Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,923,014 | A→G | I83T (ATA→ACA) | gidA ← | glucose‑inhibited division |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,923,014 | 0 | A | G | 99.3% | 1009.2 / ‑5.1 | 290 | I83T (ATA→ACA) | gidA | glucose‑inhibited division |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (133/155); total (134/156) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 302 total aligned reads displayed.
TCCAGCGCCGTACGTACCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTATCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTCCCAATA > NC_000913/3922924‑3923103 | tcCAGCGCCGTACGTACCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTc < 1:6390629/93‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGTACGTACCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTcc > 1:4444922/1‑93 (MQ=255) cAGCGCCGTACGTACCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCt > 2:7950768/1‑93 (MQ=255) cAGCGCCGTACGTACCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCt > 2:104583/1‑93 (MQ=255) gcgcCGTACGTACCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTaa < 2:59372/93‑1 (MQ=255) gcCGTACGTACCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAAc < 2:7421941/93‑1 (MQ=255) gcCGTACGTACCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAAc < 2:2787579/93‑1 (MQ=255) cgtacgtaCCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTg < 2:3996587/93‑1 (MQ=255) cgtacgtaCCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCGTGCGTTTAGTGTCCGAAACTg < 1:3061958/93‑1 (MQ=255) gtacgtacCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTgg > 2:1784753/1‑93 (MQ=255) tacCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATAcc < 1:162382/93‑1 (MQ=255) tacCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATAcc > 1:5447991/1‑93 (MQ=255) tacCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATAcc < 1:3124860/93‑1 (MQ=255) tacCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATAcc < 1:4526562/93‑1 (MQ=255) tacCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTACTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATAcc > 2:3015471/1‑93 (MQ=255) tccGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATAccc < 1:7177333/92‑1 (MQ=255) acCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATAccc < 2:3253340/93‑1 (MQ=255) acCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATAccc > 2:1372975/1‑93 (MQ=255) cccccTGCCGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCg < 2:2217835/90‑1 (MQ=255) ccTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCt > 1:5755262/1‑93 (MQ=255) ccTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCt < 2:8145046/93‑1 (MQ=255) cTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTg > 1:1100252/1‑93 (MQ=255) cTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTg < 2:6632238/93‑1 (MQ=255) tGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTga > 1:1134037/1‑93 (MQ=255) gACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTgat < 1:1044589/93‑1 (MQ=255) gACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTgat > 2:4567492/1‑93 (MQ=255) gACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTgat < 2:7778106/93‑1 (MQ=255) ggTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTgatcga < 2:2175723/93‑1 (MQ=255) ggagagCACCCGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTgatcgat < 2:3528515/91‑1 (MQ=255) tAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTgatcgatc < 2:4834420/93‑1 (MQ=255) tAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTgatcgatc < 1:4763754/93‑1 (MQ=255) gagCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGc > 2:2954731/1‑93 (MQ=255) agCCCACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCt < 2:6603811/93‑1 (MQ=255) agCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCt < 1:7962744/93‑1 (MQ=255) acacGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTc > 1:6123228/1‑93 (MQ=255) acacGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTc < 2:3429395/93‑1 (MQ=255) acacGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTc > 1:7403245/1‑93 (MQ=255) cacGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCg > 2:6051695/1‑93 (MQ=255) gATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCa < 1:1993460/93‑1 (MQ=255) caTCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATCCCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCa < 1:6742553/92‑1 (MQ=255) aTCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCac > 1:6242970/1‑92 (MQ=255) aTCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCAt < 2:5134636/93‑1 (MQ=255) aTCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCAt < 2:7986189/93‑1 (MQ=255) tCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATc < 2:206825/93‑1 (MQ=255) ccGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCa < 2:5176759/93‑1 (MQ=255) cGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAg < 1:2058612/93‑1 (MQ=255) ccTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGAc > 1:4034739/1‑93 (MQ=255) ccTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGAc > 2:1707444/1‑93 (MQ=255) ccTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGAc < 1:950923/93‑1 (MQ=255) ccTGAGCGCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGAc < 1:3171065/93‑1 (MQ=255) cTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGAcc < 2:4598689/93‑1 (MQ=255) tGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTTGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGAccg > 2:7524633/1‑93 (MQ=255) gAGTTCGCGTACCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGAccgc < 2:6208826/93‑1 (MQ=255) gCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGAccgccg > 2:4321664/1‑93 (MQ=255) gCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGAccgccg > 1:8169645/1‑93 (MQ=255) cTCGGTGAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGa < 2:5672008/93‑1 (MQ=255) gcGGGTACCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAg < 2:7173937/92‑1 (MQ=255) cGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGt > 2:7584573/1‑93 (MQ=255) cGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGt < 1:8593665/93‑1 (MQ=255) ggTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGc > 1:6564945/1‑93 (MQ=255) gTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCa < 1:5312692/93‑1 (MQ=255) aGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATc < 2:5267919/93‑1 (MQ=255) cgAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCAct > 1:4386489/1‑93 (MQ=255) gAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCActt > 2:4436168/1‑93 (MQ=255) aaCCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCActtc > 1:6319631/1‑93 (MQ=255) aaCCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCActtc > 2:1857695/1‑93 (MQ=255) aCCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCActtct > 2:702488/1‑93 (MQ=255) ccgccgGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCActtctt > 1:3346567/1‑93 (MQ=255) gccgGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCtttt > 2:3199325/1‑93 (MQ=255) ccgGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTa < 1:3748831/93‑1 (MQ=255) cgGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTAc < 1:5034483/93‑1 (MQ=255) ggTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTGCTTTAcc > 1:8276426/1‑93 (MQ=255) ggTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTAcc > 2:2555409/1‑93 (MQ=255) gTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCa > 2:6522660/1‑93 (MQ=255) gTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCa > 2:5340330/1‑93 (MQ=255) gTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCa < 2:1229239/93‑1 (MQ=255) gTCCTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCa > 1:6917382/1‑93 (MQ=255) ccTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGa > 1:3424494/1‑93 (MQ=255) ccTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGa > 2:1933393/1‑93 (MQ=255) ccTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGa > 2:6427880/1‑93 (MQ=255) cTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGAt > 1:1363846/1‑93 (MQ=255) cTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGAt > 2:1656834/1‑93 (MQ=255) cTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGAt > 1:2994238/1‑93 (MQ=255) cTTTGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGAt > 1:22905/1‑93 (MQ=255) tttGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATg > 2:6107380/1‑93 (MQ=255) tttGCTTGCGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATg < 2:856179/93‑1 (MQ=255) gcttgcGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTcc > 1:7558883/1‑93 (MQ=255) tttgcCTTTGGTGTCCTAAACGGCATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTccc < 2:7345493/92‑1 (MQ=255) cttgcGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTccc > 1:3816095/1‑93 (MQ=255) ttgcGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCt < 1:2661332/93‑1 (MQ=255) ttgcGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCt < 1:1242129/93‑1 (MQ=255) gcGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTc > 2:3109114/1‑93 (MQ=255) gcGTTTAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTc > 1:3486356/1‑93 (MQ=255) tttAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTCCCa > 1:8677574/1‑93 (MQ=255) ttAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCTACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTCCCaa > 1:3936018/1‑93 (MQ=255) tAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTCCCAAt > 2:499185/1‑93 (MQ=255) tAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTCCCAAt > 1:2836668/1‑93 (MQ=255) tAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTCCCAAt < 2:3656035/93‑1 (MQ=255) tAGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTCCCAAt > 1:7468070/1‑93 (MQ=255) aGTGTCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTCCCAATa < 1:496698/93‑1 (MQ=255) | TCCAGCGCCGTACGTACCGCCTGACGGTAGAGCACACGATCCGCCTGAGCTCGGGTAGCGCGAACCGCCGGTCCTTTGCTTGCGTTTAGTATCCTAAACTGGATACCCGCCTGATCGATCGCTTTCGCCATCAGACCGCCGAGTGCATCCACTTCTTTTACCAGATGTCCCTTCCCAATA > NC_000913/3922924‑3923103 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |