Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,027,751 | (C)6→7 | coding (191/921 nt) | yedA → | putative transmembrane subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,027,745 | 1 | . | C | 97.0% | 785.2 / 13.0 | 235 | coding (185/921 nt) | yedA | putative transmembrane subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/4); new base C (123/105); total (126/109) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.07e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.39e-01 |
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
GGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACA > NC_000913/2027653‑2027832 | ggAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑t > 1:8620657/1‑93 (MQ=255) ggAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑t > 1:3128767/1‑93 (MQ=255) aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑cc > 2:1309211/1‑93 (MQ=255) aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑cc > 1:7669418/1‑93 (MQ=255) aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTAGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑cc < 1:6247751/93‑1 (MQ=255) aaGCTTGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccc < 1:7405889/93‑1 (MQ=255) aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccc > 1:6349005/1‑93 (MQ=255) gCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccc‑cc < 2:4938679/93‑1 (MQ=255) cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccc‑ccc < 2:3963230/93‑1 (MQ=255) cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccc‑ccc < 2:2707629/93‑1 (MQ=255) tGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCTATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAACC‑T‑‑ccc‑cccc < 2:3877773/93‑2 (MQ=255) tGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑ccc‑cccc > 1:1016795/1‑92 (MQ=255) tCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTAc > 1:4199486/1‑93 (MQ=255) gTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTc < 2:5618735/93‑1 (MQ=255) tAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCg > 1:3995596/1‑93 (MQ=255) tAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCg > 1:2494780/1‑93 (MQ=255) aaTGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCgc < 1:8052703/93‑1 (MQ=255) atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCCCC‑CCCGCTACGTCCgc > 2:1832541/1‑93 (MQ=255) atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCgct > 1:3115635/1‑93 (MQ=255) gatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCgctgc < 2:7860675/93‑1 (MQ=255) gatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCgctgc < 1:3511957/93‑1 (MQ=255) atgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCgctgct > 2:8017611/1‑93 (MQ=255) cgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAAt < 2:1006110/93‑1 (MQ=255) gggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATg < 2:5994824/93‑1 (MQ=255) ggcgTTGGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGc < 2:8223069/93‑1 (MQ=255) ggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGc > 1:3886888/1‑93 (MQ=255) gcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGcc > 1:3681853/1‑93 (MQ=255) ctttCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCACTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcg < 1:3354487/91‑1 (MQ=255) cgTTAGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcg < 2:2004423/93‑1 (MQ=255) gTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc < 1:5048303/93‑1 (MQ=255) tCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCgcgc < 1:1057945/93‑1 (MQ=255) aTTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGa > 1:1588775/1‑93 (MQ=255) aTTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGa < 2:2748621/93‑1 (MQ=255) ccTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTg < 1:4703585/93‑1 (MQ=255) cTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg > 2:4133089/1‑93 (MQ=255) tGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGc > 1:1819679/1‑93 (MQ=255) tGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGc > 1:2386202/1‑93 (MQ=255) tgCAGCCGGTATATAATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAACAC‑‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc < 2:7221246/92‑1 (MQ=255) ggCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc > 2:549900/1‑93 (MQ=255) ggCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc > 2:3684918/1‑93 (MQ=255) gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCt < 1:5860279/93‑1 (MQ=255) gaGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg < 2:2488130/92‑1 (MQ=255) cAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg > 1:282308/1‑93 (MQ=255) aGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGt > 1:4817834/1‑93 (MQ=255) aGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGt > 2:8275049/1‑93 (MQ=255) aGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGt > 1:3234180/1‑93 (MQ=255) gCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGtt < 2:4309434/93‑1 (MQ=255) ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTa > 1:5875982/1‑93 (MQ=255) cGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGCTAt > 2:4266310/1‑93 (MQ=255) ggTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAtt < 2:5793928/93‑1 (MQ=255) ggTATTTTATTGCTGGCATTCTTGCTACTGCGCGGACACAACC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCTCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGCCCTGTTAtt < 2:4369014/93‑1 (MQ=255) gTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTg < 1:2594466/93‑1 (MQ=255) gTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTg < 1:918808/93‑1 (MQ=255) gTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgt > 1:1455109/1‑92 (MQ=255) aTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgct < 2:5013791/93‑1 (MQ=255) aTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgct < 2:8801951/93‑1 (MQ=255) ttttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctg > 2:297463/1‑93 (MQ=255) ttttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctg < 1:7007430/93‑1 (MQ=255) ttttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctg < 1:891031/93‑1 (MQ=255) tttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg > 1:6748485/1‑93 (MQ=255) ttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggc < 2:173631/93‑1 (MQ=255) ttATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggc < 1:6076116/93‑1 (MQ=255) tATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggct > 1:4391441/1‑93 (MQ=255) aTTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggctg > 2:4850236/1‑93 (MQ=255) tGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACGCAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTc < 2:3311662/93‑1 (MQ=255) tGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTc > 1:6692067/1‑93 (MQ=255) tGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCCACCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGAGTGTc > 1:4532622/1‑93 (MQ=255) tGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGt > 2:221557/1‑93 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTa < 1:8302146/93‑1 (MQ=255) gCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa > 1:3809360/1‑93 (MQ=255) cATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTCTTATTGCTGGCTGTCGGTAAt < 2:5564875/93‑1 (MQ=255) aTTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATg < 2:511080/93‑1 (MQ=255) tttttGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg > 1:5367408/1‑93 (MQ=255) ttttCTTCTGCGCTGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCa < 1:6916584/93‑1 (MQ=255) tGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCGCAATGCCGCGCTGATTTGCCTGGTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGGATg > 1:7754011/1‑93 (MQ=255) gCTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:2636984/1‑93 (MQ=255) cTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGt < 2:7530919/93‑1 (MQ=255) cTACTGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGt < 1:2196586/93‑1 (MQ=255) cTGCGCGGACACAAACGC‑‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTCTCGGTAATGGCATGGTGAc < 1:8536031/93‑1 (MQ=255) tGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACg > 1:2910617/1‑93 (MQ=255) tGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACg > 2:6423587/1‑93 (MQ=255) tGCGCGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACg > 2:8472048/1‑93 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACgg < 1:6117199/93‑1 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACgg > 1:2318854/1‑93 (MQ=255) cgcgGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGt > 2:2320529/1‑93 (MQ=255) cgcgGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGt < 2:5346097/93‑1 (MQ=255) cgcgGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGt < 1:1725618/93‑1 (MQ=255) gcgGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt > 1:4573211/1‑93 (MQ=255) gcgGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt < 2:7042389/93‑1 (MQ=255) cgGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTg > 2:6251701/1‑93 (MQ=255) cgGACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTg > 1:2023797/1‑93 (MQ=255) ggACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGc > 2:6458287/1‑93 (MQ=255) ggACACAAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGc > 2:1672151/1‑93 (MQ=255) gACACAAAC‑TCCCCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGc > 1:6572892/1‑93 (MQ=255) gcacaAAC‑CC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCg < 2:7431807/92‑1 (MQ=255) cacaAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGa < 1:5276764/93‑1 (MQ=255) acaAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGaa > 2:6627603/1‑93 (MQ=255) acaAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGaa < 1:576655/93‑1 (MQ=255) caAAC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAAc > 1:6835908/1‑93 (MQ=255) aaaC‑TC‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTCATGGCATGGTGACTGTTGCCGAACa > 1:1264492/1‑93 (MQ=255) | GGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑‑CCC‑CCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACA > NC_000913/2027653‑2027832 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |