| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,237,247 | +C | intergenic (+60/‑337) | ygjT → / → ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,237,245 | 1 | . | C | 99.5% | 695.6 / ‑4.0 | 207 | intergenic (+58/‑339) | ygjT/ygjU | putative transport protein/putative transport protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (155/51); total (155/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.51e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 | |||||||||||
Only 100 of 233 total aligned reads displayed.
ATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑T‑C‑CTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCT‑CTCCCCAAACGGG > NC_000913/3237156‑3237331 | aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑cc < 2:1279228/93‑1 (MQ=255)aTTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑cc < 1:2939704/93‑1 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑ccc > 1:1056169/1‑92 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑ccc < 2:4954202/93‑2 (MQ=255) ttATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑ccc > 2:6423947/1‑92 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑ccctt < 2:8183878/93‑4 (MQ=255) aTCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑ccctt > 1:6612306/1‑90 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑cccttc < 1:8022024/93‑5 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑cccttc < 2:1541975/93‑5 (MQ=255) tCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑c‑tcc‑ctct‑cccttc < 2:2196747/93‑5 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCa > 1:8567950/1‑93 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCa < 1:6922953/93‑1 (MQ=255) ggCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCa > 1:595993/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAg > 1:1920805/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAg < 1:8255112/93‑1 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAg > 1:1405344/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAg > 1:4338013/1‑93 (MQ=255) gCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAg < 1:2241284/93‑1 (MQ=255) aTGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAggg > 1:3883689/1‑93 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGga < 1:1808801/93‑1 (MQ=255) tGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGga < 2:6590917/93‑1 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGgag > 2:5293184/1‑93 (MQ=255) gATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGgag < 1:3090600/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGgaga < 1:160732/93‑1 (MQ=255) aTAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTCTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGgaga < 1:5186787/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag > 1:4169999/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag < 2:8453525/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag > 2:847868/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag > 2:8169961/1‑93 (MQ=255) tAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag < 2:3841576/93‑1 (MQ=255) tAAGCAGCGGAGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGagag < 1:8110658/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:5188893/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:8300735/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGt < 2:4044627/93‑1 (MQ=255) gcagcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTG‑C‑TCC‑CCCTCCCTCCCAGGGAGAGGGt < 1:3830153/93‑1 (MQ=255) agcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCg < 1:5659412/93‑1 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgg > 1:7089658/1‑93 (MQ=255) gcGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGATCgg < 2:2017042/93‑1 (MQ=255) gggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggg < 2:6971975/92‑1 (MQ=255) cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggg > 2:4813663/1‑93 (MQ=255) cGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggg < 2:1318381/93‑1 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 2:3315762/1‑93 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg > 1:3701105/1‑93 (MQ=255) ggggTGGATAATTTTTAATCGGCCTAAGCCGTTTCCCCTGTCATTAACATGAGCCCCGTTTTCC‑C‑C‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCgggg < 2:7918127/93‑1 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCggggg > 2:4661365/1‑92 (MQ=255) gggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGt > 1:2379118/1‑93 (MQ=255) ggTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTg > 2:6600606/1‑93 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACTCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 1:8479552/93‑1 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 1:592650/93‑1 (MQ=255) gTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGa < 2:7043346/93‑1 (MQ=255) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg > 1:1088677/1‑93 (MQ=39) tGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAg < 2:7531700/93‑1 (MQ=255) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 1:556869/1‑93 (MQ=39) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg > 1:2725519/1‑93 (MQ=39) ggATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑T‑CTCTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGCGAgg > 2:3753781/1‑93 (MQ=255) gATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAgg‑g > 1:2836080/1‑93 (MQ=38) aTAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑Gt > 1:982762/1‑93 (MQ=38) aTTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGCGAGG‑GTAAt > 1:1353318/1‑93 (MQ=38) tAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGGGAGG‑GTAATTTTTc > 1:7318244/1‑93 (MQ=38) aaTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GGAATTTTTCg > 1:3586924/1‑93 (MQ=37) aTCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGc > 1:5287464/1‑93 (MQ=38) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCa > 2:8726790/1‑93 (MQ=38) tCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCa > 1:484421/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCAcc > 1:7905921/1‑93 (MQ=38) tGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCAcc > 2:4492853/1‑93 (MQ=38) ccTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGa > 1:6852744/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATg > 2:2379293/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATg > 2:3693353/1‑93 (MQ=38) tAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATg > 1:7383410/1‑93 (MQ=38) aGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCt > 2:2516884/1‑93 (MQ=38) gCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGGGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTg > 1:924749/1‑93 (MQ=37) gCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTg > 1:3349017/1‑93 (MQ=38) gCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTg > 1:2156028/1‑93 (MQ=38) ccGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTgg > 2:5522127/1‑93 (MQ=37) ccGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTgg > 1:2990562/1‑93 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑CTT‑C‑CTCTCCCTTCCAGGGAGCGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTAGCACCGATGATgggg > 2:6882549/1‑91 (MQ=37) gtgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGcc > 1:5590639/1‑93 (MQ=37) tgtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCt > 2:2980458/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 1:898082/1‑93 (MQ=37) gtACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GCAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTg > 1:4592756/1‑93 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑tt > 2:7672365/1‑93 (MQ=37) aCCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑tt > 1:4774424/1‑93 (MQ=37) ccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑tttc > 2:3090658/1‑91 (MQ=37) ccTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTcc > 1:2570086/1‑93 (MQ=37) cTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTccc > 1:7133305/1‑93 (MQ=37) tGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTcccc > 1:7676276/1‑93 (MQ=37) gTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCt > 2:6007505/1‑93 (MQ=37) cATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GGAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑CTCCCCTCa > 2:4340661/1‑93 (MQ=25) aaCATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCCCAcccc > 1:8577614/1‑92 (MQ=25) aCATGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTcccccccccccc > 1:3478585/1‑91 (MQ=21) aTGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTGTTTCCCCCCCCCCTac > 1:6392989/1‑92 (MQ=21) tGAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCCAAcc > 1:7630958/1‑93 (MQ=21) gAGCACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTTCCCCCCCCCCCAccc > 1:4898269/1‑93 (MQ=21) cACCGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCccacccccacccccc > 1:393329/1‑90 (MQ=21) cGTTTT‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCC‑CTccc > 2:5858688/1‑93 (MQ=18) tttt‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCT‑CTCCCCa > 1:6046455/1‑93 (MQ=18) tttt‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCT‑CTCCCCa > 2:1458005/1‑93 (MQ=18) tttt‑C‑TCC‑CTCTCCCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCATAACCCT‑CTCCCCa > 2:5643340/1‑93 (MQ=17) cc‑ctct‑gccTACAGGGGGGGGGTGGGGGTGGGGATTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCT‑CTCCCCAAACggg < 2:4270120/92‑1 (MQ=18) c‑ctctcccTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCCCACCCCAACCCTCCCCCCCAAACggg > 1:7004584/1‑93 (MQ=21) | ATTATCGGCATGATAAGCAGCGGGGTGGATAATTTTTAATCTGCCTAAGCCGTGTACCCTGTCATTAACATGAGCACCGTTTT‑C‑T‑C‑CTCT‑CCTTCCAGGGAGAGGGTCGGGGTGAGG‑GTAATTTTTCGCACCGATGCTGGCCTG‑TTCCCCTCACCCTAACCCT‑CTCCCCAAACGGG > NC_000913/3237156‑3237331 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |