Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,310,422 | T→C | D133G (GAC→GGC) | rbfA ← | ribosome‑binding factor A |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,310,422 | 0 | T | C | 99.7% | 1170.2 / ‑5.4 | 341 | D133G (GAC→GGC) | rbfA | ribosome‑binding factor A |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); new base C (173/167); total (173/168) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.93e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.85e-01 |
Only 100 of 380 total aligned reads displayed.
CAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACC > NC_000913/3310332‑3310511 | cAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGccc < 2:5925054/93‑1 (MQ=255) aGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCATCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACAGCGACGACGAGGACGACTCATTAGccct > 1:1492098/1‑93 (MQ=255) aGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGccct > 1:4615098/1‑93 (MQ=255) aGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGccct > 1:8426689/1‑93 (MQ=255) gcgcATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGccctc > 2:906354/1‑93 (MQ=255) cgcATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGccctcc < 1:4779663/93‑1 (MQ=255) gcATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCcctcct < 1:224058/93‑1 (MQ=255) gcATCGATGCTGGACATAACCTGAGGCTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGAATCATTAGCcctcct > 2:7884482/1‑93 (MQ=255) ccATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCcctcct < 1:3259401/92‑1 (MQ=255) cATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCtt > 1:2385870/1‑93 (MQ=255) aTCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTg < 1:1122334/93‑1 (MQ=255) tCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGc > 2:3051014/1‑93 (MQ=255) tCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGc < 1:2514551/93‑1 (MQ=255) tCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGc > 1:6963952/1‑93 (MQ=255) cGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCt < 2:8646459/93‑1 (MQ=255) gTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTg < 1:3098402/93‑1 (MQ=255) ttGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTgt < 1:3150802/93‑1 (MQ=255) cTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTgtcgt > 2:2546437/1‑93 (MQ=255) tGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTgtcgtc < 1:915817/93‑1 (MQ=255) tGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTgtcgtc > 1:8198916/1‑93 (MQ=255) ggACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTcc < 1:1833172/93‑1 (MQ=255) ggACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTcc < 1:4942809/93‑1 (MQ=255) aCATACCCTGAGGTTTAGCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCgg < 1:2794469/93‑1 (MQ=255) aTACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATTGCGCGACCTCGACGACGAGGACGACTCATTAGCACTCCTTGCTGTCGTCCGGGt > 2:1248426/1‑93 (MQ=255) ccTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAac > 2:5434531/1‑93 (MQ=255) ccTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAac > 2:528245/1‑93 (MQ=255) tGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAacac > 2:8457010/1‑93 (MQ=255) tGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAacac > 1:7527885/1‑93 (MQ=255) gAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACacg > 1:7125906/1‑93 (MQ=255) aGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACacga > 2:2079225/1‑93 (MQ=255) ggTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACacgac > 1:8717240/1‑93 (MQ=255) ggTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACacgac > 2:4241753/1‑93 (MQ=255) gTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACacgacg > 1:6072602/1‑93 (MQ=255) gTTTATATAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGGGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCCGTCGTCCGGGGTAACatgaag > 2:8552169/1‑91 (MQ=255) tATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc < 2:3659134/93‑1 (MQ=255) tATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc > 1:8492025/1‑93 (MQ=255) tATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc < 1:2079219/93‑1 (MQ=255) tATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttc < 2:6409210/93‑1 (MQ=255) aTCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttct < 2:130818/93‑1 (MQ=255) aTCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttct > 1:8602266/1‑93 (MQ=255) tCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttctt < 2:3992468/93‑1 (MQ=255) tCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttctt < 2:8343861/93‑1 (MQ=255) tCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttctt < 1:6014375/93‑1 (MQ=255) accAGCAACAAAACGCGCATAATGCCGAGACCGAGACCACGAGGCCGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGCCGttctt < 2:7781061/92‑1 (MQ=255) ccAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttcttc > 2:625814/1‑93 (MQ=255) ccAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttcttc < 1:4298664/93‑1 (MQ=255) ccAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGttcttc < 2:5139289/93‑1 (MQ=255) cAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCg > 2:7978332/1‑93 (MQ=255) cAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCg > 1:1369284/1‑93 (MQ=255) aGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGt < 2:7442421/93‑1 (MQ=255) aGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGt > 2:6871751/1‑93 (MQ=255) aGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGt < 2:4638999/93‑1 (MQ=255) aGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGt > 1:7645530/1‑93 (MQ=255) gCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTc > 1:5317951/1‑93 (MQ=255) caacaaAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCa < 2:4111660/93‑1 (MQ=255) aaaaCGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGtt > 1:3875144/1‑93 (MQ=255) aaCGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTg < 2:812741/93‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTg < 1:8115146/93‑1 (MQ=255) aaCGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTg > 2:3895788/1‑93 (MQ=255) ccGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCTTGTTTGACCa > 2:1550110/1‑93 (MQ=255) ccGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCa < 2:4800825/93‑1 (MQ=255) ccGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCa < 1:6557917/93‑1 (MQ=255) cGTTAATGTCGCGGCCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCAc < 1:5144207/93‑1 (MQ=255) cGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCAc > 2:6640404/1‑93 (MQ=255) cGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCAc < 2:1886611/93‑1 (MQ=255) tAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCt < 1:5650046/93‑1 (MQ=255) aTGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTgg < 2:8394509/93‑1 (MQ=255) gcgaccgcgacGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTGCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCAcc > 2:7293232/1‑93 (MQ=255) cgaccgcgacGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCa < 1:7958704/93‑1 (MQ=255) gaccgcgacGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAg > 2:7070419/1‑93 (MQ=255) ccgcgacGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGt > 2:5798967/1‑93 (MQ=255) cgcgacGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGtt > 2:2840868/1‑93 (MQ=255) gcgacGACGAGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGttt < 2:7176956/93‑1 (MQ=255) gacgacgaGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGa < 1:3051178/93‑1 (MQ=255) cgacgaGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACa > 1:6364033/1‑93 (MQ=255) cgacgaGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACa < 1:1761758/93‑1 (MQ=255) gacgaGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACAt > 2:2361609/1‑93 (MQ=255) gacgaGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACAt < 2:7728032/93‑1 (MQ=255) acgaGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATg < 1:1222454/93‑1 (MQ=255) acgaGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATg < 1:8246176/93‑1 (MQ=255) acgaGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATg < 1:7396527/93‑1 (MQ=255) gaGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATgcg > 2:3078219/1‑93 (MQ=255) aGGACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATgcgc > 2:6553775/1‑93 (MQ=255) ggACGACTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCa > 1:1665152/1‑93 (MQ=255) gacgacTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCAt > 2:3545933/1‑93 (MQ=255) gacgacTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTCCGCCTTGTTTGACCACCCGGGTAACAGGGTTTGACATGCCCac > 2:4402677/1‑92 (MQ=255) gacTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATccc < 2:4915200/93‑1 (MQ=255) gacTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATccc > 2:4490969/1‑93 (MQ=255) gacTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATccc < 2:3302473/93‑1 (MQ=255) cacTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGGCCGGGTTAACACGACGGTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATccc < 2:2311688/92‑1 (MQ=255) acTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCt < 1:4113492/93‑1 (MQ=255) acTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCt > 1:3655949/1‑93 (MQ=255) cTCATTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCtt < 1:6570790/93‑1 (MQ=255) aTTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCaa < 2:2188259/93‑1 (MQ=255) aTTAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCaa > 2:6005236/1‑93 (MQ=255) ttAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAAc > 1:3995061/1‑93 (MQ=255) ttAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAAc < 1:7326078/93‑1 (MQ=255) ttAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAAc < 1:2601615/93‑1 (MQ=255) ttAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAAc > 1:6407677/1‑93 (MQ=255) tAGCCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAAcc < 1:6721489/93‑1 (MQ=255) | CAGCGCATCGTTGCTGGACATACCCTGAGGTTTATCCAGCAACAAAACGCCGTTAATGTCGCGACCGCGACGACGAGGACGACTCATTAGTCCTCCTTGCTGTCGTCCGGGTTAACACGACGTTCTTCGTCATGTTTGACCACGCTGGTCACCAGGTTTGACATGCGCATCCCTTCAACC > NC_000913/3310332‑3310511 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |