| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,559,003 | G→A | intergenic (+85/‑385) | b2443 → / → b2444 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,559,003 | 0 | G | A | 99.5% | 706.7 / NA | 195 | intergenic (+85/‑385) | b2443/b2444 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/0); new base A (101/93); total (102/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 196 total aligned reads displayed.
AAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGG > NC_000913/2558913‑2559092 | aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATc > 1:1864975/1‑93 (MQ=255)aaaTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATc < 1:2187351/93‑1 (MQ=255) aTAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaa < 2:5262870/93‑1 (MQ=255) aaCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTCACTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCaaaa > 2:2561147/1‑93 (MQ=255) aCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAg < 1:5913366/93‑1 (MQ=255) aCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAg < 2:3756689/93‑1 (MQ=255) aCGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAg > 2:3307919/1‑93 (MQ=255) cGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGt > 1:6254049/1‑93 (MQ=255) ggAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGtt < 1:1533792/93‑1 (MQ=255) ggAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGtt > 1:428433/1‑93 (MQ=255) aaTCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGc < 2:5105228/93‑1 (MQ=255) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGtt > 1:5692348/1‑93 (MQ=255) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGtt > 1:2483656/1‑93 (MQ=255) aGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGtt > 2:5533125/1‑93 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTa > 1:531940/1‑93 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTa > 2:4110048/1‑93 (MQ=255) ggCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGGTGCCGGTa > 2:4580615/1‑93 (MQ=255) cGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAg < 2:1878726/93‑1 (MQ=255) gggCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAgg < 2:3211867/93‑1 (MQ=255) gCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGACCAAAAGTTGCCGTTAAGGTg > 1:4627880/1‑93 (MQ=255) cAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 2:2802809/93‑1 (MQ=255) cAATGGTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 1:1392542/93‑1 (MQ=255) aTGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt > 1:3113237/1‑93 (MQ=255) gTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa > 2:5945944/1‑93 (MQ=255) ttCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa > 2:6151980/1‑93 (MQ=255) ttCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa > 1:698125/1‑93 (MQ=255) cccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa > 2:380415/1‑93 (MQ=255) ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg > 2:4647259/1‑93 (MQ=255) ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg > 2:2303326/1‑93 (MQ=255) ccGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg > 2:5858813/1‑93 (MQ=255) cGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGt < 2:3957614/93‑1 (MQ=255) gCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt > 2:4262758/1‑93 (MQ=255) gCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt > 1:3569207/1‑93 (MQ=255) ccTTTTCTTGGCCTTAATTCCAGGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTGAAGGTGGGTCAAAAGTTg < 2:66637/93‑1 (MQ=21) cTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 1:5073155/93‑1 (MQ=255) ttttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGGGGGTCAAAAGTTGcc > 2:5183339/1‑93 (MQ=255) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg < 1:3708858/93‑1 (MQ=255) tttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg > 1:4967717/1‑93 (MQ=255) ttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt < 2:4233657/93‑1 (MQ=255) ttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt < 1:5231427/93‑1 (MQ=255) ttCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGt > 1:2251456/1‑93 (MQ=255) tCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGGCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAATGTGGGTCAAAAGTTGCCGtt > 1:2182492/1‑93 (MQ=255) cTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTa > 2:4327777/1‑93 (MQ=255) tttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTaa < 1:1236939/93‑1 (MQ=255) ttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg < 1:3285273/93‑1 (MQ=255) ttGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAg < 2:1357099/93‑1 (MQ=255) tGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAgg < 2:216561/93‑1 (MQ=255) gCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGt > 1:4683477/1‑93 (MQ=255) cTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTgg < 1:3419735/93‑1 (MQ=255) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 1:4195364/1‑93 (MQ=255) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 1:1610908/1‑93 (MQ=255) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 2:4985851/1‑93 (MQ=255) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 2:4949800/1‑93 (MQ=255) ttAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTggg > 1:4251820/1‑93 (MQ=255) tAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGt > 2:763404/1‑93 (MQ=255) aTTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa > 2:4712070/1‑93 (MQ=255) aTTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCa > 2:5478760/1‑93 (MQ=255) ttCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaa > 2:155369/1‑93 (MQ=255) tCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaa > 1:997177/1‑93 (MQ=255) ccATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCaaaa > 1:3518343/1‑93 (MQ=255) cATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAg < 1:3922773/93‑1 (MQ=255) tGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGtt > 1:2029247/1‑93 (MQ=255) aaTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGc < 2:5419260/93‑1 (MQ=255) aTTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGcc > 1:3794255/1‑93 (MQ=255) ttCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCg < 1:1664102/93‑1 (MQ=255) cAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAg < 2:2234721/93‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGt < 1:2074070/93‑1 (MQ=255) aGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGt < 1:1120617/93‑1 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTa < 1:2767220/93‑1 (MQ=255) ggTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTa < 2:1797840/93‑1 (MQ=255) gTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTaa < 2:3885450/93‑1 (MQ=255) tGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAg < 2:3372411/93‑1 (MQ=255) tGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAg > 1:441551/1‑93 (MQ=255) gggTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGa > 1:677760/1‑93 (MQ=255) ggTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGaa > 2:2149744/1‑93 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTACGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTc > 1:751642/1‑93 (MQ=255) cAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTc < 1:1569230/93‑1 (MQ=255) aaaGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTcta > 1:5794105/1‑93 (MQ=255) aGTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctact > 1:1289488/1‑93 (MQ=255) gTTGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTctacta > 2:644606/1‑93 (MQ=255) tGCCGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTAtt < 1:6138637/93‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa < 2:3716181/93‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa < 1:2713028/93‑1 (MQ=255) ccGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTaa < 2:5641832/93‑1 (MQ=255) cGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAg > 2:891085/1‑93 (MQ=255) cGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAg < 1:3917808/93‑1 (MQ=255) cGTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAg > 2:3631193/1‑93 (MQ=255) gTTAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGa < 1:4576201/93‑1 (MQ=255) ttAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGaa < 2:954585/93‑1 (MQ=255) ttAGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGaa > 1:5402467/1‑93 (MQ=255) aGTGGTGGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAAtt < 2:2964795/93‑1 (MQ=255) gtggtgGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTc < 1:984206/93‑1 (MQ=255) gtggtgGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTc > 1:772782/1‑93 (MQ=255) gtggtgGATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTc < 1:4775777/93‑1 (MQ=255) tggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCt > 2:1448589/1‑93 (MQ=255) tggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCt > 1:5562812/1‑93 (MQ=255) ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 2:354911/93‑1 (MQ=255) ggtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTa < 1:3013669/93‑1 (MQ=255) gtggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAg < 2:1261264/93‑1 (MQ=255) tggATCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAgg < 2:4160445/93‑1 (MQ=255) | AAATAACGGAATCAGGCGGGCAATGTTCCCGCCTTTTCTTTGCCTTAATTCCATGAATTCAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAGTGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGTTAAGGTGGGTCAAAAGTTGCCGAGTAAGAATTCTACTATTAAGAATTCTAGG > NC_000913/2558913‑2559092 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |