| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,448,541 | +C | intergenic (+46/‑92) | ytfQ → / → ytfR | putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,448,541 | 1 | . | C | 99.7% | 823.3 / ‑4.1 | 283 | intergenic (+46/‑92) | ytfQ/ytfR | putative LACI‑type transcriptional regulator/YtfR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base C (185/97); total (186/97) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.66e-01 | |||||||||||
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
ATACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CG‑‑G‑‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCGG > NC_000913/4448449‑4448624 | ccGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑Cgcgc > 1:2598731/1‑90 (MQ=255) cGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑Cgcgcc > 2:8626310/1‑89 (MQ=255) cGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑Cgcgcc < 1:6696060/93‑5 (MQ=255) agaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGc > 1:4045156/1‑93 (MQ=37) agaaTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGc > 1:3940437/1‑93 (MQ=37) agttAGAGAAAAAGAAAAATAGGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCTTGATGCAGCTTCGTAGGCAGGATAAGG‑‑CCCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGa < 2:6569639/91‑1 (MQ=19) aTTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGAt > 2:8302518/1‑93 (MQ=37) agagAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGt > 1:7401540/1‑93 (MQ=37) agagAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGt > 1:1676856/1‑93 (MQ=37) agagAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATACGGCGATGGt > 2:1011849/1‑93 (MQ=37) gagaAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTg > 2:6755069/1‑93 (MQ=37) agaagaagaAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGc > 2:3241828/1‑93 (MQ=37) gaagaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCa > 2:4708692/1‑93 (MQ=37) agaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTATGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGTCGATGGTGctct > 2:7842619/1‑93 (MQ=25) gaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTg > 1:2146213/1‑93 (MQ=37) gaagaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTg > 1:5255103/1‑93 (MQ=37) aagaaAAATATGGGGTATTGAGGTTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGa < 2:368690/93‑1 (MQ=25) aagaaAAATATGGGGTATTGAGGTTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGa < 1:4677894/93‑1 (MQ=25) agaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGaa < 1:548672/93‑1 (MQ=37) gaaAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAg > 2:2426577/1‑93 (MQ=37) aaaaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGGTAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAg < 1:6420096/92‑1 (MQ=37) aaaaaT‑TGGGATATTGGGGTTTGCTTTGCCTGGTGCCATTTCGTAGGCAGGATAGGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc < 2:6670500/93‑1 (MQ=12) aaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc < 1:8165233/93‑1 (MQ=37) aaaaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGcc > 2:4261009/1‑93 (MQ=37) aaTATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTg < 1:4754095/93‑1 (MQ=37) atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa > 2:305117/1‑93 (MQ=37) atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa > 1:6215627/1‑93 (MQ=37) atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa < 1:886803/93‑1 (MQ=37) atatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGa < 2:3486067/93‑1 (MQ=37) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGCTTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 1:3452369/1‑93 (MQ=25) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGCAC‑‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 2:1488424/1‑93 (MQ=37) tatGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGAt > 2:5198945/1‑93 (MQ=25) tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 2:1697984/1‑93 (MQ=25) tGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGc > 1:7536041/1‑93 (MQ=25) gggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGa > 1:4977551/1‑93 (MQ=25) ggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGAc < 1:4552495/93‑1 (MQ=25) ggTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGAc > 1:3062627/1‑93 (MQ=25) tATTGAGGTTTTCTATGCGTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGGCTCGCG‑‑CG‑‑C‑‑CGCATCGGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc < 2:8532653/93‑1 (MQ=21) tATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGc < 2:3916046/93‑1 (MQ=25) aTTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt > 2:8710589/1‑93 (MQ=25) aTTGAGGGTGGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCt < 1:5979014/93‑1 (MQ=25) tGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTa > 2:4471187/1‑93 (MQ=25) aGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAcc > 1:3400590/1‑93 (MQ=25) aGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAcc > 2:6939910/1‑93 (MQ=25) aGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTAcc < 1:3975537/93‑1 (MQ=25) ggTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACcgc < 1:2707275/93‑1 (MQ=25) ttGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGt < 1:1449261/93‑1 (MQ=25) gCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGAATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCt < 2:5588243/93‑1 (MQ=25) gCTATGCCTGATGCCGATTCGGAGGCCGGGTAAGG‑‑CGCTCGCG‑‑G‑‑CGGGTCCGGGGATGGTGCAGTGGAGGCTGAGGTGACGCTTACCGCGTCt > 2:8169798/1‑93 (MQ=255) cTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCtt > 1:6544935/1‑93 (MQ=25) cTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCtt < 1:4259088/93‑1 (MQ=25) cTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCtt < 1:4167028/93‑1 (MQ=25) tATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa > 2:4164534/1‑93 (MQ=21) tATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTa > 2:7297823/1‑93 (MQ=25) ttGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTAt < 1:5091800/92‑1 (MQ=25) tggCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAGGG‑‑CGCC‑‑CGC‑GC‑CGCACCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTAt < 2:6332948/91‑1 (MQ=21) aTGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTAt > 2:4045739/1‑93 (MQ=21) aTGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTAt > 2:6046984/1‑93 (MQ=25) tGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCTTGATGTGACGCTTACCGCGTCTTATc > 1:6043260/1‑93 (MQ=21) tGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGAGGCTTACCGCGTCTTAta > 1:7196502/1‑92 (MQ=21) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCTGATAAGG‑‑CGCT‑‑CG‑‑GGCCGCATCCGGCGATGGGGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa < 2:2106233/93‑1 (MQ=25) gCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCa > 1:77976/1‑93 (MQ=21) cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTTAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg > 2:2541881/1‑93 (MQ=21) cTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATg > 1:1164548/1‑93 (MQ=21) tGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGc > 2:5977489/1‑93 (MQ=21) gATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGcc < 1:835248/93‑1 (MQ=21) aTGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCt > 2:2690095/1‑93 (MQ=21) aTGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCt > 1:7945910/1‑93 (MQ=21) gCCGATGCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCG‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTAc < 1:2046844/93‑1 (MQ=18) ccGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACt > 2:2127818/1‑93 (MQ=21) cGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTg > 1:8688923/1‑93 (MQ=21) gATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTgg > 2:6417215/1‑93 (MQ=18) gATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTgg > 1:7718637/1‑93 (MQ=21) aTTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg > 2:1067615/1‑93 (MQ=21) aTTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg < 1:8524689/93‑1 (MQ=21) aTTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg < 2:2191645/93‑1 (MQ=18) aTTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg > 1:4135802/1‑93 (MQ=21) aTTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTggg > 2:5407564/1‑93 (MQ=18) ttggTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa < 1:1915117/90‑1 (MQ=18) ttCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa < 2:6515198/93‑1 (MQ=21) ttCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGa > 1:2810437/1‑93 (MQ=21) tCGTAGGCCGGATAAGT‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAg < 2:2948347/93‑1 (MQ=18) cGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGc > 2:7116679/1‑93 (MQ=21) gTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa > 1:3667557/1‑93 (MQ=21) gTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa > 2:4103854/1‑93 (MQ=21) gTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCa > 1:1310128/1‑93 (MQ=21) tAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCAc < 1:1033167/93‑1 (MQ=21) tAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCAc > 1:8564414/1‑93 (MQ=21) aGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACg > 1:5586184/1‑93 (MQ=21) aGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACg > 1:439387/1‑93 (MQ=21) aGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACg < 1:2925072/93‑1 (MQ=21) gCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCt > 2:3614103/1‑93 (MQ=21) ggATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTa > 2:4884956/1‑93 (MQ=21) gATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 1:7321512/1‑93 (MQ=21) gATAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTac > 2:5164730/1‑93 (MQ=21) tAAGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTacac > 1:6985110/1‑93 (MQ=25) ggcg‑‑cgcg‑‑cg‑‑c‑‑CGCAGCCGGCGATGGGGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCgg < 2:2231306/90‑1 (MQ=37) aaGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACAcc < 2:7437624/93‑1 (MQ=25) aGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCg > 1:32811/1‑93 (MQ=25) aGG‑‑CGCT‑‑CGC‑GC‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCg > 2:1303527/1‑93 (MQ=25) | ATACCGCAAAAGAAGAATTAGAGAAGAAGAAAAATATGGGGTATTGAGGGTTGCTATGCCTGATGCCGATTCGTAGGCCGGATAAGG‑‑CGCT‑‑CG‑‑G‑‑CGCATCCGGCGATGGTGCACTGAAGCCTGATGCGACGCTTACCGCGTCTTATCATGCCTACTGGGAGCACGCTTTACACCGG > NC_000913/4448449‑4448624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 18 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |