| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,129,733 | 0 | T | C | 66.5% | 262.5 / 223.8 | 242 | K118K (AAA→AAG) | flgA | FlgA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/40); new base C (68/93); total (109/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.22e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 258 total aligned reads displayed.
TGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACATTAACCTG > NC_000913/1129641‑1129825 | tGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGt > 2:6982475/1‑93 (MQ=255) cGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCa < 1:2232348/93‑1 (MQ=255) gggTGATAGATCGCGCACGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTAGCAGGGGATCCAGCCGTCGGCGTTTCAg > 2:7854641/1‑93 (MQ=255) gTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGtt < 1:6250749/93‑1 (MQ=255) gTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGtt < 1:8602016/93‑1 (MQ=255) tGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGttt < 1:989834/93‑1 (MQ=255) tGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGttt < 2:8433370/93‑1 (MQ=255) taTAGATCGCGCAGGATAATGTCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCAGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTg < 2:7604538/92‑1 (MQ=255) gATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTg > 1:1667253/1‑93 (MQ=255) gATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTg > 1:4792054/1‑93 (MQ=255) tAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGAc > 1:7320220/1‑93 (MQ=255) aGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACa < 2:5175375/93‑1 (MQ=255) gATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACAt < 2:6939858/93‑1 (MQ=255) aTCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACAtt > 2:7868103/1‑93 (MQ=255) tCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTg > 1:5965607/1‑93 (MQ=255) tCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTg < 2:6588889/93‑1 (MQ=255) cgcgCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGc < 1:3590752/93‑1 (MQ=255) cgcgCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGc < 1:6747909/93‑1 (MQ=255) gcgcAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGcc < 2:762599/93‑1 (MQ=255) cgcAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGcca < 1:7394719/93‑1 (MQ=255) gcAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGccag > 1:2933724/1‑93 (MQ=255) gcAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGccag > 2:557221/1‑93 (MQ=255) cAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGccagc > 2:7194153/1‑93 (MQ=255) cAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGccagc < 1:5602254/93‑1 (MQ=255) aGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGccagct > 2:3740097/1‑93 (MQ=255) aGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGccagct > 1:7146615/1‑93 (MQ=255) ggCTAATGGCATCGACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGccagctt < 2:6520495/93‑1 (MQ=255) ggCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGccagctt > 2:8677195/1‑93 (MQ=255) ggCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGccagctt > 1:5393701/1‑93 (MQ=255) ggCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGccagctt > 2:5952111/1‑93 (MQ=255) gCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGTTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGccagcttc > 1:6080859/1‑93 (MQ=255) tAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGccagcttcca < 1:5666460/93‑1 (MQ=255) tAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGccagcttcca < 2:1910399/93‑1 (MQ=255) tAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGccagcttcca > 1:501296/1‑93 (MQ=255) aaTGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGGATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGccagcttccag > 1:7859908/1‑93 (MQ=255) aTGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGccagcttccagc < 2:2299785/93‑1 (MQ=255) gCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCttt < 2:7469960/93‑1 (MQ=255) aTCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTtcc > 2:4894551/1‑93 (MQ=255) tCAACAAGTTGATTGATATCCAGCAGCGTACGCGGTGGGAGGGTATGCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTtcct > 1:8758427/1‑93 (MQ=255) tCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTtcct < 1:8455264/93‑1 (MQ=255) aacaaGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTtcctcc > 2:5350444/1‑93 (MQ=255) acaaGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTccc > 1:3082676/1‑93 (MQ=255) acaaGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTccc > 1:5459739/1‑93 (MQ=255) acaaGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTccc > 2:1568351/1‑93 (MQ=255) caaGTTGATTGATATCCAGCACCGTACTCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTcccc > 2:3342532/1‑93 (MQ=255) aGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCcgc > 2:3115051/1‑93 (MQ=255) aGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCcgc < 1:4262368/93‑1 (MQ=255) aGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCcgc > 2:5007445/1‑93 (MQ=255) tgatATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATgg < 2:2628189/93‑1 (MQ=255) tgatATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATgg < 1:2842637/93‑1 (MQ=255) atatCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGc < 1:6218188/93‑1 (MQ=255) tatCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCTCCGCGCAATGGGCa < 2:5471145/93‑1 (MQ=255) tatCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCCATGGGcc > 1:1920875/1‑92 (MQ=255) atCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGTAt < 1:3185476/93‑1 (MQ=255) tCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATc < 2:3216537/93‑1 (MQ=255) tCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATc < 2:1349201/93‑1 (MQ=255) tCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATc > 2:7903487/1‑93 (MQ=255) cAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATcgc < 1:6984494/93‑1 (MQ=255) cAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATcgc < 1:6045594/93‑1 (MQ=255) aGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATcgcg < 1:143521/93‑1 (MQ=255) ccGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCaa < 1:5177905/93‑1 (MQ=255) ccGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCaa < 2:1840296/93‑1 (MQ=255) ccGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCaa > 2:2992269/1‑93 (MQ=255) gTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCCTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAAcc > 2:5928519/1‑93 (MQ=255) aCGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACcac > 2:347794/1‑93 (MQ=255) aCGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACcac < 1:3560922/93‑1 (MQ=255) cgcgGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACcaca < 2:5385025/93‑1 (MQ=255) cgcgGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACcaca < 1:4739383/93‑1 (MQ=255) cgcgGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACcaca > 2:2807422/1‑93 (MQ=255) cgcgGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACcaca < 1:4012251/93‑1 (MQ=255) gcgGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACAt < 2:2858332/93‑1 (MQ=255) cgGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATa < 1:1498624/93‑1 (MQ=255) cgGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATa > 1:1944327/1‑93 (MQ=255) cgGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATa > 2:4014432/1‑93 (MQ=255) ggTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATaa < 2:8221382/93‑1 (MQ=255) ggTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATaa < 1:7929115/93‑1 (MQ=255) gTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAAt < 1:5254785/93‑1 (MQ=255) ggCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAAttt > 1:7049506/1‑93 (MQ=255) gCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTc > 2:4700292/1‑93 (MQ=255) gCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTc < 1:2442472/93‑1 (MQ=255) aGGGTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCt < 2:7311916/93‑1 (MQ=255) gTATCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCtgtg < 2:2511947/93‑1 (MQ=255) tATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTgg < 2:6196160/93‑1 (MQ=255) aTCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGc > 1:6647937/1‑93 (MQ=255) aTCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGc > 2:300803/1‑93 (MQ=255) aTCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGc < 1:6459268/93‑1 (MQ=255) tCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGcc < 2:3892505/93‑1 (MQ=255) tCCAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGcc > 1:3633090/1‑93 (MQ=255) cAGCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTg > 1:5064399/1‑93 (MQ=255) gCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTa < 2:210101/93‑1 (MQ=255) gCCGTCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTa > 2:3162093/1‑93 (MQ=255) cGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACa < 1:1035455/93‑1 (MQ=255) gTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACAt > 1:4583635/1‑93 (MQ=255) gTCCGCGTTTCAGGTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACAt > 2:4379922/1‑93 (MQ=255) tCCGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACAtt > 1:803008/1‑93 (MQ=255) ccGCGCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACATTa > 1:1000655/1‑93 (MQ=255) cgcgCTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACATTaa < 2:89630/93‑1 (MQ=255) tttCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACATTAACCTg > 2:2601413/1‑93 (MQ=255) tttCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACATTAACCTg > 1:7695001/1‑93 (MQ=255) tttCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACATTAACCTg > 2:8607324/1‑93 (MQ=255) | TGATCGGGTGATAGATCGCGCAGGCTAATGGCATCAACAAGTTGATTGATATCCAGCACCGTACGCGGTGGCAGGGTATCCAGCCGTCCGCGTTTCAGTTTGACATTGCCAGCTTCCAGCTTTCCTCCCCGCGCAATGGGCATCGCGGCAACCACATAATTTCCTGTGGCCTGTACATTAACCTG > NC_000913/1129641‑1129825 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |