Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,930,677 | +G | intergenic (+175/‑264) | kup → / → rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,930,676 | 1 | . | G | 99.6% | 777.8 / ‑3.9 | 222 | intergenic (+174/‑265) | kup/rbsD | low affinity potassium transport system/RbsD |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/0); new base G (119/102); total (120/102) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 240 total aligned reads displayed.
GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763 | gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGTGTCGTTGATCCT‑c < 1:6355820/93‑1 (MQ=255) gTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑c < 2:4095125/93‑1 (MQ=255) tAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑g < 2:2801613/93‑1 (MQ=255) agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑gg < 2:2744127/93‑2 (MQ=255) agaagaAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑gg > 2:3325782/1‑92 (MQ=255) gaagaaGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑ggc < 2:188643/93‑3 (MQ=255) agaagTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑ggcaa > 1:5066137/1‑89 (MQ=255) agTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACg < 2:2465750/93‑1 (MQ=255) gTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGc < 1:4199143/93‑1 (MQ=255) gTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGc > 2:2289808/1‑93 (MQ=255) ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTg < 2:713987/93‑1 (MQ=255) ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTg > 1:6281963/1‑93 (MQ=255) ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTg > 1:5810156/1‑93 (MQ=255) ccACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTg > 1:4231142/1‑93 (MQ=255) cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTgg < 2:4113026/93‑1 (MQ=255) cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTgg > 1:778641/1‑93 (MQ=255) cACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTgg < 2:3573769/93‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGt < 2:3652849/93‑1 (MQ=255) aCCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGt < 1:1680980/93‑1 (MQ=255) cGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAt > 1:3603524/1‑93 (MQ=255) gCTGCGTTCTGGAAGGATTAAGTTGCGGGATGAT‑GAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAttt < 2:6151620/93‑1 (MQ=255) gCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAtt < 2:6194284/93‑1 (MQ=255) gCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAtt < 1:774327/93‑1 (MQ=255) cTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTTCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAttt < 2:1419044/93‑1 (MQ=255) cTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTAttt < 1:3007980/93‑1 (MQ=255) tGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTg > 1:1368508/1‑93 (MQ=255) gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGc < 2:2161474/93‑1 (MQ=255) gCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGc < 2:5942131/93‑1 (MQ=255) cGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCg < 1:1620120/93‑1 (MQ=255) tCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCt > 1:5041443/1‑93 (MQ=255) tGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgc < 1:5496812/93‑1 (MQ=255) ggAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcg > 2:1994547/1‑93 (MQ=255) gAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTgcgc > 1:5218099/1‑93 (MQ=255) ggATTAAGTTGCCGGATGATTGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGc > 2:317346/1‑93 (MQ=255) ggATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGAGGTATTTGCGTCTGCGCGGc > 2:1018790/1‑93 (MQ=255) aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 2:1638649/93‑1 (MQ=255) aTTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 1:4969204/93‑1 (MQ=255) aTTAAGTTGCCGGATGATGCAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCaa < 1:3274393/93‑1 (MQ=255) aaGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCt > 1:4619764/1‑93 (MQ=255) gTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGt > 1:378779/1‑93 (MQ=255) ttGCCGGATGATGGTAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTa < 2:5550368/93‑1 (MQ=255) ttGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTa < 2:4195443/93‑1 (MQ=255) tGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTAc > 1:6386191/1‑93 (MQ=255) gCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACt < 1:735032/93‑1 (MQ=255) ccGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt < 2:2067491/93‑1 (MQ=255) ccGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACtt < 2:1800648/93‑1 (MQ=255) ggATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgc > 1:6336068/1‑93 (MQ=255) gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct > 2:593093/1‑93 (MQ=255) gatgatGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgct < 1:4754386/93‑1 (MQ=255) atgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctg < 2:6372448/93‑1 (MQ=255) atgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctg > 1:210329/1‑93 (MQ=255) tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc > 2:1586527/1‑93 (MQ=255) tgatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgc < 1:154310/93‑1 (MQ=255) gatgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgct < 1:4039474/93‑1 (MQ=255) atgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctg < 2:4136251/93‑1 (MQ=255) atgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGGATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctg > 1:2332313/1‑93 (MQ=255) tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctgc > 2:240228/1‑93 (MQ=255) tgGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTtgctgctgc > 1:6032677/1‑93 (MQ=255) ggAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:2613400/1‑93 (MQ=255) ggAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:5974079/1‑93 (MQ=255) ggAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCa > 1:2982946/1‑93 (MQ=255) gAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCaa < 1:1002979/93‑1 (MQ=255) aaaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCTCC‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAAc > 1:2745856/1‑93 (MQ=255) aaCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACg > 1:117380/1‑93 (MQ=255) aCCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGt > 1:6158911/1‑93 (MQ=255) cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa < 1:3109660/93‑1 (MQ=255) cctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTa < 1:1063714/93‑1 (MQ=255) ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa > 1:4383675/1‑93 (MQ=255) ctcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTaa < 2:5076480/93‑1 (MQ=255) tcctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAAt < 2:1457777/93‑1 (MQ=255) cctTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATg > 2:12863/1‑93 (MQ=255) cttcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgc < 2:5693387/93‑1 (MQ=255) tcttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATgcgc > 1:3941977/1‑93 (MQ=255) cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt > 2:2910046/1‑93 (MQ=255) cttTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCt < 2:5305078/93‑1 (MQ=255) tttATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTg < 1:958378/93‑1 (MQ=255) aTGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGt < 1:138788/93‑1 (MQ=255) aTGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGt < 1:4546540/93‑1 (MQ=255) gTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGc > 2:4028478/1‑93 (MQ=255) gTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTAGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGc < 2:4269754/93‑1 (MQ=255) cGCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAc > 2:4595264/1‑93 (MQ=255) gCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc < 1:3744105/93‑1 (MQ=255) gCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc < 1:5766357/93‑1 (MQ=255) gCATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCAcc > 1:4482688/1‑93 (MQ=255) cATGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCa > 1:2868099/1‑93 (MQ=255) aTGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg > 2:475349/1‑93 (MQ=255) aTGAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAg < 2:2653488/93‑1 (MQ=255) gAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt < 1:4284504/93‑1 (MQ=255) gAGTCGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGAt < 1:5582976/93‑1 (MQ=255) ggcGTTGCTCCT‑CGGCAAACGCCCGGGGTATTTGAGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGCGCACCAGATCa > 1:1841672/3‑93 (MQ=255) cGTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAt < 2:5128848/93‑1 (MQ=255) gTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAtt > 1:2055117/1‑93 (MQ=255) gTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAtt > 2:2329891/1‑93 (MQ=255) gTTGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAtt > 2:5155244/1‑93 (MQ=255) ttGATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAAttt > 2:69897/1‑93 (MQ=255) gATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa > 1:1967510/1‑93 (MQ=255) gATCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGa < 2:3502085/93‑1 (MQ=255) aTCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaa < 2:3843655/93‑1 (MQ=255) tCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa > 1:4905511/1‑93 (MQ=255) tCCT‑CGGCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGaaa > 1:6123798/1‑93 (MQ=255) | GTAGAAGAAGTTTTCCACCGCTGCGGTCTGGAAGGATTAAGTTGCCGGATGATGGAAACCTCCTTCTTTATGTCGCATGAGTCGTTGATCCT‑C‑GCAAACGCCCGTGGTATTTGCGTCTGCGCGGCAAGCTGTACTTGCTGCTGCAACGTAATGCGCTGCGTGCACCAGATCAATTTGAAA > NC_000913/3930584‑3930763 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |