Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,555,245 | T→C | Y205C (TAC→TGC) | yjiE ← | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,555,245 | 0 | T | C | 99.5% | 1449.1 / ‑4.2 | 418 | Y205C (TAC→TGC) | yjiE | putative transcriptional regulator LYSR‑type |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (200/216); total (201/217) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01 |
Only 100 of 432 total aligned reads displayed.
TTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGG > NC_000913/4555155‑4555334 | tttAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTTGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAg < 2:5418420/93‑1 (MQ=255) ttAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAgg < 1:96483/93‑1 (MQ=255) aaaaGCTCGCTCATCGAAGAGGCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAg > 1:183136/1‑93 (MQ=255) aaaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAg > 1:4326736/1‑93 (MQ=255) aaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGt > 2:7681917/1‑93 (MQ=255) aaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGt < 2:6595942/93‑1 (MQ=255) aaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGt > 2:5936316/1‑93 (MQ=255) aaaGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGt > 2:4119120/1‑93 (MQ=255) aGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTg > 2:1805569/1‑93 (MQ=255) gctcgctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGc < 1:1036704/93‑1 (MQ=255) gctcgctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGc < 1:6034672/93‑1 (MQ=255) tcgctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCgg > 1:7783189/1‑93 (MQ=255) tcgctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCgg > 1:3243485/1‑93 (MQ=255) ctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTg > 2:4272315/1‑93 (MQ=255) ctcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTg > 1:1715429/1‑93 (MQ=255) tcATCGAAGAGACAAAAAAGGTTCTGAAACTTAACTCACTGTTTCTCGTCAGTGTGCGATTATTTTATCGCCCTATGCAGGAGTTGCGGCTGt > 2:7796270/1‑93 (MQ=255) tcATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGt < 2:387573/93‑1 (MQ=255) cATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTa > 2:5009491/1‑93 (MQ=255) cGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAAtt > 1:5276662/1‑93 (MQ=255) gAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTc > 2:5129215/1‑93 (MQ=255) gAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTc < 1:4575477/93‑1 (MQ=255) gAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTc > 2:368204/1‑93 (MQ=255) agagACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAg > 2:8293026/1‑93 (MQ=255) agagACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAg > 2:4662949/1‑93 (MQ=255) gagaCAAAAAAGGTGCTGAAACTTACCGCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGt < 1:720137/93‑1 (MQ=255) gagaCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGt < 1:3960786/93‑1 (MQ=255) gagaCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGt > 1:5022532/1‑93 (MQ=255) gaCAAAAAAGGTGCTTAAACTTACCTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTaa < 2:6408033/93‑1 (MQ=255) gaCAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTaa > 1:7040769/1‑93 (MQ=255) aaaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACgg > 1:7334640/1‑93 (MQ=255) aaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGa > 1:3781070/1‑93 (MQ=255) aaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGa < 2:1419330/93‑1 (MQ=255) aaaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGa > 2:1666026/1‑93 (MQ=255) aaaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGaa > 2:7241010/1‑93 (MQ=255) aaaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGaaa < 2:6072205/93‑1 (MQ=255) aaGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAg < 1:3685274/93‑1 (MQ=255) ggTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTATCGGCAAgtg > 2:6894594/1‑93 (MQ=255) ggTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgtg > 2:707272/1‑93 (MQ=255) gTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgtgt < 2:2227652/93‑1 (MQ=255) gTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAgtgt < 2:8600778/93‑1 (MQ=255) tGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGtgtg < 2:1946430/93‑1 (MQ=255) gCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTgg < 1:1212748/93‑1 (MQ=255) cTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTGAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTCGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGc < 2:5226607/93‑1 (MQ=255) cTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGc < 2:6149965/93‑1 (MQ=255) cTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGc < 1:3893400/93‑1 (MQ=255) tGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCt < 1:7957010/93‑1 (MQ=255) gAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTg < 1:1981775/93‑1 (MQ=255) gAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGC‑GTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTgc > 2:2930625/1‑93 (MQ=255) aaaCTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTgc < 1:2186647/93‑1 (MQ=255) aaCTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTgcg > 1:6630594/1‑93 (MQ=255) aaCTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTgcg > 1:567984/1‑93 (MQ=255) cTTAACTCACTGTGGCGCGTCGGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGcgcg > 1:6777174/1‑93 (MQ=255) cTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGcgcg > 1:5600008/1‑93 (MQ=255) cTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGcgcg < 2:3492554/93‑1 (MQ=255) ttAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGa > 2:8344247/1‑93 (MQ=255) aCTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGt < 1:7641987/93‑1 (MQ=255) aCTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGt > 1:342678/1‑93 (MQ=255) cTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGCAAGTGTGGCTGCGCGAGGtt > 1:7545312/1‑93 (MQ=255) cTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGtt > 1:1369419/1‑93 (MQ=255) cTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTGATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaaa < 2:6262354/93‑1 (MQ=255) cTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaaa > 1:2369829/1‑93 (MQ=255) tgtgGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaaaa > 2:2831141/1‑93 (MQ=255) tgtgGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaaaa < 1:3115828/93‑1 (MQ=255) tgtgGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTaaaaa < 1:8273952/93‑1 (MQ=255) gtgGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAg < 1:1137477/93‑1 (MQ=255) gtgGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAg > 2:5880993/1‑93 (MQ=255) tgGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGt < 2:3956915/93‑1 (MQ=255) tgGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGt < 1:2794140/93‑1 (MQ=255) cgcgTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCt < 2:916440/93‑1 (MQ=255) cgTCAGGGTGCGATTAATCAATCGGCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtc < 1:146804/93‑1 (MQ=255) cgTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtc < 2:1574935/93‑1 (MQ=255) cgTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtc < 1:626332/93‑1 (MQ=255) cgTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtc < 2:5727902/93‑1 (MQ=255) cgTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtc < 2:565178/93‑1 (MQ=255) gTCAGTGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtct < 1:5354200/93‑1 (MQ=255) tCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtctc > 1:6935927/1‑93 (MQ=255) tCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtctc < 2:950075/93‑1 (MQ=255) tCAGGGTGCGATTAATCAAGCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTtctc < 2:265622/93‑1 (MQ=255) 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gCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTc > 1:4864019/1‑93 (MQ=255) gCGATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTc < 1:1800374/93‑1 (MQ=255) gATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGt > 2:6665403/1‑93 (MQ=255) gATTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGt > 1:3575554/1‑93 (MQ=255) aTTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAATTGCTTCTCCGTGTTCGTc > 1:6520091/1‑93 (MQ=255) aTTAATCAATCGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTc > 1:5947416/1‑93 (MQ=255) atcaatcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTg < 2:7415189/93‑1 (MQ=255) tcaatcGCCCCATGCAGGAGTTGAGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTgg < 2:4783288/93‑1 (MQ=255) aatcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGgcg > 2:6720139/1‑93 (MQ=255) atcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCTGTGTTCGTCACTGgcgc > 1:7836188/1‑93 (MQ=255) atcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGgcga > 1:2084207/1‑92 (MQ=255) tcGCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCa < 1:1018433/93‑1 (MQ=255) gCCCCATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGa < 2:309861/93‑1 (MQ=255) cccATGCAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACa < 1:8146459/93‑1 (MQ=255) | TTTAAAAGCTCGCTCATCGAAGAGACAAAAAAGGTGCTGAAACTTAACTCACTGTGGCGCGTCAGGGTGCGATTAATCAATCGCCCCATGTAGGAGTTGCGGCTGTAATTCAGTAACGGAAAGTGTGGCTGCGCGAGGTTAAAAAGTGCTTCTCCGTGTTCGTCACTGGCGCAGACAGGG > NC_000913/4555155‑4555334 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |