Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,155,780 | A→G | T266A (ACC→GCC) | holB → | DNA polymerase III delta prime subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,155,780 | 0 | A | G | 98.9% | 917.8 / ‑5.5 | 269 | T266A (ACC→GCC) | holB | DNA polymerase III delta prime subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/2); new base G (148/118); total (149/120) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.88e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
CTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCAC > NC_000913/1155690‑1155869 | cTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGcc < 2:1639760/93‑1 (MQ=255) ttAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCa > 1:5027997/1‑93 (MQ=255) aaTCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAAt < 1:7445278/93‑1 (MQ=255) aaTCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAAt > 1:6720808/1‑93 (MQ=255) aTCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATg < 1:7717408/93‑1 (MQ=255) aTCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATg > 1:7088823/1‑93 (MQ=255) aTCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATg < 2:6683049/93‑1 (MQ=255) tCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGt > 1:2086021/1‑93 (MQ=255) tGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGa > 1:172025/1‑93 (MQ=255) gAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAt < 2:5188202/93‑1 (MQ=255) aCAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAtgt > 2:5352309/1‑93 (MQ=255) aCAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAtgt < 1:2859960/93‑1 (MQ=255) cAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGAtgtg > 2:2177450/1‑93 (MQ=255) cAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTACGCAGGTGGCCAATGTTGAtgtg > 2:6013799/1‑93 (MQ=255) aGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGcc > 2:6342363/1‑93 (MQ=255) cTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCgg < 2:7914927/93‑1 (MQ=255) ccGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGc > 1:5956184/1‑93 (MQ=255) ccGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGc > 2:1154180/1‑93 (MQ=255) gcgcGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTg > 2:6417634/1‑93 (MQ=255) gcgcGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTg < 1:4854099/93‑1 (MQ=255) cgcgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTgg < 1:1662110/93‑1 (MQ=255) gcgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGt < 2:8680195/93‑1 (MQ=255) gcgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGt < 2:4881888/93‑1 (MQ=255) gcgTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGt > 1:5069715/1‑93 (MQ=255) tttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGc > 1:2336087/1‑93 (MQ=255) tttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGc > 1:8279268/1‑93 (MQ=255) tttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGc < 1:3730067/93‑1 (MQ=255) ttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGcc > 1:653996/1‑93 (MQ=255) ttACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGcc < 2:7449189/93‑1 (MQ=255) tACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCg < 2:1237289/93‑1 (MQ=255) tACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCg < 1:6177877/93‑1 (MQ=255) cacTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGaa < 2:2869398/93‑1 (MQ=255) cacTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGaa > 1:5667682/1‑93 (MQ=255) acTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGTTGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAAc > 1:3462553/1‑93 (MQ=255) ctggctggCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACt < 2:5934242/93‑1 (MQ=255) tggctggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTg > 2:1722408/1‑93 (MQ=255) tggctggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTg < 1:3451954/93‑1 (MQ=255) ggctggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTgg > 2:2710179/1‑93 (MQ=255) gctggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGc > 2:5444071/1‑93 (MQ=255) tggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCaa > 1:5704629/1‑93 (MQ=255) tggcAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCaa > 2:3024731/1‑93 (MQ=255) cAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAAcc > 2:4478016/1‑93 (MQ=255) cAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAAcc > 2:8135243/1‑93 (MQ=255) aCGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCAt > 1:8798073/1‑93 (MQ=255) aCGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCAt > 1:536044/1‑93 (MQ=255) cGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATc < 2:140866/93‑1 (MQ=255) gTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCt > 2:4394497/1‑93 (MQ=255) ttGCTGATGGATGCGCTCAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGACCTGGCAAACCATCtt > 1:5216467/1‑93 (MQ=255) ttGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCtt < 2:2594594/93‑1 (MQ=255) ttGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCtt > 1:1682030/1‑93 (MQ=255) ttGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCtt > 1:6659000/1‑93 (MQ=255) ttGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGAGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGCACTGGCAAACCATCtt > 1:4042617/1‑93 (MQ=255) tGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCttt > 2:8269780/1‑93 (MQ=255) tGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCttt > 1:4109768/1‑93 (MQ=255) tGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCAAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAACCCATCttt < 2:1501205/93‑1 (MQ=255) gCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTtc < 2:2166035/93‑1 (MQ=255) gCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTtc < 2:8494943/93‑1 (MQ=255) gatggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTcc < 1:7193053/93‑1 (MQ=255) atggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTccc > 1:7991492/1‑93 (MQ=255) atggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTccc > 1:3141480/1‑93 (MQ=255) tggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCt < 1:8614239/93‑1 (MQ=255) tggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCt < 2:6920673/93‑1 (MQ=255) tggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCt < 1:473453/93‑1 (MQ=255) ggatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTc < 1:2327885/93‑1 (MQ=255) gatgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTcg < 1:4166941/93‑1 (MQ=255) tgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTcgcg > 1:6601734/1‑93 (MQ=255) tgCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGCCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTcgcg < 2:4208252/93‑1 (MQ=255) cgcTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGcc < 2:3817111/93‑1 (MQ=255) gcTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCt > 1:2483597/1‑93 (MQ=255) gcTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCt > 2:7107238/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGc > 1:1000416/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGc > 2:559355/1‑93 (MQ=255) tAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAACGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGc > 1:6921417/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCa < 2:3673741/93‑1 (MQ=255) aaaaCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCa > 2:2765027/1‑93 (MQ=255) aaaaCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCa > 2:1870754/1‑93 (MQ=255) aCGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGc > 2:8341334/1‑93 (MQ=255) cGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCt > 1:5452820/1‑93 (MQ=255) gCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCta < 2:4832135/93‑1 (MQ=255) gCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCta > 2:5250485/1‑93 (MQ=255) atcatGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATAc < 2:4678109/93‑1 (MQ=255) atGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTgg < 1:1253092/93‑1 (MQ=255) tGGTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTggg < 2:6173761/93‑1 (MQ=255) gTGCTGCGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTggggg < 1:4388475/93‑1 (MQ=255) gctgcGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGAt > 1:1151957/1‑93 (MQ=255) gctgcGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGAGCCTGCAGGCTATACTGGGGGAt < 1:2396900/93‑1 (MQ=255) ctgcGCAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATg > 1:3207269/1‑93 (MQ=255) gcgcAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGtt > 1:7895781/1‑93 (MQ=255) gcgcAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGtt > 2:2058684/1‑93 (MQ=255) cgcAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGttt < 1:3911916/93‑1 (MQ=255) cgcAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGttt > 1:7395909/1‑93 (MQ=255) cgcAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGttt > 2:7268631/1‑93 (MQ=255) cgcAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGttt < 2:7346821/93‑1 (MQ=255) gcAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGATCTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTg < 2:2388362/93‑1 (MQ=255) gcAGGTGGAGAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTg < 1:8533085/93‑1 (MQ=255) cAGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGc > 2:3443559/1‑93 (MQ=255) aGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGcc > 1:5011975/1‑93 (MQ=255) aGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGcc > 1:3807335/1‑93 (MQ=255) aGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGcc > 2:8013900/1‑93 (MQ=255) aGGTGGCCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGcc > 1:1927070/1‑93 (MQ=255) | CTTAATCATGAACAAGCTCCGGCGCGTTTACACTGGCTGGCAACGTTGCTGATGGATGCGCTAAAACGCCATCATGGTGCTGCGCAGGTGACCAATGTTGATGTGCCGGGCCTGGTCGCCGAACTGGCAAACCATCTTTCTCCCTCGCGCCTGCAGGCTATACTGGGGGATGTTTGCCAC > NC_000913/1155690‑1155869 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |