Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 28,729 | C→T | A119V (GCC→GTC) | dapB → | dihydrodipicolinate reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 28,729 | 0 | C | T | 99.4% | 1168.9 / ‑4.1 | 328 | A119V (GCC→GTC) | dapB | dihydrodipicolinate reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base T (158/167); total (160/168) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.39e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.18e-01 |
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
TCTCGCTTTTTGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGTG > NC_000913/28637‑28818 | gCTTTTTGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGat > 1:5693614/1‑93 (MQ=255) cTTTTTGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGatt > 2:6420812/1‑92 (MQ=255) cTTTTTGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGata < 2:6258838/93‑1 (MQ=255) tttttGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGatat > 2:8207778/1‑93 (MQ=255) tttttGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGatat < 2:4261862/93‑1 (MQ=255) tttttGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGatat < 1:430535/93‑1 (MQ=255) ttttGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATAtt < 1:7858586/93‑1 (MQ=255) tttGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAACCAAGCAATTCGTGCCGCCGCTGTCGATATTg > 2:7516058/1‑93 (MQ=255) ttGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGc < 1:2250964/93‑1 (MQ=255) gTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGa < 2:7301127/93‑1 (MQ=255) tCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGGAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGAt > 1:7916545/1‑93 (MQ=255) cGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGAtt < 1:5739765/93‑1 (MQ=255) gCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTg < 1:4720610/93‑1 (MQ=255) cAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTTGATATTGCGATTGTc > 2:543864/1‑93 (MQ=255) aGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCt < 2:6310119/93‑1 (MQ=255) aGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCt < 2:5205755/93‑1 (MQ=255) aGCATGGCAAAGGGATGGGGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCt > 2:7021946/1‑93 (MQ=255) gCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCtt > 2:3598204/1‑93 (MQ=255) gCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCtt < 1:462778/93‑1 (MQ=255) cATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCttt > 1:6732685/1‑93 (MQ=255) aTGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTtg > 1:6492224/1‑93 (MQ=255) gggATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAAt < 2:1921101/93‑1 (MQ=255) gggATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAAt > 2:8556545/1‑93 (MQ=255) gATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGTTATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAAttt > 1:7639372/1‑93 (MQ=255) aTGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAAtttt > 1:613514/1‑93 (MQ=255) aTGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAAtttt < 1:2573772/93‑1 (MQ=255) tGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTa > 1:7190898/1‑93 (MQ=255) tGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTa < 1:1239237/93‑1 (MQ=255) ggTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAg < 1:7557750/93‑1 (MQ=255) gTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGc > 2:1477256/1‑93 (MQ=255) gTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGc < 1:3757208/93‑1 (MQ=255) aTCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGtt > 2:2021851/1‑93 (MQ=255) tCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTg < 2:5535980/93‑1 (MQ=255) tCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTg > 1:3507240/1‑93 (MQ=255) tCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTg > 1:1380615/1‑93 (MQ=255) cGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTgg < 1:4456823/93‑1 (MQ=255) cGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTgg < 2:3963334/93‑1 (MQ=255) cGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTgg < 1:3091310/93‑1 (MQ=255) ggCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGc > 2:1259955/1‑93 (MQ=255) cACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGt < 2:7130557/93‑1 (MQ=255) aCTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGtt < 2:2796836/93‑1 (MQ=255) aCTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGtt > 1:2884132/1‑93 (MQ=255) aCTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGtt > 2:7372909/1‑93 (MQ=255) aCGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAAc > 2:6507344/1‑93 (MQ=255) aCGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAAc < 1:3251453/93‑1 (MQ=255) cGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACg > 1:6187298/1‑93 (MQ=255) cGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACg > 2:1362886/1‑93 (MQ=255) cGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACg > 2:5335974/1‑93 (MQ=255) gggTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTc > 1:5536780/1‑93 (MQ=255) ggTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCa < 1:8713876/93‑1 (MQ=255) ggTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCa < 2:436325/93‑1 (MQ=255) gTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCAt > 1:8575145/1‑93 (MQ=255) gTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCAt > 2:7711060/1‑93 (MQ=255) tttGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATg < 2:5159276/93‑1 (MQ=255) tttGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATg < 1:7015477/93‑1 (MQ=255) gctaaGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTa < 1:2003670/90‑1 (MQ=255) aCGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTa < 1:7775773/93‑1 (MQ=255) aCGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTa > 2:3556247/1‑93 (MQ=255) aCGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATGGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTa < 1:8320693/93‑1 (MQ=255) gAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAg < 1:8200153/93‑1 (MQ=255) aaGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgc > 1:849541/1‑93 (MQ=255) aaGCCGGTAAACAAGCAATTCGCGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgc < 2:450053/93‑1 (MQ=255) aGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgct < 2:2418049/93‑1 (MQ=255) aGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCAGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgct < 1:2479225/93‑1 (MQ=255) cGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgctgct > 2:1741663/1‑93 (MQ=255) cGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAgctgcg > 1:1869306/1‑92 (MQ=255) gTAAACAAGCAATTCGTGACGCCACTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTgg < 2:5991859/93‑1 (MQ=255) gTAAACAAGCAATTCGTGACGCCACTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTgg > 2:2133778/1‑93 (MQ=255) tAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGga > 1:5485841/1‑93 (MQ=255) tAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGga < 1:5978705/93‑1 (MQ=255) aCAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGaa > 1:8384252/1‑93 (MQ=255) aCAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGaa > 1:958227/1‑93 (MQ=255) cAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGaaa < 2:1557150/93‑1 (MQ=255) cAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGaaa < 2:309330/93‑1 (MQ=255) cAAGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGaaa < 2:2633248/93‑1 (MQ=255) aaGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAag < 2:6885659/93‑1 (MQ=255) aGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagc > 2:5020486/1‑93 (MQ=255) aGCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagc > 1:3543167/1‑93 (MQ=255) gCAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagca > 2:6728810/1‑93 (MQ=255) cAATTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagcag > 2:3453858/1‑93 (MQ=255) aaTTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAagcagc < 1:3489788/93‑1 (MQ=255) aTTCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGcc > 2:2325783/1‑93 (MQ=255) ttCGTGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGCCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCa < 2:8545001/93‑1 (MQ=255) tGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGt < 2:6768829/93‑1 (MQ=255) tGACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGt > 1:4788121/1‑93 (MQ=255) gACGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTg > 1:1582897/1‑93 (MQ=255) aCGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGa > 2:7987861/1‑93 (MQ=255) aCGCCGCTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGa > 2:1659634/1‑93 (MQ=255) cgccgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGAt < 2:4566680/93‑1 (MQ=255) cgccgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGAt < 1:172928/93‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATg < 1:2954083/93‑1 (MQ=255) gccgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATg < 1:5314431/93‑1 (MQ=255) ccgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATgg > 1:3333359/1‑93 (MQ=255) cgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATggg < 2:3039982/93‑1 (MQ=255) cgcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATggg < 2:681890/93‑1 (MQ=255) gcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGt > 1:2062739/1‑93 (MQ=255) gcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGt < 1:3928837/93‑1 (MQ=255) gcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGt < 1:490002/93‑1 (MQ=255) gcTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGt < 1:1075642/93‑1 (MQ=255) cTGTCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCCGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGTg > 2:7818980/1‑93 (MQ=255) | TCTCGCTTTTTGTCGCCAGCATGGCAAAGGGATGGTGATCGGCACTACGGGGTTTGACGAAGCCGGTAAACAAGCAATTCGTGACGCCGCTGCCGATATTGCGATTGTCTTTGCTGCCAATTTTAGCGTTGGCGTTAACGTCATGCTTAAGCTGCTGGAGAAAGCAGCCAAAGTGATGGGTG > NC_000913/28637‑28818 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |