| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,951,166 | +C | coding (35/1818 nt) | ilvD → | dihydroxyacid dehydratase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,951,166 | 1 | . | C | 99.5% | 788.6 / ‑3.6 | 212 | coding (35/1818 nt) | ilvD | dihydroxyacid dehydratase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (26/185); total (27/185) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
TACGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTC > NC_000913/3951071‑3951251 | tACGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCCCCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑gg < 2:3201154/96‑1 (MQ=255) aCGAGACAGACACTGGGAGTAAATAACGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑ggc < 1:13667493/96‑2 (MQ=255) aCGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑ggc < 2:7229074/96‑2 (MQ=255) aCGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑ggc < 1:5753324/96‑2 (MQ=255) aCGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCGGGCGCTGC‑gg‑g > 2:5551080/1‑96 (MQ=255) cGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑ggcg < 2:6027249/96‑3 (MQ=255) gagaCAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑ggcgc < 2:13235496/96‑4 (MQ=255) gagaCAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGTCGGGGGGTGC‑GG‑Gcg > 2:850536/1‑95 (MQ=255) gagaCAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGCTCGGGGGCCGT‑gg‑ggg > 1:9953281/1‑94 (MQ=255) agacagacACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑ggcgcg < 2:4506812/96‑5 (MQ=255) tGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGaac < 1:11766637/96‑2 (MQ=255) tGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAAt < 2:2335279/96‑1 (MQ=255) gggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCTCGCCACCGGAATg < 1:13868778/96‑1 (MQ=255) gggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATg < 1:12755469/96‑1 (MQ=255) ggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATGTGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 1:5408624/96‑1 (MQ=255) ggAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGa < 1:6543433/96‑1 (MQ=255) gAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCCCTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGAc < 1:5315107/96‑1 (MQ=255) gAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGAc < 1:5823186/96‑1 (MQ=255) gAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGAc < 2:10190215/96‑1 (MQ=255) aaataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGAc < 2:307890/96‑1 (MQ=255) aataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACg < 2:11153849/96‑1 (MQ=255) aataaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACg < 1:7462497/96‑1 (MQ=255) taaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGcc < 1:6673769/96‑1 (MQ=255) aaaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTTCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCg < 1:2304282/96‑1 (MQ=255) aaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGa < 2:10912750/96‑1 (MQ=255) aaGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGa < 1:1653144/96‑1 (MQ=255) aGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAt < 1:6254579/96‑1 (MQ=255) gtctGCCTAAGTACCGTTCCGCCCCCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAtt < 2:4360447/93‑1 (MQ=255) tATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTTGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGAttt < 2:12206430/96‑1 (MQ=255) gCCTAAGTCCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCgg < 1:9710893/96‑1 (MQ=255) gCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCgg < 1:7602841/96‑1 (MQ=255) tcaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 2:4636606/94‑1 (MQ=255) gtaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTaa < 1:10428631/94‑1 (MQ=255) aaGTCCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAg < 2:2021805/96‑1 (MQ=255) aaGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAg < 2:12152879/96‑1 (MQ=255) tACCGTTCCGCCACCCCCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCCCCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGctg < 1:2959248/96‑3 (MQ=255) aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGa < 2:9622810/96‑1 (MQ=255) aCCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGa < 2:13309787/96‑1 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 2:4765038/96‑1 (MQ=255) ccGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGAt < 2:2147188/96‑1 (MQ=255) gTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGGGGGCTTGCGCGGTGGG‑GCGCCCCCAGAATGAACTCCGCCGATTTCTGTAAGACGATTa > 2:13971458/1‑96 (MQ=255) ttCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTAt < 2:5501731/96‑1 (MQ=255) tCCGCCCCCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATc < 2:5706252/96‑1 (MQ=255) ccGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcg < 2:187077/96‑1 (MQ=255) cGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgc < 1:8169491/96‑1 (MQ=255) gCCCCCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATcgcg < 2:10483568/96‑1 (MQ=255) caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 1:7736305/96‑1 (MQ=255) caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 2:8876849/96‑1 (MQ=255) caccaccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGCGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGt < 1:8050571/96‑1 (MQ=255) accgcTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTtgtg < 1:4263541/96‑1 (MQ=255) ccacTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGa < 2:13804460/96‑1 (MQ=255) acTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAAc < 2:9478781/96‑1 (MQ=255) acTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGCTTGTGAAc < 2:12972435/96‑1 (MQ=255) cTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACt < 1:11191471/96‑1 (MQ=255) cTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACt < 1:7901358/96‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTc < 2:3432575/96‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTc < 2:11381856/96‑1 (MQ=255) tCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTc < 2:3812880/96‑1 (MQ=255) cATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCg < 2:6991645/96‑1 (MQ=255) ggTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTc < 1:2447240/96‑1 (MQ=255) tCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAc < 2:537724/96‑1 (MQ=255) cGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGCCCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCaac < 1:11140217/96‑3 (MQ=255) cGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCAcc < 1:13415846/96‑1 (MQ=255) aaTATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 1:14098461/96‑1 (MQ=255) aaTATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCaa < 1:13360624/96‑1 (MQ=255) atatGGCGGGTGCTCGGGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGGAAGCCGATTATCGCGGGTGTGAACTCGTTCCCCCAAt > 1:4016572/1‑96 (MQ=255) tGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTg < 1:4566925/96‑1 (MQ=255) tGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTg > 2:8190842/1‑96 (MQ=255) ggCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGt < 1:11357472/96‑1 (MQ=255) ggCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGt < 2:7572914/96‑1 (MQ=255) ggCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGt > 1:10084893/1‑96 (MQ=255) ggCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGt < 1:5022539/96‑1 (MQ=255) ggCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGt < 1:3480434/96‑1 (MQ=255) gCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa < 1:11720793/96‑1 (MQ=255) gCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTa < 2:11078961/96‑1 (MQ=255) gggTGCTTCTGCGCTGT‑GGCGCGACACCGGAATGGCCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 1:1264404/96‑1 (MQ=255) gggTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTccc < 1:1063751/96‑1 (MQ=255) gggTGCTCGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTAcc < 2:14227345/96‑1 (MQ=255) 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cGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc < 1:3121705/96‑1 (MQ=255) cGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc < 1:464986/96‑1 (MQ=255) cGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc < 1:8528952/96‑1 (MQ=255) cGTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCACGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCAc < 2:10153450/96‑1 (MQ=255) gTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACg > 2:8820571/1‑96 (MQ=255) gTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACg > 1:3256911/1‑96 (MQ=255) gTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACg > 2:6543525/1‑96 (MQ=255) gTGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGGCACg > 1:7030643/1‑96 (MQ=255) tGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGCCCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGt < 1:160022/96‑1 (MQ=255) tGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGt < 2:6693152/96‑1 (MQ=255) tGCGCTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGt > 2:28267/1‑96 (MQ=255) gcgcTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTc < 1:8937122/96‑1 (MQ=255) gcgcTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTc < 2:11685198/96‑1 (MQ=255) gcgcTGT‑GGCGCGCCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTc < 1:8395482/96‑1 (MQ=255) | TACGAGACAGACACTGGGAGTAAATAAAGTATGCCTAAGTACCGTTCCGCCACCACCACTCATGGTCGTAATATGGCGGGTGCTCGTGCGCTGT‑GG‑GC‑CCACCGGAATGACCGACGCCGATTTCGGTAAGCCGATTATCGCGGTTGTGAACTCGTTCACCCAATTTGTACCGGGTCACGTC > NC_000913/3951071‑3951251 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |