| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,471,916 | C→T | G92S (GGT→AGT) | rpsL ← | 30S ribosomal subunit protein S12 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,471,916 | 0 | C | T | 99.7% | 1204.8 / ‑5.7 | 342 | G92S (GGT→AGT) | rpsL | 30S ribosomal subunit protein S12 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (185/156); total (185/157) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 360 total aligned reads displayed.
GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCGA > NC_000913/3471826‑3472008 | gACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCg > 2:5421720/1‑93 (MQ=255) aCGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCgg < 2:1272474/93‑1 (MQ=255) cGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCggg < 2:1549754/93‑1 (MQ=255) gCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGa > 1:8139157/1‑93 (MQ=255) ttCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAgg > 2:5171528/1‑93 (MQ=255) tCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAggc > 1:7711810/1‑92 (MQ=255) cACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTc < 1:5211826/93‑1 (MQ=255) ccATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTa > 1:157053/1‑93 (MQ=255) aTACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAac > 2:2024122/1‑93 (MQ=255) aTACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAac > 2:747527/1‑93 (MQ=255) aTACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAac > 2:1817774/1‑93 (MQ=255) aTACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAac > 2:495308/1‑93 (MQ=255) tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAATCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGGCTTTAaca > 2:6017376/1‑93 (MQ=255) tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca > 1:6510531/1‑93 (MQ=255) tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca < 2:3769639/93‑1 (MQ=255) tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca < 1:95637/93‑1 (MQ=255) tACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAaca > 1:2150215/1‑93 (MQ=255) aCTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAacac < 2:6442518/93‑1 (MQ=255) aCTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGCCTTTAacac > 1:5925606/1‑93 (MQ=255) cTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACg > 2:3247116/1‑93 (MQ=255) ttGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGa > 2:4571239/1‑93 (MQ=255) ttGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGa < 2:3140265/93‑1 (MQ=255) ttGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGACTTTAACACgc > 1:1281999/1‑92 (MQ=255) tGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAc < 1:3855374/93‑1 (MQ=255) tGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAc < 1:7339210/93‑1 (MQ=255) ggAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTTACACGAcc > 2:359078/1‑93 (MQ=255) ggAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGAcc > 1:8462796/1‑93 (MQ=255) ggAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACAAGAcc > 1:3555468/1‑93 (MQ=255) aCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGcc > 1:5094675/1‑93 (MQ=255) aCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGcc < 1:2179126/93‑1 (MQ=255) aCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGcc > 1:1460692/1‑93 (MQ=255) aCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGCCTTTAACAcgcccgcc > 1:1981618/1‑93 (MQ=255) aCGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTAGGGAGGTCTTTAACACGACCGcc > 2:4736635/1‑93 (MQ=255) cGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCa < 1:691058/93‑1 (MQ=255) gAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCAc < 1:3232558/93‑1 (MQ=255) gAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCAc > 2:6107377/1‑93 (MQ=255) gCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACgg > 1:833312/1‑93 (MQ=255) ccTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACgga < 2:6896139/93‑1 (MQ=255) cTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggat > 1:2965268/1‑93 (MQ=255) cTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggac > 1:1835481/1‑92 (MQ=255) tGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatc < 2:7594958/93‑1 (MQ=255) tGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatc > 1:7093883/1‑93 (MQ=255) gCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatca > 1:2891029/1‑93 (MQ=255) ttACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcagg < 1:8202192/93‑1 (MQ=255) tACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcagga > 1:7855222/1‑93 (MQ=255) cGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcaggatc < 1:6399863/93‑1 (MQ=255) ggTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcaggatca > 2:2868131/1‑93 (MQ=255) ggTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACggatcaggatca > 1:108377/1‑93 (MQ=255) cTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACgg < 2:6959434/93‑1 (MQ=255) tttAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGa < 2:5529917/93‑1 (MQ=255) ttAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAg > 1:889308/1‑93 (MQ=255) tAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGt < 2:2575748/93‑1 (MQ=255) tAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGt < 2:4460324/93‑1 (MQ=255) agCCGGCGCAGCCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGACCACTCGGGAGGTCTTTAACACGCCCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCt < 1:2449353/92‑1 (MQ=255) gCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGGGCGCTc > 1:5792142/1‑93 (MQ=255) cGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTTTGGTAACTAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCt < 1:2237604/93‑1 (MQ=255) cGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCt > 2:7717939/1‑93 (MQ=255) ggAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTg < 2:536244/93‑1 (MQ=255) ggAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTg < 1:6787482/93‑1 (MQ=255) gAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGc > 2:6310536/1‑93 (MQ=255) gAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGc < 2:5613562/93‑1 (MQ=255) aGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACTACCGCCACGTATCCGGATCACGGAGCGCTCCTGCa > 1:6699822/1‑93 (MQ=255) aGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCa < 1:5966672/93‑1 (MQ=255) aGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCa < 2:4238346/93‑1 (MQ=255) gCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGGCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAg > 1:5487004/1‑93 (MQ=255) aGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAGCACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGt < 1:5578908/93‑1 (MQ=255) aGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGt > 1:4499465/1‑93 (MQ=255) gTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATAAGGATCACGGAGCGCTCCTGCAGGtt > 1:4820047/1‑93 (MQ=255) cAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTtgg > 2:6705647/1‑92 (MQ=255) aaGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTtgtg > 1:7772304/1‑93 (MQ=255) aGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGa > 1:4097564/1‑93 (MQ=255) gcgcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGAc < 1:7211438/93‑1 (MQ=255) gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt < 1:4990106/93‑1 (MQ=255) gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt < 1:7494130/93‑1 (MQ=255) gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt < 2:3922055/93‑1 (MQ=255) gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt < 1:2047153/93‑1 (MQ=255) gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt > 1:8002478/1‑93 (MQ=255) gcACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt < 1:5701445/93‑1 (MQ=255) gcACCAAGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCt > 2:3492205/1‑93 (MQ=255) ccacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTca > 2:1084807/1‑93 (MQ=255) cacGTACGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTcac < 2:2478313/93‑1 (MQ=255) gaCGGTGTGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCaccacc < 2:3001598/92‑1 (MQ=255) cGGTGTCGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGa < 2:157251/93‑1 (MQ=255) gtgtGGTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATg > 2:6825295/1‑93 (MQ=255) gtgGTAACGAACACTCGGGAGGCCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGtc > 2:4127197/1‑92 (MQ=255) ggTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAgg < 1:4800617/93‑1 (MQ=255) gTAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGa < 2:5836410/93‑1 (MQ=255) tAACGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGag > 1:4338642/1‑92 (MQ=255) tAAAGAACACTCGGGAGGTCTNTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGaa < 1:2673072/93‑1 (MQ=255) aaCGACAACTCGGGCGGTCTTTAACACTACCGCCTCAGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAg < 1:5622650/93‑1 (MQ=255) aCGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAgc > 2:8270750/1‑92 (MQ=255) cGAACACTCGGGATGGCTTTAAGACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCAATGTAGGAAGTc < 2:2803936/93‑1 (MQ=255) cGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAggc < 1:4186351/93‑3 (MQ=255) cGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTc < 2:1298220/93‑1 (MQ=255) cGAACACTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTc < 1:2549460/93‑1 (MQ=255) cacTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACtt > 2:8620107/1‑93 (MQ=255) cacTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACtt > 2:7303747/1‑93 (MQ=255) cacTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACtt > 2:6195440/1‑93 (MQ=255) cacTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACtt < 2:2316521/93‑1 (MQ=255) cacTCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACtt > 1:6802792/1‑93 (MQ=255) | GACGCTTCACGCCATACTTGGAACGAGCCTGCTTACGGTCTTTAACGCCGGAGCAGTCAAGCGCACCACGTACGGTGTGGTAACGAACACCCGGGAGGTCTTTAACACGACCGCCACGGATCAGGATCACGGAGTGCTCCTGCAGGTTGTGACCTTCACCACCGATGTAGGAAGTCACTTCGA > NC_000913/3471826‑3472008 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |