Predicted mutation
evidence seq id position mutation annotation gene description
RA NC_000913 3,025,676 +C coding (535/570 nt) ygfQ → hypothetical protein

Read alignment evidence...
  seq id position ref new freq score (cons/poly) reads annotation genes product
*NC_0009133,025,6751.C99.5% 736.2 / ‑3.9 209coding (534/570 nt)ygfQhypothetical protein
Reads supporting (aligned to +/- strand):  ref base . (1/0);  new base C (118/90);  total (119/90)
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.90e-01

Only 100 of 231 total aligned reads displayed.

GCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑CAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCG  >  NC_000913/3025583‑3025762
                                                                                              |                                                                                       
gCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑g                                                                                          >  2:4218804/1‑93 (MQ=255)
  tCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑cc                                                                                       >  1:5736858/1‑92 (MQ=255)
     cGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑ccagt                                                                                    <  2:3848778/93‑5 (MQ=255)
     cGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑ccagt                                                                                    <  1:2631988/93‑5 (MQ=255)
     cGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑ccagt                                                                                    <  2:709337/93‑5 (MQ=255)
      ggTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGG‑CAGTg                                                                                    >  2:1739500/1‑93 (MQ=255)
       gTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTgg                                                                                   >  1:350892/1‑93 (MQ=255)
       gTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTgg                                                                                   >  1:4793727/1‑93 (MQ=255)
        tACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGgc                                                                                  >  1:2943796/1‑93 (MQ=255)
           aGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCt                                                                               <  2:2009699/93‑1 (MQ=255)
           aGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCt                                                                               <  2:1138675/93‑1 (MQ=255)
           aGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCACTGGCGCt                                                                               <  1:6132750/93‑1 (MQ=255)
            ggtatcggtatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTc                                                                              >  1:199186/1‑93 (MQ=255)
            ggtatcggtatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTc                                                                              >  1:815791/1‑93 (MQ=255)
            ggtatcggtatcGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTc                                                                              <  2:4730403/93‑1 (MQ=255)
               atcggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGt                                                                           <  2:4830099/93‑1 (MQ=255)
               atcggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGGGGCGCTCGGt                                                                           >  2:5051816/1‑93 (MQ=255)
                tcggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTg                                                                          <  1:3841362/93‑1 (MQ=255)
                 cggtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGc                                                                         <  2:4937642/93‑1 (MQ=255)
                   gtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGt                                                                       >  1:6003106/1‑93 (MQ=255)
                   gtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGt                                                                       <  1:5096615/93‑1 (MQ=255)
                   gtatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGt                                                                       >  2:3203528/1‑93 (MQ=255)
                    tatcggGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGtt                                                                      <  1:4495090/93‑1 (MQ=255)
                        gggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcc                                                                  >  2:5900171/1‑93 (MQ=255)
                         ggCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcct                                                                 >  2:5649297/1‑93 (MQ=255)
                          gCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctc                                                                >  1:2933316/1‑93 (MQ=255)
                           cTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcc                                                               <  1:5033406/93‑1 (MQ=255)
                            tGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTAcctcct                                                              <  2:1094280/93‑1 (MQ=255)
                             gTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCtt                                                             >  1:3957261/1‑93 (MQ=255)
                              tttCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTc                                                            <  2:1580233/93‑1 (MQ=255)
                                  tgctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg                                                        >  2:607196/1‑93 (MQ=255)
                                  tgctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCgg                                                        <  1:1926857/93‑1 (MQ=255)
                                   gctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGt                                                       <  1:1427400/93‑1 (MQ=255)
                                    ctgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtg                                                      <  2:3741674/93‑1 (MQ=255)
                                     tgctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtga                                                     >  1:177802/1‑93 (MQ=255)
                                      gctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgat                                                    >  1:3259851/1‑93 (MQ=255)
                                       ctgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatg                                                   >  1:190301/1‑93 (MQ=255)
                                        tgATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatga                                                  >  1:2074628/1‑93 (MQ=255)
                                          aTTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatgatg                                                <  2:2558460/93‑1 (MQ=255)
                                           ttGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGtgatgatga                                               >  2:5155837/1‑93 (MQ=255)
                                              ctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCt                                            <  2:3433694/93‑1 (MQ=255)
                                              ctgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCt                                            <  2:1657331/93‑1 (MQ=255)
                                               tgctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCtt                                           <  1:3354376/93‑1 (MQ=255)
                                                 ctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGc                                         <  1:539898/93‑1 (MQ=255)
                                                 ctAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGc                                         <  2:2258706/93‑1 (MQ=255)
                                                  tAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCt                                        >  1:1484744/1‑93 (MQ=255)
                                                   aaCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTg                                       <  1:2189486/93‑1 (MQ=255)
                                                    aCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgg                                      >  1:567086/1‑93 (MQ=255)
                                                    aCGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgg                                      >  1:3765707/1‑93 (MQ=255)
                                                     cGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTggg                                     <  1:2369097/93‑1 (MQ=255)
                                                      ggTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTgggg                                    <  1:2457510/93‑1 (MQ=255)
                                                       gtgtGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGc                                   >  2:4988854/1‑93 (MQ=255)
                                                         gtgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTg                                 >  1:3727615/1‑93 (MQ=255)
                                                          tgGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTgg                                <  1:4676162/93‑1 (MQ=255)
                                                           gggTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGc                               <  1:1347383/93‑1 (MQ=255)
                                                           gggTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGc                               >  1:4409503/1‑93 (MQ=255)
                                                            ggTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCg                              >  2:3088646/1‑93 (MQ=255)
                                                            ggTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCg                              >  1:3378542/1‑93 (MQ=255)
                                                            ggTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCg                              >  1:4521102/1‑93 (MQ=255)
                                                             gTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCgg                             >  1:4437914/1‑93 (MQ=255)
                                                               aTGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTc                           <  1:2316092/93‑1 (MQ=255)
                                                               aTGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTc                           >  2:6166868/1‑93 (MQ=255)
                                                               aTGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTc                           >  2:2955875/1‑93 (MQ=255)
                                                                tGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCa                          >  1:158312/1‑93 (MQ=255)
                                                                tGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCa                          >  1:1395590/1‑93 (MQ=255)
                                                                tGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCa                          >  2:2736756/1‑93 (MQ=255)
                                                                   ttATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCt                       >  1:3924969/1‑93 (MQ=255)
                                                                    tATCAAAAACCGGATTGAAGGCTT‑GCCCGTGGCGCTCGGTGCCTTTACCTCCTTCTCGGTGATGATGAGCTTGCTGGTGCTGGCGGTCATAtt                      >  1:58745/1‑93 (MQ=255)
                                                                    tATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCtt                      <  2:6437837/93‑1 (MQ=255)
                                                                    tATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTCGCTGGGGCTGGCGGTCATCtt                      <  1:4089481/93‑1 (MQ=255)
                                                                     aTCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTc                     <  1:1263132/93‑1 (MQ=255)
                                                                     aTCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTc                     >  2:759923/1‑93 (MQ=255)
                                                                     aTCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTCGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTc                     <  2:5104520/93‑1 (MQ=255)
                                                                        aaaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGc                  >  2:5295354/1‑93 (MQ=255)
                                                                         aaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc                 <  2:2573107/93‑1 (MQ=255)
                                                                         aaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc                 <  2:921607/93‑1 (MQ=255)
                                                                         aaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc                 <  1:3785306/93‑1 (MQ=255)
                                                                         aaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc                 <  1:5769251/93‑1 (MQ=255)
                                                                         aaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc                 >  2:4119056/1‑93 (MQ=255)
                                                                         aaaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCATTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGcc                 >  2:1914109/1‑93 (MQ=255)
                                                                          aaaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCt                <  1:4160331/93‑1 (MQ=255)
                                                                           aaCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTg               >  2:1716426/1‑93 (MQ=255)
                                                                            aCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTgg              <  1:5329602/93‑1 (MQ=255)
                                                                            aCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTgg              >  2:5238705/1‑93 (MQ=255)
                                                                            aCCCGATTGAAGGCTT‑GCCAGGGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTTGGGCTGGCGGTCATGTTCGGCCTgg              >  1:670748/1‑93 (MQ=255)
                                                                                gATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGgagag          >  2:3889169/1‑92 (MQ=255)
                                                                                gATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGaa          <  2:4398259/93‑1 (MQ=255)
                                                                                gATTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGaa          <  2:3650501/93‑1 (MQ=255)
                                                                                 aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAg         >  1:1235984/1‑93 (MQ=255)
                                                                                 aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAg         <  2:5077991/93‑1 (MQ=255)
                                                                                 aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAg         >  1:5291912/1‑93 (MQ=255)
                                                                                 aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTATTCTCCGGCCTGgggagg         >  1:4501616/1‑91 (MQ=255)
                                                                                 aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCG‑TTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgt        <  2:3273489/93‑1 (MQ=255)
                                                                                 aTTGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGCGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAg         >  1:2389328/1‑93 (MQ=255)
                                                                                  ttGAAGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgt        >  1:6109011/1‑93 (MQ=255)
                                                                                    taaGGCGT‑GCCAGGGGCCCTCGGTGCTTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATTAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAgtgt      <  2:1414153/92‑1 (MQ=255)
                                                                                     aaGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTc     >  2:5532272/1‑93 (MQ=255)
                                                                                     aaGGCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTc     >  1:2405901/1‑93 (MQ=255)
                                                                                       ggCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTcgc   <  1:2563898/93‑1 (MQ=255)
                                                                                       ggCTT‑GCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTcgc   >  2:1266409/1‑93 (MQ=255)
                                                                                              |                                                                                       
GCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTT‑G‑CAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTTCGGCCTGGAGAAGTGTCGCG  >  NC_000913/3025583‑3025762

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 28 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑