| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,085,675 | Δ1 bp | intergenic (+38/+13) | yiiG → / ← frvR | hypothetical protein/putative frv operon regulatory protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,085,675 | 0 | G | . | 99.6% | 1189.4 / ‑2.4 | 262 | intergenic (+38/+13) | yiiG/frvR | hypothetical protein/putative frv operon regulatory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base . (163/96); minor base C (0/1); total (164/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.82e-01 | |||||||||||
Only 100 of 283 total aligned reads displayed.
GCATTACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGCGATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCTGACA > NC_000913/4085587‑4085762 | cATTACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGa < 1:5261198/93‑1 (MQ=255) cATTACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGa > 2:7134602/1‑93 (MQ=255) aTTACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGac < 1:7629513/93‑1 (MQ=255) aTTACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGac < 2:1908265/93‑1 (MQ=255) ttACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGaca > 1:593122/1‑93 (MQ=255) ttACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGaca > 1:4634889/1‑93 (MQ=255) aCGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGAcaca < 1:2761226/93‑1 (MQ=255) gcgAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGt < 2:4550065/93‑1 (MQ=255) gcgAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCATGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGt > 1:418802/1‑93 (MQ=255) cgAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGTAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGtt > 2:5242661/1‑93 (MQ=255) cgAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGtt < 1:3897237/93‑1 (MQ=255) gAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTc > 2:4016959/1‑93 (MQ=255) aGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCa < 1:7876801/93‑1 (MQ=255) gTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACACTTCAc > 1:1228796/1‑93 (MQ=255) gTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGCGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCAc > 1:3798405/1‑93 (MQ=255) cAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCAcccc < 1:8413266/93‑1 (MQ=255) aaaCGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCAcccc < 1:7440748/92‑1 (MQ=255) aaCGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCt < 1:1446479/93‑1 (MQ=255) aaCGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCt > 2:4915993/1‑93 (MQ=255) aCGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCTTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCtt < 1:4302130/93‑1 (MQ=255) aCGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCtt > 1:2156123/1‑93 (MQ=255) gAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTtgt > 2:7048370/1‑93 (MQ=255) gAAATGGTGTATGACTATAATAGCCTCCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTTTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTtgt < 1:1739364/93‑1 (MQ=255) aaaTGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTtgtg > 2:1936816/1‑93 (MQ=255) aaaTGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTtgtg > 1:8694600/1‑93 (MQ=255) aaTGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGa > 1:3596040/1‑93 (MQ=255) ggTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGt < 1:6678402/93‑1 (MQ=255) gtctatgaATATAAGAGCCTCCGTTAAACGTTTTTGATAATAAATGCAGTGTCGGATGGGGC‑CCACCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTa < 2:7934874/89‑1 (MQ=255) gTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGGGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTa > 1:4799377/1‑93 (MQ=255) gTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCCTGTGAAGTa > 2:1598197/1‑93 (MQ=255) tgatgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAAc < 2:6786809/93‑1 (MQ=255) gatgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACt > 1:1351634/1‑93 (MQ=255) atgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTc > 2:6887879/1‑93 (MQ=255) tgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTcc > 2:453135/1‑93 (MQ=255) tgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTcc > 2:6026073/1‑93 (MQ=255) tgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTcc < 2:2119287/93‑1 (MQ=255) tgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTcc > 1:2887709/1‑93 (MQ=255) tgaCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTcc > 1:1979675/1‑93 (MQ=255) gaCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGTCACAGTTCACCCCCTGTGAAGTAACTCCa > 1:7126882/1‑93 (MQ=255) aCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCAt < 2:8564453/93‑1 (MQ=255) aCTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGCGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCAt < 2:3798406/93‑1 (MQ=255) cTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATa > 1:3231724/1‑93 (MQ=255) ataataGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATaaa > 1:1167420/1‑93 (MQ=255) ataataGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATaaa > 2:8191331/1‑93 (MQ=255) ataataGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATaaa > 1:6892141/1‑93 (MQ=255) taataGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAAt > 2:5944868/1‑93 (MQ=255) aataGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCAGCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATg > 2:837934/1‑93 (MQ=255) ataGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGc > 2:1244684/1‑93 (MQ=255) taGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGcc > 1:4651263/1‑93 (MQ=255) ggCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCt > 2:848324/2‑93 (MQ=255) aGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCt < 2:3470902/93‑1 (MQ=255) ccTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCa > 1:6824017/1‑93 (MQ=255) cTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCat > 1:2349134/1‑93 (MQ=255) cTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCat > 1:2420420/1‑93 (MQ=255) cTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGCTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCat > 1:219758/1‑93 (MQ=255) cTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ACCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCat < 1:6485745/93‑1 (MQ=255) cTGCCTTAAAAGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATTCGGC‑ATACCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCat < 2:2554537/93‑1 (MQ=255) tGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCata > 1:1074669/1‑93 (MQ=255) tGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCata < 1:8489306/93‑1 (MQ=255) tGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCata > 1:2716013/1‑93 (MQ=255) tGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCata < 2:4416463/93‑1 (MQ=255) cGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATc < 2:5546771/93‑1 (MQ=255) gTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATcc < 1:5738077/93‑1 (MQ=255) gTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATcc < 2:3634471/93‑1 (MQ=255) ttAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGGTGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCCTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCt > 2:2359063/1‑93 (MQ=255) ttAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCt > 1:5359065/1‑93 (MQ=255) tAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTg < 1:6359721/93‑1 (MQ=255) aaCTTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGtt < 1:5090292/93‑1 (MQ=255) aaCGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGtt > 2:8232942/1‑93 (MQ=255) aCGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACACCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTa > 2:6426006/1‑93 (MQ=255) cGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTaa < 2:2875415/93‑1 (MQ=255) ctttttGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAAc < 2:3882327/92‑1 (MQ=255) tttttGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAAcc > 1:8143500/1‑93 (MQ=255) ttttGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAAccc > 2:66160/1‑93 (MQ=255) ttGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCgg > 2:1561651/1‑93 (MQ=255) gatgatAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCa > 2:6402592/1‑93 (MQ=255) atgatAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATCTCCTGTTAACCCGGCaa > 1:4862506/1‑93 (MQ=255) atgatAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaa > 1:5640591/1‑93 (MQ=255) atgatAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaa < 2:585552/93‑1 (MQ=255) tgatAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaat > 2:783456/1‑93 (MQ=255) atAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaataa < 2:5037780/93‑1 (MQ=255) atAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaataa > 2:3050792/1‑93 (MQ=255) atAAATCCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaataa < 1:1779695/93‑1 (MQ=255) tAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCaataat > 2:3699781/1‑93 (MQ=255) aaaTGCAGTGTCGGATGCGGC‑CCATCCGATACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAAtc < 2:6545126/93‑1 (MQ=255) aaTGCAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAAtct > 1:3406919/1‑93 (MQ=255) cAGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTccgc < 2:8702837/93‑1 (MQ=255) aGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTccgcc < 2:5467286/93‑1 (MQ=255) aGTGTCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTccgcc > 2:5637195/1‑93 (MQ=255) tgtCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCgg < 2:2593408/93‑1 (MQ=255) gtCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCAATAAATGCCTCATATCCTGTAAACCCGGCAATAAGCTCCGCCGGa < 2:4180571/93‑1 (MQ=255) tCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGAt < 1:7042422/93‑1 (MQ=255) tCGGATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCATTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCGTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGAt < 2:1476889/93‑1 (MQ=255) tCGGATGCGGC‑CCATCCGCCACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGAt < 1:1617342/93‑1 (MQ=255) ggATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGc > 1:5158833/1‑93 (MQ=255) gATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCt < 2:4714137/93‑1 (MQ=255) gATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCt > 2:7366185/1‑93 (MQ=255) gATGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCt > 1:6625841/1‑93 (MQ=255) tGCGGCGC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCTGa < 2:7645872/93‑1 (MQ=255) cggcgC‑ATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCTGaca > 1:7302651/1‑93 (MQ=255) | GCATTACGCGAGTACAACGAAATGGTTGATGACTATAATAGCCTGCGTTAAACGTTTTTGATGATAAATGCAGTGTCGGATGCGGCGCGATCCGACACAGTTCACCCCTTGTGAAGTAACTCCATAAATGCCTCATATCCTGTTAACCCGGCAATAATCTCCGCCGGATGCTGACA > NC_000913/4085587‑4085762 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 17 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |