Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,926,421 | T→C | A57A (GCT→GCC) | sdaC → | putative serine transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,926,421 | 0 | T | C | 99.7% | 1321.6 / ‑5.3 | 378 | A57A (GCT→GCC) | sdaC | putative serine transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (178/199); total (178/200) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.73e-01 |
Only 100 of 387 total aligned reads displayed.
GGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGA > NC_000913/2926331‑2926510 | gggCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCAt < 2:3874208/93‑1 (MQ=255) gCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATcc > 1:7599707/1‑93 (MQ=255) ccTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCt < 1:8061037/93‑1 (MQ=255) cTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCtt > 2:3639692/1‑93 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTg < 2:4258333/93‑1 (MQ=255) tttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTg < 2:1942459/93‑1 (MQ=255) ttACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGc > 2:5144227/1‑93 (MQ=255) tACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCg > 2:689203/1‑93 (MQ=255) cggcacggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGtt > 2:5309534/1‑93 (MQ=255) cggcacggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGtt > 1:3983985/1‑93 (MQ=255) ggcacggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGTCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTc < 1:6031734/93‑1 (MQ=255) gcacggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTcc < 2:2152428/93‑1 (MQ=255) gcacggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGCATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTcc < 1:4162963/93‑1 (MQ=255) ccggcaAGCGGCGGGGGCGGGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCg < 1:4391816/92‑1 (MQ=255) acggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCg < 2:3072712/93‑1 (MQ=255) cggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGa > 2:2603974/1‑93 (MQ=255) ggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGAt < 1:2493481/93‑1 (MQ=255) ggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGAt < 2:5044453/93‑1 (MQ=255) ggcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATACCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGAt > 2:8714422/1‑93 (MQ=255) gcaATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATg > 1:1172438/1‑93 (MQ=255) caATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGa < 1:8655479/93‑1 (MQ=255) aaTCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGAc < 1:6389335/93‑1 (MQ=255) ggCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGttt < 2:1868588/93‑1 (MQ=255) ggCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGttt < 2:4450166/93‑1 (MQ=255) gcgcGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGtttt < 2:1262231/93‑1 (MQ=255) gcgGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGtttttt > 1:3578771/1‑93 (MQ=255) gggCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGc > 2:6738743/1‑93 (MQ=255) gggCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGc > 1:2747004/1‑93 (MQ=255) gCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTc < 1:624093/93‑1 (MQ=255) gCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTGTTTGCTc < 2:8650330/93‑1 (MQ=255) cGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCa < 1:8378933/93‑1 (MQ=255) cGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCa < 2:5854171/93‑1 (MQ=255) cGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCACCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCa < 1:1263281/93‑1 (MQ=255) gTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCAc < 2:60797/93‑1 (MQ=255) tGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCAcc > 2:4679930/1‑93 (MQ=255) tGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCAcc < 1:7024928/93‑1 (MQ=255) tGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCAcc > 2:6224323/1‑93 (MQ=255) gCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACcg > 2:6481908/1‑93 (MQ=255) tGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACcgcg > 1:2191876/1‑93 (MQ=255) tGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACcgcg > 1:2403665/1‑93 (MQ=255) gTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCgg > 1:6611707/1‑93 (MQ=255) cTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTg < 1:1444577/93‑1 (MQ=255) cgCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGa < 2:2340459/92‑1 (MQ=255) gCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGAc < 2:7456436/93‑1 (MQ=255) ccAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACt > 2:8099389/1‑93 (MQ=255) cAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTc < 1:4549769/93‑1 (MQ=255) cAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTc > 2:1474106/1‑93 (MQ=255) aTCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGc < 2:6645044/93‑1 (MQ=255) aTCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGc < 1:5867720/93‑1 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCt > 1:5569668/1‑93 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCt < 2:779214/93‑1 (MQ=255) tCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCt < 2:1751962/93‑1 (MQ=255) cAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCtt < 2:6254524/93‑1 (MQ=255) aaCGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTc > 1:5059272/1‑93 (MQ=255) aaCGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTc < 1:5774987/93‑1 (MQ=255) aCGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCg > 2:7139472/1‑93 (MQ=255) cGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGt > 1:7430089/1‑93 (MQ=255) tgtTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGCCTCGCTTCGTACTggc > 1:4964314/1‑91 (MQ=255) tGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTgg > 2:8291591/1‑93 (MQ=255) ggCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGt > 1:5084993/1‑93 (MQ=255) ggCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGt > 1:310415/1‑93 (MQ=255) ggCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGt > 2:8465429/1‑93 (MQ=255) gCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTa > 1:6817946/1‑93 (MQ=255) gCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTa < 2:3157199/93‑1 (MQ=255) ggTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTaaa > 1:3289916/1‑93 (MQ=255) gTATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTaaaa > 1:2069079/1‑93 (MQ=255) tATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTaaaaa > 2:1580566/1‑93 (MQ=255) tATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTaaaaa > 1:8486579/1‑93 (MQ=255) tATGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTaaaaa > 2:7349762/1‑93 (MQ=255) aTGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAc > 2:2075740/1‑93 (MQ=255) aTGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAc > 2:7615690/1‑93 (MQ=255) tGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAcc > 1:6301619/1‑93 (MQ=255) tGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAcc < 1:3878008/93‑1 (MQ=255) tGATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAcc > 2:2773995/1‑93 (MQ=255) gATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAccc > 1:7712995/1‑93 (MQ=255) gATCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAAccc < 1:5340070/93‑1 (MQ=255) aTCCCGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCg < 2:5680645/93‑1 (MQ=255) ccGCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCgcgc > 2:410782/1‑93 (MQ=255) gCTGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTGAAAACCCGGGCGa > 2:5390055/1‑93 (MQ=255) tGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAg > 1:7149293/1‑93 (MQ=255) tGATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAg > 1:7910657/1‑93 (MQ=255) gATCATCATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGa > 1:6475750/1‑93 (MQ=255) atcatcATGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGAc > 1:819857/1‑93 (MQ=255) tcatcaTGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACa > 1:1614263/1‑93 (MQ=255) tcatcaTGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACa > 2:7692566/1‑93 (MQ=255) tcatcaTGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGCGCGAAGACa > 1:3724637/1‑93 (MQ=255) catcatGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACAt > 2:5531030/1‑93 (MQ=255) catcatGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACAt < 2:6974638/93‑1 (MQ=255) catcatGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACAt > 1:317435/1‑93 (MQ=255) catcatGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACAt < 2:1685551/93‑1 (MQ=255) atcatGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATc < 1:1005633/93‑1 (MQ=255) atcatGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATc < 2:2467119/93‑1 (MQ=255) atcatGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATc > 2:2419122/1‑93 (MQ=255) tcatGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCa < 1:2827196/93‑1 (MQ=255) tcatGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCa < 1:7607860/93‑1 (MQ=255) catGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCAc < 1:7207036/93‑1 (MQ=255) atGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCAcc < 2:2541686/93‑1 (MQ=255) atGGCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCAcc < 2:818618/93‑1 (MQ=255) ggCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGa < 1:2919775/93‑1 (MQ=255) ggCCATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGa < 1:995638/93‑1 (MQ=255) | GGGCCTTTACGGCACGGCAATCGGCGCGGGCGTGCTGTTCCTGCCAATCAACGCCGGTGTTGGCGGTATGATCCCGCTGATCATCATGGCTATCCTTGCGTTCCCGATGACGTTTTTTGCTCACCGCGGCCTGACTCGCTTCGTACTGTCTGGTAAAAACCCGGGCGAAGACATCACCGA > NC_000913/2926331‑2926510 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |