| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,152,247 | +C | intergenic (+10/+29) | yghB → / ← yqhC | hypothetical protein/putative ARAC‑type regulatory protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,152,244 | 1 | . | C | 98.4% | 1721.3 / 13.0 | 437 | intergenic (+7/+32) | yghB/yqhC | hypothetical protein/putative ARAC‑type regulatory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (4/3); new base C (219/211); total (223/214) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
Only 100 of 543 total aligned reads displayed.
TCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑T‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAA > NC_000913/3152149‑3152336 | ccTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑ttt‑t > 2:13803555/1‑96 (MQ=255) tgatgaTCCTGCCAATTGGCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTACCGCCTGAC‑GA‑TTt‑t‑ccc < 2:2556451/96‑1 (MQ=255) tgatgaTCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTt‑t‑ccc > 2:12356851/1‑96 (MQ=255) tgatgaTCCTGCCAATTGCCTTGCTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTt‑t‑ccc < 1:12585673/96‑1 (MQ=255) gatgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTt‑t‑cccc < 2:3517638/96‑2 (MQ=255) gatCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTt‑t‑ccccgtt < 2:11452179/96‑5 (MQ=255) gatCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTt‑t‑ccccgtt < 1:9083690/96‑5 (MQ=255) ccTGCCCATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑tccccgttccc < 1:797877/96‑1 (MQ=255) ccTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑tccccgttccc > 1:8368742/1‑96 (MQ=255) ccTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑tccccgttccc < 1:7197853/96‑1 (MQ=255) ccTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑‑AAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑tccccgttcccg > 2:12841399/1‑96 (MQ=255) cTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑tccccgttcccg > 2:14216158/1‑96 (MQ=255) ccAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGtt > 2:11062295/1‑96 (MQ=255) cAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTg > 2:74557/1‑96 (MQ=255) aaTTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGc > 2:13237194/1‑96 (MQ=255) tGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGGTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GG‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGATGCTGt > 1:1867335/1‑96 (MQ=255) gCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTa < 1:2238138/96‑1 (MQ=255) ccTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTAc < 2:10043353/96‑1 (MQ=255) cctGTTAACCCGCTGCTTTTTTGGCCCCGCGGTTGGTGTTGATT‑‑AAAGAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTAcc < 2:10308910/94‑1 (MQ=255) cTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTAcc < 1:12365250/96‑1 (MQ=255) cTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTAcc < 1:1996012/96‑1 (MQ=255) ttGTTAA‑CTGCTTGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCg < 1:13721844/96‑1 (MQ=255) ttGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCg < 2:1638711/96‑1 (MQ=255) tGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCgg < 2:13372708/96‑1 (MQ=255) tGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCgg < 1:3753237/96‑1 (MQ=255) aa‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAAc > 1:2114765/1‑96 (MQ=255) aa‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAAc < 1:7005019/96‑1 (MQ=255) aa‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGGTGGCGGACCGGGGAc > 1:4837441/1‑96 (MQ=255) aa‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGGTGCTGTACCGGGAAc > 2:9623252/1‑96 (MQ=255) ccggCTGCCTTGTTGGGCCGGCGTTTGGTGGTATTT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACg < 2:8357144/93‑1 (MQ=255) ccGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGGTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGt > 1:6267000/1‑96 (MQ=255) ccGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGGGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGt > 2:10202048/1‑96 (MQ=255) cGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTa < 1:6530538/96‑1 (MQ=255) gCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGGAACACCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCGGTACCGGGAACggaa > 1:14185441/1‑93 (MQ=255) cTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTAtt < 2:4135333/96‑1 (MQ=255) cTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTAtt > 2:8850975/1‑96 (MQ=255) ggCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTa < 1:3625147/96‑1 (MQ=255) ggCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTa > 2:8008029/1‑96 (MQ=255) cTTGTTAGGCACGCTGTTTGGGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCCTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGGATTTAAt > 2:4792113/1‑96 (MQ=255) ttGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAAtt > 1:609659/1‑96 (MQ=255) tGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTc > 2:6803852/1‑96 (MQ=255) gTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GATTTT‑T‑CCCGTTCCCGGGTGCTGTTCCGGGAACGGTTTTAATTcc > 1:9306062/1‑96 (MQ=255) gTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTCCCGGGAACGTATTTAATTcc < 1:2620681/96‑1 (MQ=255) tAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAGCGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTcccc < 1:8808289/96‑1 (MQ=255) aGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCt < 2:10553121/96‑1 (MQ=255) aGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCt < 1:4116078/96‑1 (MQ=255) aGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGGACCGGGAACGTATTTAATTCCCCt > 2:2721258/1‑96 (MQ=255) gCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGc > 1:11807716/1‑96 (MQ=255) gCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGc < 1:12192384/96‑1 (MQ=255) gCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCGGTACCGGGAACGGATTTAATTCCCCTGc > 2:7281065/1‑96 (MQ=255) cgcGCTTTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGGC‑TA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGACCGTATTTAATTCCCCTGCa < 1:1724253/94‑1 (MQ=255) cACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCa < 1:11539259/96‑1 (MQ=255) aCGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCAt < 2:9156863/96‑1 (MQ=255) gCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCg > 1:2925806/1‑96 (MQ=255) gCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCg > 2:5705729/1‑96 (MQ=255) gTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGccc > 2:10825593/1‑96 (MQ=255) gTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGccc < 1:460732/96‑1 (MQ=255) gTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGccc < 2:936909/96‑1 (MQ=255) tgtgGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCa < 2:4447691/96‑1 (MQ=255) tgtgGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTAATTAATTCCCCTGCATCGCCCGCa > 1:10101124/1‑96 (MQ=255) gtggtgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAt < 2:2884591/96‑1 (MQ=255) gtggtgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAt > 1:12992672/1‑96 (MQ=255) tggtgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAtt < 1:11951182/96‑1 (MQ=255) tggtgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATCCCCCTGCATCGCCCGCAtt < 2:616025/96‑1 (MQ=255) tagtgATT‑AAAAAAAATTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCGGGTTGCTGAACCGGGAGCGTATTTAATTCCCCTCCATCGCCCGCAtt > 1:11137666/3‑96 (MQ=255) ggtgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTc > 2:3973268/1‑96 (MQ=255) ggtgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTc < 1:5371138/96‑1 (MQ=255) tgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCtt < 2:120510/96‑1 (MQ=255) tgATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCtt < 1:13213500/96‑1 (MQ=255) gATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTg > 2:633813/1‑96 (MQ=255) gATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTg > 2:5043855/1‑96 (MQ=255) aTT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGc > 2:1850480/1‑96 (MQ=255) t‑AAAAAAAAATACTGCAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCg > 2:13036491/1‑96 (MQ=255) aaaaaaaaTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTTCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCa > 1:10244136/1‑96 (MQ=255) aaaaaaaTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCAt > 1:5944866/1‑96 (MQ=255) aaaaaaaTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGCTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCAt > 2:11635341/1‑96 (MQ=255) aaaaaTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCt < 1:74557/96‑1 (MQ=255) aaaaaTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCt < 2:1985577/96‑1 (MQ=255) aaaTGCTGTACCGCCTGGC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTACCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTc < 2:2971965/96‑1 (MQ=255) aaaTACTGTAACGCCTGGC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTc < 1:7759674/96‑1 (MQ=255) aaTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTAGTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTcc > 1:7603246/1‑96 (MQ=255) aTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTTCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccc > 2:5313578/1‑96 (MQ=255) aTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccc > 2:8107407/1‑96 (MQ=255) aTACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccc < 2:13564324/96‑1 (MQ=255) tACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCTCCTGCATCTCCCGCATTCTTGCCGCATCTTcccc > 1:2992014/1‑96 (MQ=255) tACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTcccc < 1:6803852/96‑1 (MQ=255) cTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTGCCTGGTGCTGTACCGGGGACGTGTTTAATTACCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGGATCTTCCCCCg > 2:12241864/1‑96 (MQ=255) ctcaaCGACTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCCTCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCgg < 1:3250787/93‑1 (MQ=255) gTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGc > 1:10634211/1‑96 (MQ=255) aaCGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTTCCGCGTCTTTCCCCGGCGt > 1:2465207/1‑96 (MQ=255) aaCGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGt > 2:3913991/1‑96 (MQ=255) aaCGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGt > 1:12673859/1‑96 (MQ=255) cGCCTGACTGT‑TTT‑C‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTca < 1:4268934/96‑1 (MQ=255) cGCCTGAC‑GA‑TTTGC‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTca > 1:13865751/1‑96 (MQ=255) cGCCTGAC‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCCCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcc > 2:1365683/1‑95 (MQ=255) c‑GA‑TTT‑TCCCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGaa > 2:5517890/1‑96 (MQ=255) gatttt‑c‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAg > 2:8502660/4‑96 (MQ=255) tttt‑c‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGGATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCCGCGTCACACCGAAGTa > 1:10018692/2‑96 (MQ=255) ttt‑c‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTaa < 1:9623252/96‑1 (MQ=255) ttt‑c‑CCCGCTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTaa < 1:5608043/96‑1 (MQ=255) | TCCTGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAA‑CCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATT‑AAAAAAAAATACTGTAACGCCTGAC‑GA‑TTT‑T‑CCCGTTCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAA > NC_000913/3152149‑3152336 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |