACGAATTGC > NC_000913/2312379‑2312558 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |