| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,152,247 | +C | intergenic (+10/+29) | yghB → / ← yqhC | hypothetical protein/putative ARAC‑type regulatory protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,152,244 | 1 | . | C | 99.1% | 1156.0 / 1.0 | 334 | intergenic (+7/+32) | yghB/yqhC | hypothetical protein/putative ARAC‑type regulatory protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/1); new base C (189/142); total (191/143) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.28e-01 | |||||||||||
Only 100 of 406 total aligned reads displayed.
TGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTT‑CC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAG > NC_000913/3152152‑3152333 | gatgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTtt‑c > 2:3871682/1‑93 (MQ=255) atgctCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTtt‑cc < 2:6032655/93‑1 (MQ=255) atgatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAA‑ACTGTAACCGCCGAACG‑ATTtt‑cc > 2:902821/1‑93 (MQ=255) gatCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTtt‑cc‑cc < 2:6247132/93‑2 (MQ=255) atCCTCCGAATTGCTTTGTTAACCGCTGGTTTGTTAGGCTCGCTGTTTGTGGTTATTAAAAAAAAATACTATAA‑CGCCTGTCG‑ATTtt‑cc‑ccg < 2:5685040/93‑3 (MQ=255) tGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTtccc‑cgt‑tcc > 1:5209585/1‑93 (MQ=255) tGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTtccc‑cgt‑tcc < 2:821229/93‑1 (MQ=255) tGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTtccc‑cgt‑tcc > 2:5714261/1‑93 (MQ=255) ccACTTGCCTTGTTAGCCCCTGGCTTGTTAGGCATGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATGCTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTtccc‑cgt‑tcccg < 2:6885122/93‑1 (MQ=255) cAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCgg > 1:4632115/1‑93 (MQ=255) aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCTGGt > 2:810264/1‑93 (MQ=255) aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGt < 2:1985041/93‑1 (MQ=255) aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGt < 2:2227493/93‑1 (MQ=255) aaTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGt > 2:5817822/1‑93 (MQ=255) aTTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGtt < 2:4479958/93‑1 (MQ=255) gCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTTGGCACGCTGTTTGTTGTGCTTTAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCt > 1:1846872/1‑93 (MQ=255) gCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGGTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCt > 1:2462253/1‑93 (MQ=255) ccTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACGAATTTC‑CC‑CGT‑TCCCGGTTGCTg > 2:1231351/1‑93 (MQ=255) cTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CTT‑TCCCGGTTgtttt > 1:3124531/1‑89 (MQ=255) cTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGt < 1:638631/93‑1 (MQ=255) cTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGt > 2:8404190/1‑93 (MQ=255) ttGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTa > 2:6608330/1‑93 (MQ=255) tGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTAc < 2:5032973/93‑1 (MQ=255) tGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTAc < 1:6666014/93‑1 (MQ=255) tGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTAc > 1:8158241/1‑93 (MQ=255) tttAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTAcc < 1:2666787/92‑1 (MQ=255) gTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCCCGCTGTTTTTGGTGACTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTAcc < 1:853130/93‑1 (MQ=255) ttAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCg < 1:7523210/93‑1 (MQ=255) aaCCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCggg > 1:3849366/1‑93 (MQ=255) aaCCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCggg > 2:1192553/1‑93 (MQ=255) aaCCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTT‑CCTCGT‑TCCCGGTTGCTGTACCggg > 1:5706045/1‑93 (MQ=255) aCCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGa > 1:3717450/1‑93 (MQ=255) aCCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGa > 2:7661778/1‑93 (MQ=255) gCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGGACg > 1:1650380/1‑93 (MQ=255) gCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACg < 1:6199788/93‑1 (MQ=255) gCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACg < 1:2339351/93‑1 (MQ=255) gCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTAtt > 1:5341462/1‑93 (MQ=255) cTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCCGTTGCTGTACCGGGGACGCAttt > 2:7898152/1‑93 (MQ=255) ttGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTa > 1:8670156/1‑93 (MQ=255) ttAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAAtt > 1:7290587/1‑93 (MQ=255) aGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATTCTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCCGTTTCTGTACCGGGAACGTATTTCAtttc > 2:3425550/1‑91 (MQ=255) ggCTCGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTT‑CCTCGTCTCCCGG‑TGCTGTACCCGGAACGTATTTATTTgcc > 2:7794179/1‑93 (MQ=255) ggCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTccc < 2:2457542/93‑1 (MQ=255) gCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTcccc < 1:5066483/93‑1 (MQ=255) cGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGc < 2:416337/93‑1 (MQ=255) cGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGc > 2:8560758/1‑93 (MQ=255) gCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCa > 1:5915490/1‑93 (MQ=255) cTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAGCGTATTTAATTCCCCTGCAt < 2:7569534/93‑1 (MQ=255) cTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCAt > 2:7080223/1‑93 (MQ=255) cTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCAt < 1:8422240/93‑1 (MQ=255) tGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATc > 2:1040245/1‑93 (MQ=255) tGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATc > 1:5825187/1‑93 (MQ=255) gTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCg > 2:2339079/1‑93 (MQ=255) tttGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGc < 1:4409982/93‑1 (MQ=255) tttGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGc < 2:4791465/93‑1 (MQ=255) tgtgGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCAGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTACCCTGCATCGccc > 2:5303039/1‑93 (MQ=255) gtggtgATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCg < 1:1000518/93‑1 (MQ=255) gtgATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAt > 2:8766232/1‑93 (MQ=255) gtgATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCAt < 1:1342140/93‑1 (MQ=255) gtgATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGGACCGGGAACGGATTTAATTTCGCTGGATCGCCCGcgt > 1:7729957/1‑91 (MQ=255) gATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTc > 2:3737609/1‑93 (MQ=255) aTTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCt < 1:7419197/93‑1 (MQ=255) aaaaaaaaTACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGcc < 1:3426393/93‑1 (MQ=255) aaaaaaaaTACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGcc > 2:5409472/1‑93 (MQ=255) aaaaaaaTACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCCTCGCCCGCATTCTTGccc > 1:2073108/1‑92 (MQ=255) aaaaaaTACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGc > 1:8361686/1‑93 (MQ=255) aaaTACTGTAA‑CTCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATc < 1:4286286/93‑1 (MQ=255) aaaTACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATc < 2:2559028/93‑1 (MQ=255) aaTACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCt < 2:435927/93‑1 (MQ=255) aaTACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCt < 1:7128507/93‑1 (MQ=255) aaTACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCCGGTGCTGTACCCGGGACGGATTTAATTCCCCTTCATCGCCCGCCTTCTTTGCGCATCt > 2:3159140/1‑93 (MQ=255) tACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTc < 1:1517578/93‑1 (MQ=255) cTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTccc > 1:7962024/1‑93 (MQ=255) cTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGG‑TCCCCGGTGCTGTACCGGGGACGTATTTAATTTCCCTGCATCCCCCGCACTCTTTCCGCCTCTTccc > 2:6469069/1‑93 (MQ=255) tGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTcccc < 1:4132056/93‑1 (MQ=255) tGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTcccc < 2:6341402/93‑1 (MQ=255) a‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGc < 1:2756961/93‑1 (MQ=255) a‑CGCCTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGc > 1:5013074/1‑93 (MQ=255) ccTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTc > 2:7446677/1‑93 (MQ=255) cTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTca < 1:4788727/93‑1 (MQ=255) cTGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTca < 1:6559377/93‑1 (MQ=255) tGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCTGCCCCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCCGCGTcac > 1:4688037/1‑93 (MQ=255) tGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac > 1:332329/1‑93 (MQ=255) tGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac > 1:5544034/1‑93 (MQ=255) tGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac > 2:5178460/1‑93 (MQ=255) tGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac > 2:2872568/1‑93 (MQ=255) tGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac < 1:3519273/93‑1 (MQ=255) tGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcac > 1:6920523/1‑93 (MQ=255) tGACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGGTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCCGCGTcac > 2:1797432/1‑93 (MQ=255) gACG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTcaca > 2:5408864/1‑93 (MQ=255) aCG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTTTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCCTTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCacac > 1:6768582/1‑93 (MQ=255) aCG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCacac > 1:5648171/1‑93 (MQ=255) aCG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCacac < 1:1955330/93‑1 (MQ=255) cG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAcc < 2:6951913/93‑1 (MQ=255) cG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAcc < 1:7238045/93‑1 (MQ=255) cG‑ATTTTCCC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACAcc < 1:822006/93‑1 (MQ=255) ttttc‑CC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGaa > 1:5303738/2‑93 (MQ=255) ttttc‑CC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGaa < 1:1196137/92‑1 (MQ=255) tttc‑CC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAg > 2:7254778/1‑93 (MQ=255) tttc‑CC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAg < 2:1559482/93‑1 (MQ=255) | TGATGATCCTGCCAATTGCCTTGTTAACCGCTGGCTTGTTAGGCACGCTGTTTGTGGTGATTAAAAAAAAATACTGTAA‑CGCCTGACG‑ATTTT‑CC‑CGT‑TCCCGGTTGCTGTACCGGGAACGTATTTAATTCCCCTGCATCGCCCGCATTCTTGCCGCATCTTCCCCCGGCGTCACACCGAAG > NC_000913/3152152‑3152333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |