Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,186,925 | A→G | T504A (ACT→GCT) | yqiG → | putative membrane protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,186,925 | 0 | A | G | 99.8% | 1373.3 / ‑5.0 | 393 | T504A (ACT→GCT) | yqiG | putative membrane protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (210/182); total (211/182) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.11e-01 |
Only 100 of 418 total aligned reads displayed.
TATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATACTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGTCTCCACTTCT > NC_000913/3186835‑3187014 | tCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAAtgcttc > 1:1679106/1‑92 (MQ=255) tCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAAtgctta > 2:2390432/1‑93 (MQ=255) tCAGAATGAAAAAGAGACTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAAtgctta < 1:6834164/93‑1 (MQ=255) cAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTCAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAAtgcttac < 2:6600950/93‑1 (MQ=255) aGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAAtgcttact > 2:6372009/1‑93 (MQ=255) gAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTg < 1:8380540/93‑1 (MQ=255) gAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTg > 1:4301889/1‑93 (MQ=255) aTGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTggg > 2:3031452/1‑93 (MQ=255) tGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGa > 2:7713924/1‑93 (MQ=255) tGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGa > 1:3056604/1‑93 (MQ=255) gAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGAc < 2:1594883/93‑1 (MQ=255) aaaaGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGc < 1:1910862/93‑1 (MQ=255) aaaaGAGAGTGATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGc < 2:1393439/93‑1 (MQ=255) aaaGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGcc < 2:2165737/93‑1 (MQ=255) aaGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCca > 2:7472859/1‑93 (MQ=255) aaGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCca > 1:2133779/1‑93 (MQ=255) agagagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcag > 2:8395796/1‑93 (MQ=255) agagagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcag > 2:6145903/1‑93 (MQ=255) agagagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcag > 1:3777132/1‑93 (MQ=255) agagagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcag < 2:4818249/93‑1 (MQ=255) agagagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcag < 1:62536/93‑1 (MQ=255) agagagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcac > 1:6003557/1‑92 (MQ=255) gagagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcagc < 1:8764055/93‑1 (MQ=255) agagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcagca < 2:2252054/93‑1 (MQ=255) agagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcagca < 1:4757104/93‑1 (MQ=255) agagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcagca < 1:5100458/93‑1 (MQ=255) agagTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCcagca < 2:3484637/93‑1 (MQ=255) gTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTa < 2:3408410/93‑1 (MQ=255) gTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTa < 2:200962/93‑1 (MQ=255) ttATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTaa < 2:7585417/93‑1 (MQ=255) tatTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAAtgt > 2:2900112/1‑93 (MQ=255) atTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAAtgtg > 2:8054853/1‑93 (MQ=255) ttGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGa < 2:3965295/93‑1 (MQ=255) ttGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGa > 2:7288153/1‑93 (MQ=255) tGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGaa > 1:4561123/1‑93 (MQ=255) tCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAatt > 2:4104254/1‑93 (MQ=255) tCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAatt > 1:6322070/1‑93 (MQ=255) aCGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAattat < 2:2544202/93‑1 (MQ=255) cGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAattatt < 1:8672872/93‑1 (MQ=255) gTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTc > 1:1577163/1‑93 (MQ=255) gTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTc > 2:8778826/1‑93 (MQ=255) tttAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCa < 2:5340450/93‑1 (MQ=255) tttAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCa > 2:1042622/1‑93 (MQ=255) tttAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCa > 2:2618965/1‑93 (MQ=255) ttAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCAt < 1:3451121/93‑1 (MQ=255) ttAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCAt < 2:5457377/93‑1 (MQ=255) tAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCAtt > 2:3692845/1‑93 (MQ=255) tAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCAtt < 2:2980366/93‑1 (MQ=255) aaCCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTa < 2:8179337/93‑1 (MQ=255) aCCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTAt > 1:1423084/1‑93 (MQ=255) aCCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGATC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTAt > 1:2564386/1‑93 (MQ=255) ccAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATc > 2:5655232/1‑93 (MQ=255) cAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCa > 1:75889/1‑93 (MQ=255) aGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCAc < 1:390184/93‑1 (MQ=255) gTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACt > 1:7981375/1‑93 (MQ=255) gTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACt < 2:8554122/93‑1 (MQ=255) tATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACtt > 2:3874487/1‑93 (MQ=255) aTCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTa < 1:7088145/93‑1 (MQ=255) aTCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTa > 1:6116864/1‑93 (MQ=255) aTCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTa > 2:5972552/1‑93 (MQ=255) aTCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTa < 1:2400471/93‑1 (MQ=255) cTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGc > 2:1256371/1‑93 (MQ=255) tGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCcg < 2:4280871/93‑1 (MQ=255) aaTCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCcgcg > 1:2239376/1‑93 (MQ=255) aTCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGa < 1:1014717/93‑1 (MQ=255) tCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGAt > 1:940547/1‑93 (MQ=255) tCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGAt > 1:5376097/1‑93 (MQ=255) cATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGAtt < 2:4498616/93‑1 (MQ=255) cATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGAtt < 1:645059/93‑1 (MQ=255) aTTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGAttt > 1:5734129/1‑93 (MQ=255) aTTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGAttt > 2:1005839/1‑93 (MQ=255) aTTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGAttt > 1:2000275/1‑93 (MQ=255) aaGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGa < 2:5247706/93‑1 (MQ=255) ggTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGata < 2:5135545/93‑1 (MQ=255) ggTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGata > 1:4473821/1‑93 (MQ=255) gTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGatat < 1:29303/93‑1 (MQ=255) gTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGatat > 1:2651614/1‑93 (MQ=255) gTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGatat > 2:475896/1‑93 (MQ=255) gTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGatat < 1:4933604/93‑1 (MQ=255) gTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGatat > 1:5850983/1‑93 (MQ=255) ttAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATc > 1:7000264/1‑93 (MQ=255) tAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCg < 2:7853344/93‑1 (MQ=255) tAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCg < 1:7658238/93‑1 (MQ=255) aaaTACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCgg > 1:2618151/1‑93 (MQ=255) aaTACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCggg < 2:5514775/93‑1 (MQ=255) aaTACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCggg > 2:2743388/1‑93 (MQ=255) tacatacGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGTGcc > 2:7432988/1‑93 (MQ=255) catccGTAAGTTT‑GCTCGGTAAGGCTTCCGGGGACGCCAGCAGTAATTTGAATTTTTCA‑TATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCAtt < 1:7316477/93‑1 (MQ=255) acGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTaa > 1:8043791/1‑93 (MQ=255) acGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTaa < 2:581718/93‑1 (MQ=255) cGTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTaaa > 1:621225/1‑93 (MQ=255) gTAAGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTaaaa > 1:4056294/1‑93 (MQ=255) aGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAAc > 2:6498735/1‑93 (MQ=255) aGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAAc > 1:3197291/1‑93 (MQ=255) aGTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAAc > 1:7505036/1‑93 (MQ=255) gTTTGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACg > 1:7769780/1‑93 (MQ=255) tttGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGt > 2:6930454/1‑93 (MQ=255) ttGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGtc < 1:6665626/93‑1 (MQ=255) tGGCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGtct < 2:1716702/93‑1 (MQ=255) gCTC‑GTAATGCTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGTCTcc > 2:4339229/1‑93 (MQ=255) | TATCAGAATGAAAAAGAGAGTTATATTGTCACGTTTAACCAGTATCTTGAATCATTAAGGTTAAATACATACGTAAGTTTGGCTC‑GTAATACTTACTGGGACGCCAGCAGTAATGTGAATTATTCATTATCACTTAGCCGCGATTTTGATATCGGGCCATTAAAAAACGTCTCCACTTCT > NC_000913/3186835‑3187014 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |