| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,237,242 | +C | intergenic (+55/‑342) | ygjT → / → ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,237,240 | 1 | . | C | 97.1% | 672.7 / 10.8 | 207 | intergenic (+53/‑344) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/3); new base C (152/49); total (155/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.68e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 | |||||||||||
Only 100 of 259 total aligned reads displayed.
CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑T‑C‑CTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑CCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325 | cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑c‑t < 2:1614004/93‑1 (MQ=255)cTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑c‑t > 2:456636/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑c‑t‑c‑c > 2:6157493/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑c‑t‑c‑c > 2:7560975/1‑93 (MQ=255) gggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑c‑t‑c‑c > 2:7772716/1‑93 (MQ=255) ggTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑c‑t‑c‑cc < 1:153687/93‑2 (MQ=255) gTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑c‑t‑c‑cct < 1:5578181/93‑3 (MQ=255) gTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑c‑t‑c‑cct > 1:3503662/1‑91 (MQ=255) gAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTt‑c‑t‑c‑cctct > 1:2844015/1‑89 (MQ=255) aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑cc < 2:1279228/93‑1 (MQ=255) aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑cc < 1:2939704/93‑1 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑ccc > 1:1056169/1‑92 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑ccc < 1:8097589/93‑2 (MQ=255) tATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑ccct < 1:6017870/93‑3 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑ccctt < 2:8183878/93‑4 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑cccttc > 2:4500010/1‑89 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCa > 1:8567951/1‑93 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCa < 1:6922953/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAg < 1:2241284/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAg > 1:1405344/1‑93 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAgg > 1:3361283/1‑93 (MQ=255) cATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAgg < 1:5104020/93‑1 (MQ=255) aTGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAggg > 2:6372184/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGga > 2:649361/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGga < 1:1808801/93‑1 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGgag > 2:5293184/1‑93 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGgaga < 2:5369290/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGgaga < 1:8009407/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag < 2:3841576/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag < 2:3030030/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag > 2:2496584/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag > 2:2311161/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag > 1:4169999/1‑93 (MQ=255) agcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAggg > 1:872610/1‑93 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 1:5959155/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:8300735/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg < 1:3930514/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGAATATTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTCCCCTGTCATTAACATGAGCCCCTTTTTCC‑C‑C‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg < 2:7966154/93‑1 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 1:3701105/1‑93 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggggg > 2:2757814/1‑92 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggggg > 1:7109481/1‑92 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt > 1:2379118/1‑93 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt > 2:737366/1‑93 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt < 2:4295460/93‑1 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 2:6600606/1‑93 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACTCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 1:8479552/93‑1 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 2:7043346/93‑1 (MQ=255) tGGATATTTTTTAATCTCCCAAAGCCGTTTACCCTGTCATAAACAGGGGCCCCTTTTTCC‑C‑C‑CTCTCCCTTCCGGGGAGAGGGTCGGGGTGAg < 2:142935/93‑1 (MQ=255) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 1:4835546/1‑93 (MQ=39) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑T‑CTCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGCGAgg > 2:3753781/1‑93 (MQ=255) gATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAggg > 2:4453088/1‑93 (MQ=38) aTAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGt < 1:2780858/93‑1 (MQ=38) aTAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGt > 1:982762/1‑93 (MQ=38) tAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTa > 1:1975820/1‑93 (MQ=38) aaTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGGaa > 2:5608109/1‑93 (MQ=38) aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAt > 1:4564920/1‑93 (MQ=38) aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGCGAGGGTAAt > 1:1353318/1‑93 (MQ=38) ttttAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAAttt > 2:8475974/1‑93 (MQ=38) aaTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCg > 1:4848055/1‑93 (MQ=37) aaTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCg > 2:4059785/1‑93 (MQ=38) aTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGc > 1:5287464/1‑93 (MQ=38) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCa > 2:8726790/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 1:7905921/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCAcc > 1:7481400/1‑93 (MQ=38) gCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCg > 2:3139656/1‑93 (MQ=38) ccTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGa > 1:6492667/1‑93 (MQ=38) ccTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGa > 1:6852744/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 2:1587881/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATg > 2:3693353/1‑93 (MQ=38) aaGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGc > 1:1665720/1‑93 (MQ=38) aGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCt > 2:2049596/1‑93 (MQ=38) aGCCGAGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGACGGGGCGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCt > 1:1084276/1‑93 (MQ=37) gCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTg > 1:5561461/1‑93 (MQ=38) gCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTg > 1:2156028/1‑93 (MQ=38) gCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTg > 1:924746/1‑93 (MQ=38) gCCGTGTAACCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTC‑C‑TCC‑CGCTCCCTTGCAGGGAGAGGCTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTg < 1:6336148/93‑1 (MQ=25) ccGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTgg > 2:5131656/1‑93 (MQ=37) ccGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTgg > 1:2990562/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 2:6882275/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 1:5590639/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGCGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 1:3169045/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 2:3373849/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 2:6953366/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 1:5677117/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGCAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 1:4592756/1‑93 (MQ=37) tACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGt > 2:4810386/1‑93 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGtt > 2:7672365/1‑93 (MQ=37) cccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑c > 1:7068863/1‑93 (MQ=37) cccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑c > 2:8445504/1‑93 (MQ=37) ccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑cc > 1:2570086/1‑93 (MQ=37) ccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑cc > 1:3839928/1‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑ccc > 1:7359755/1‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑ccc > 1:7133305/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑tccc > 1:3650100/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑tccc > 2:4873856/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑cccc > 1:7676275/1‑93 (MQ=37) gTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑CCCCt > 2:6007505/1‑93 (MQ=37) tCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGAGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑CCCCTc < 2:5806169/93‑1 (MQ=25) cACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑CCCCTCACCCTAACCctct > 2:1459732/1‑93 (MQ=18) tttt‑CTT‑C‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTCCCCCTCCCCCTAACCC‑CTccccc > 1:8212844/1‑92 (MQ=18) | CTGGGTGAATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑T‑C‑CTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGGGTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTT‑CCCCTCACCCTAACCCTCTCCCCA > NC_000913/3237148‑3237325 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |