BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	3,025,603	T→C	G154G (GGT→GGC)	ygfQ →	hypothetical protein

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	3,025,603	0	T	C	99.5%	627.0 / NA	198	G154G (GGT→GGC)	ygfQ	hypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base C (95/102); minor base A (1/0); total (96/102)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.85e-01
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01

Only 100 of 231 total aligned reads displayed.

CGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑CAGTGGCGCTCGGTG  >  NC_000913/3025513‑3025690

cGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcggcat                                                                                        >  2:2748759/1‑93 (MQ=255)

 gTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcggcatc                                                                                       <  2:2359272/93‑1 (MQ=255)

 gTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcggcatc                                                                                       <  2:6041642/93‑1 (MQ=255)

  tCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGgtatcggcatcg                                                                                      <  2:5819997/93‑1 (MQ=255)

  tCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGgtatcggcatcg                                                                                      <  2:1928440/93‑1 (MQ=255)

   cATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGtatcggcatcgg                                                                                     <  1:2212367/93‑1 (MQ=255)

   cATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGtatcggcatcgg                                                                                     <  1:4400171/93‑1 (MQ=255)

   cATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGtatcggcatcgg                                                                                     <  2:2465395/93‑1 (MQ=255)

     tCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCgggt                                                                                   >  1:1239142/1‑92 (MQ=255)

     tCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGc                                                                                   >  1:4623327/1‑93 (MQ=255)

     tCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGc                                                                                   <  2:6172049/93‑1 (MQ=255)

          aCCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGttt                                                                              >  2:1625071/1‑93 (MQ=255)

          aCCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGtgt                                                                              >  2:6030405/1‑91 (MQ=255)

           ccGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTc                                                                             <  2:4898451/93‑1 (MQ=255)

            cGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTct                                                                            >  1:1784049/1‑93 (MQ=255)

                aTTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTctgctg                                                                        >  2:1843494/1‑93 (MQ=255)

                aTTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTctgctg                                                                        >  1:263229/1‑93 (MQ=255)

                 tttCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTctgctgc                                                                       <  2:1362635/93‑1 (MQ=255)

                   tCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTctgctgctg                                                                     <  1:6116317/93‑1 (MQ=255)

                    ccGTAACCGGTGTGCGTACCTAGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGa                                                                    <  2:4216274/93‑1 (MQ=255)

                     cGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAt                                                                   >  2:5661443/1‑93 (MQ=255)

                     cGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAt                                                                   <  1:5837383/93‑1 (MQ=255)

                      gTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAtt                                                                  <  1:5941348/93‑1 (MQ=255)

                           cGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATtgctgc                                                             <  1:2784895/93‑1 (MQ=255)

                             gtgtGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTa                                                           >  2:4133120/1‑93 (MQ=255)

                             gtgtGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTa                                                           <  2:4503898/93‑1 (MQ=255)

                             gtgtGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTa                                                           >  2:4706516/1‑93 (MQ=255)

                                tgCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACg                                                        <  1:5883771/93‑1 (MQ=255)

                                 gcgcACCTGGATTTTACGTAATTGGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACgg                                                       <  2:2395220/93‑1 (MQ=255)

                                 gCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACgg                                                       <  1:2191961/93‑1 (MQ=255)

                                  cggtccTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgt                                                      <  1:2068337/89‑1 (MQ=255)

                                  cGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgt                                                      <  2:2500660/93‑1 (MQ=255)

                                  cGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgt                                                      >  1:5626028/1‑93 (MQ=255)

                                  cGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgt                                                      <  2:1312911/93‑1 (MQ=255)

                                       cTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTggg                                                 <  2:3826753/93‑1 (MQ=255)

                                       cTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTggg                                                 >  2:5983546/1‑93 (MQ=255)

                                        tGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGt                                                >  1:4035056/1‑93 (MQ=255)

                                        tGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGt                                                <  2:1061305/93‑1 (MQ=255)

                                         ggATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTa                                               <  1:3192199/93‑1 (MQ=255)

                                         ggATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTa                                               >  1:1511212/1‑93 (MQ=255)

                                         ggATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTa                                               >  2:2155373/1‑93 (MQ=255)

                                         ggATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTa                                               >  2:53778/1‑93 (MQ=255)

                                         ggATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTa                                               >  2:3208821/1‑93 (MQ=255)

                                         ggATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTa                                               <  2:4307224/93‑1 (MQ=255)

                                          gATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTAt                                              >  1:886807/1‑93 (MQ=255)

                                          gATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTAt                                              >  1:800218/1‑93 (MQ=255)

                                           aTCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATg                                             <  1:1104555/93‑1 (MQ=255)

                                            tCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCCAACGGTGTGGGTATgg                                            >  1:57610/1‑93 (MQ=255)

                                               tACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTa                                         >  2:4749817/1‑93 (MQ=255)

                                               tACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTa                                         <  2:1736942/93‑1 (MQ=255)

                                                aCGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTAt                                        <  1:398179/93‑1 (MQ=255)

                                                aCGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTAt                                        <  2:535235/93‑1 (MQ=255)

                                                  gTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCa                                      >  1:4955919/1‑93 (MQ=255)

                                                   tAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCaa                                     >  2:3543881/1‑93 (MQ=255)

                                                   tAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCaa                                     >  2:298000/1‑93 (MQ=255)

                                                     aTTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCaaaa                                   >  1:4651316/1‑93 (MQ=255)

                                                      tttGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCaaaaa                                  >  1:5282582/1‑93 (MQ=255)

                                                        tGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAAcc                                <  1:3454965/93‑1 (MQ=255)

                                                         gCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAAccc                               <  1:638359/93‑1 (MQ=255)

                                                         gCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAAccc                               <  1:3734882/93‑1 (MQ=255)

                                                          ccGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCg                              <  1:364034/93‑1 (MQ=255)

                                                           cGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGa                             <  2:2203709/93‑1 (MQ=255)

                                                           cGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGa                             >  2:706348/1‑93 (MQ=255)

                                                            gATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGAt                            <  2:2071903/93‑1 (MQ=255)

                                                               gggTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGa                         <  2:2565162/93‑1 (MQ=255)

                                                               gggTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGa                         <  1:5364480/93‑1 (MQ=255)

                                                                ggTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGaa                        <  2:3874627/93‑1 (MQ=255)

                                                                ggTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGaa                        >  1:5327868/1‑93 (MQ=255)

                                                                 gTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAg                       <  1:1273714/93‑1 (MQ=255)

                                                                 gTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAg                       <  1:4470238/93‑1 (MQ=255)

                                                                 gTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAg                       <  1:5231274/93‑1 (MQ=255)

                                                                 gTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGGATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAg                       >  2:2871456/1‑93 (MQ=255)

                                                                  tATCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAgg                      >  2:3323709/1‑93 (MQ=255)

                                                                    tCGCTCACGGTACAGTTATCGGCATCGGTCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                    <  1:3025553/93‑1 (MQ=255)

                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                    >  2:3442758/1‑93 (MQ=255)

                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                    >  1:2521266/1‑93 (MQ=255)

                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                    >  1:4524374/1‑93 (MQ=255)

                                                                    tCGCTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCt                    >  1:3730983/1‑93 (MQ=255)

                                                                       cTCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑c                >  1:2347900/1‑93 (MQ=255)

                                                                        tCACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑cc               >  1:5036845/1‑92 (MQ=255)

                                                                         cACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑cca              <  1:420234/93‑3 (MQ=255)

                                                                         cACGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACACGACTGAAGGCTTG‑cca              >  2:44524/1‑91 (MQ=255)

                                                                          aCGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑ccag             >  2:3155137/1‑90 (MQ=255)

                                                                          aCGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑ccag             >  1:1588766/1‑90 (MQ=255)

                                                                           cGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑ccagt            <  1:332630/93‑5 (MQ=255)

                                                                           cGGTACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑ccagt            <  1:1003892/93‑5 (MQ=255)

                                                                              tACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgc          >  2:1569572/1‑93 (MQ=255)

                                                                              tACAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgc          >  1:6153159/1‑93 (MQ=255)

                                                                              gaCAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgc          <  2:4021166/92‑1 (MQ=255)

                                                                               aCAGGTATCGGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcg         >  1:2149531/1‑93 (MQ=255)

                                                                               aCAGGTATCAGCATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGgcg         >  1:2000731/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 aGGTATCGGAATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATTAAAAACCCGATTTAATGCTTGCCAGTGGCGCt       >  2:5880344/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  ggtatcggcatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTc      <  1:2575590/93‑1 (MQ=255)

                                                                                   gtatcggcatcgGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCg     >  2:5103899/1‑93 (MQ=255)

                                                                                   gtatcggcatcgGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCg     <  1:2237406/93‑1 (MQ=255)

                                                                                    tatcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCgg    <  2:1116593/93‑1 (MQ=255)

                                                                                     atcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGt   <  2:531634/93‑1 (MQ=255)

                                                                                      tcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTg  >  1:3879850/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      tcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTg  >  1:2945138/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      tcggcatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTg  <  2:885836/93‑1 (MQ=255)

CGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTG‑CAGTGGCGCTCGGTG  >  NC_000913/3025513‑3025690

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 23 ≤` `ATCG/ATCG` `< 29 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`