Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,362,298 | T→C | Q108R (CAG→CGG) | dsbD ← | thiol:disulfide interchange protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,362,298 | 0 | T | C | 99.4% | 1164.7 / NA | 344 | Q108R (CAG→CGG) | dsbD | thiol:disulfide interchange protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/1); major base C (193/148); minor base G (0/2); total (193/151) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.91e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 365 total aligned reads displayed.
AACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGC > NC_000913/4362208‑4362387 | acggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGt > 2:7170146/1‑93 (MQ=255) cggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGtt > 2:4161781/1‑93 (MQ=255) cggaacggTTTTGGTATATGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACCGCCCTGGTAGGTGACAGTAAACGTCGCTCCCGAACTCGCCCGGtt < 2:7823957/93‑1 (MQ=255) ggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTg > 2:7913910/1‑93 (MQ=255) ggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTg > 1:5449860/1‑93 (MQ=255) ggaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTg > 2:1952823/1‑93 (MQ=255) gaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGa > 1:6286549/1‑93 (MQ=255) gaacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGa > 1:8661745/1‑93 (MQ=255) aacggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGAt > 1:717069/1‑93 (MQ=255) cggTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATgg > 1:8464579/1‑93 (MQ=255) gTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGTTGGTg > 2:7348724/1‑93 (MQ=255) gTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTACCGCACTCGCCCGGTTGATGGTg > 1:4435035/1‑93 (MQ=255) ttttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGa > 2:3935485/1‑93 (MQ=255) ttttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGCCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGa > 1:8181102/1‑93 (MQ=255) tttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGAc > 1:2877268/1‑93 (MQ=255) ttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACg > 2:5738164/1‑93 (MQ=255) ttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACg > 1:5791325/1‑93 (MQ=255) ttGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACg < 1:3959459/93‑1 (MQ=255) ggTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACggg > 2:4963922/1‑93 (MQ=255) gTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGa < 2:5636986/93‑1 (MQ=255) gTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGa < 2:4214424/93‑1 (MQ=255) tttCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGaa < 1:1611119/93‑1 (MQ=255) tCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGc > 1:6154338/1‑93 (MQ=255) tGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCgc > 2:4091490/1‑92 (MQ=255) tGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGt < 1:2134504/93‑1 (MQ=255) cGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAg < 2:7440734/93‑1 (MQ=255) ggATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGc < 2:3161303/93‑1 (MQ=255) gATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGcc > 1:3777055/1‑93 (MQ=255) tAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGa > 1:4923639/1‑93 (MQ=255) aCAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATc > 1:7762927/1‑93 (MQ=255) aGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATcgc > 1:1692392/1‑93 (MQ=255) aGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATcgc > 1:3207741/1‑93 (MQ=255) gAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATcgcg < 2:1072741/93‑1 (MQ=255) gAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATcgcg > 1:6540755/1‑93 (MQ=255) aaaCCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCgg > 2:1723302/1‑93 (MQ=255) aaCCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCgga > 2:1280580/1‑92 (MQ=255) aaCCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGt < 2:2384845/93‑1 (MQ=255) cGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTaaa > 2:7634024/1‑93 (MQ=255) ggCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAt > 2:883704/1‑93 (MQ=255) gCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtc < 1:6940724/93‑1 (MQ=255) cATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtct < 2:215319/93‑1 (MQ=255) aTCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAAtctc > 1:7904639/1‑93 (MQ=255) cAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGc < 1:5677698/93‑1 (MQ=255) aGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCt > 1:3419371/1‑93 (MQ=255) aGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCt > 1:4095417/1‑93 (MQ=255) gCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtt > 1:6063731/1‑93 (MQ=255) gCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtt < 2:8484367/93‑1 (MQ=255) gCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCtt > 1:4162402/1‑93 (MQ=255) caGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTGGCTTTTg > 1:6888280/1‑93 (MQ=255) caGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTg > 2:3878761/1‑93 (MQ=255) aGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGc < 1:8025815/93‑1 (MQ=255) aGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGc < 1:8136176/93‑1 (MQ=255) aGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGc > 1:3702696/1‑93 (MQ=255) gCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGcc > 1:928721/1‑93 (MQ=255) gCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGcc > 2:3669943/1‑93 (MQ=255) tGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTaa > 1:3930349/1‑93 (MQ=255) ggTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTaaa > 1:2604667/1‑93 (MQ=255) ggTAGGTCACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTaaa < 2:3521291/93‑1 (MQ=255) gTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTaaaa > 1:668427/1‑93 (MQ=255) gTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTaaaa < 2:3251143/93‑1 (MQ=255) tAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAAc > 2:2840484/1‑93 (MQ=255) ggTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTc < 2:7144213/93‑1 (MQ=255) ggTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTc > 2:5811280/1‑93 (MQ=255) ggTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTc > 2:5615690/1‑93 (MQ=255) gTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCa > 2:6948482/1‑93 (MQ=255) gTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCa < 1:6591204/93‑1 (MQ=255) tGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCAt > 1:7041398/1‑93 (MQ=255) gACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATc < 2:2581807/93‑1 (MQ=255) aCAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCt > 2:7540555/1‑93 (MQ=255) aCAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCAGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCt < 1:5262788/93‑1 (MQ=255) aGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTc > 1:130160/1‑93 (MQ=255) gTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTct > 1:7656230/1‑92 (MQ=255) gTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCa > 1:7479624/1‑93 (MQ=255) ttAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCAt > 1:1160187/1‑93 (MQ=255) ttAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCAt > 1:2751736/1‑93 (MQ=255) ttAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCAt < 1:2394210/93‑1 (MQ=255) tAACGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCATCAGCCGAACGCGGTTAATCTCGCTTTTGACGTAAGACTCATCTTCAta > 2:4488087/1‑92 (MQ=255) cGTCGCTCCCGCCCTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAGTCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCa < 2:5496410/93‑1 (MQ=255) cGTCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCa > 1:5322809/1‑93 (MQ=255) tCGCTCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGa > 1:4752806/1‑93 (MQ=255) gcccccGCCCTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGCCg < 2:6309989/90‑1 (MQ=255) tCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGcc > 1:5031250/1‑93 (MQ=255) tCCCGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGcc < 1:4842385/93‑1 (MQ=255) ccGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCtt > 1:4054653/1‑93 (MQ=255) ccGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCtt < 1:2980805/93‑1 (MQ=255) cGCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTg < 2:6663330/93‑1 (MQ=255) gCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGc < 2:5925472/93‑1 (MQ=255) gCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGc < 1:2014046/93‑1 (MQ=255) gCACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGc > 1:880843/1‑93 (MQ=255) ccccTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGc < 2:875917/90‑1 (MQ=255) cACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCg < 2:2482055/93‑1 (MQ=255) cACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCg < 1:4244805/93‑1 (MQ=255) cACTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCg > 2:8263064/1‑93 (MQ=255) aCTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCgg > 2:3723562/1‑93 (MQ=255) cTCGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGGAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACACCTTGCGGc > 2:3106227/1‑93 (MQ=255) ccGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCa < 1:3303720/92‑1 (MQ=255) cGCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAg < 2:5075056/93‑1 (MQ=255) gCCGGGTGGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGc < 2:4679544/93‑1 (MQ=255) gCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGc < 1:3057851/93‑1 (MQ=255) gCCCGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGc < 2:1398334/93‑1 (MQ=255) | AACGGAACGGTTTTGGTTTCTGGCGGATAACAGAAACCGGCATCAGCACAGCCCTGGTAGGTGACAGTTAACGTCGCTCCCGCACTCGCCTGGTTGATGGTGACGGGAAGCGTCAGCCGATCGCGGTAAATCTCGCTTTTGCCGTAAAACTCATCTTCATGCCAGACGCCTTGCGGCAGC > NC_000913/4362208‑4362387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |