| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 365527 = | 0 (0.000) | 237 (0.980) | 125/178 | 0.2 | 71.8% | coding (3/3075 nt) | lacZ | beta‑D‑galactosidase |
| ? | NC_000913 | 4589230 = | 186 (0.770) | coding (4/1656 nt) | tsr | methyl‑accepting chemotaxis protein I | |||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/365621‑365527‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑atgTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTACAACTGACATCAGGCGGTCTGTTCTTTAATGC > NC_000913/4589230‑4589321 TCATTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTA < 2:320360/93‑1 TTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGT > 2:2090778/1‑93 TTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGT < 1:2363286/93‑1 TTAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGT < 2:1844629/93‑1 TAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTT < 2:583760/93‑1 TAGGCACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTCTGGAATTGGGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTT > 2:1685926/1‑93 CACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAA < 2:223647/93‑1 CACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAA < 2:1454332/93‑1 ACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAAC > 1:1847143/1‑93 ACCCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAAC > 2:4796142/1‑93 CCCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGT > 1:3393475/1‑93 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA < 1:2132625/93‑1 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA > 2:3613392/1‑93 CCAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTA < 2:3514423/93‑1 CAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTAT > 2:2565327/1‑93 CAGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTAT > 2:3181206/1‑93 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATt > 1:619767/1‑92 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC < 2:4083151/93‑1 AGGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATC < 2:4705328/93‑1 GGCTTTACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCA > 1:3527458/1‑93 TACACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATT < 1:3241776/93‑1 CACTTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGT < 1:3298772/93‑1 TTTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGAC > 2:6458095/1‑93 TTATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACC > 2:2702780/1‑93 TATGCTTCCGGCTGGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCA < 2:680153/93‑1 ATGCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAG < 2:1038209/93‑1 GCTTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCT < 1:3736758/93‑1 TTCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTA > 2:3851183/1‑93 TCCGGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTAC < 1:140221/93‑1 GGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGC > 2:442150/1‑93 GGCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGC > 2:1620651/1‑93 GCTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCT < 2:4109963/93‑1 CTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTG < 1:6268834/93‑1 CTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTG > 2:5365107/1‑93 CTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTG > 2:2784965/1‑93 CTCGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTG < 1:3335401/93‑1 CGTATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGT > 1:3092628/1‑93 TATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTT < 2:1776100/93‑1 TATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTT > 2:3947244/1‑93 ATGTTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTT < 1:275990/93‑1 TTGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGC < 1:4829290/93‑1 TGTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCC < 2:116145/93‑1 GTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCG < 2:5478768/93‑1 GTGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCG > 1:6003295/1‑93 TGTGGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGT < 1:1329204/93‑1 GGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTT > 2:4518232/1‑93 GGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTT < 2:1221641/93‑1 GGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTT < 1:3804739/93‑1 GGAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTT > 2:483599/1‑93 GAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTT > 2:3243870/1‑93 GAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTT < 1:2287641/93‑1 GAATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTT > 2:5962788/1‑93 ATTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGG > 1:1029469/1‑93 TTGTGAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGC > 2:3040563/1‑93 GAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTT < 2:5151204/93‑1 GAGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTT > 2:3117586/1‑93 AGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTT < 1:4164783/93‑1 AGCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTT < 1:4600271/93‑1 GCGGATAACAATTTCACACAGGAAACAGCTATGTTAAAACGTATCAAAATTGTGACCAGCTTACTGCTGGTTTTGGCCGTTTTTGGCCTTTTA < 1:5701625/93‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 24 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |