| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 3,156,257 | (CCA)2→1 | coding (594‑596/930 nt) | yqhG → | hypothetical protein |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3156256 | 1 (0.000) | 197 (0.820) | 107/178 | 1.1 | 99.5% | coding (593/930 nt) | yqhG | hypothetical protein |
| ? | NC_000913 | 3156260 = | 1 (0.000) | coding (597/930 nt) | yqhG | hypothetical protein | |||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
AGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCACCAGGCGGTTAATGCCTTCTATAAAACCACCTTCAAGACGGCCAATAATCCCGATGAAGATATGCAAATAGAACGGCAATTTATTTACGACA > NC_000913/3156164‑3156348 | aGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA > 2:3033902‑M1/1‑93 (MQ=255)aGAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCA > 1:4491451‑M1/1‑93 (MQ=255) gAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAg < 1:1282702‑M1/93‑2 (MQ=255) gAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAg < 1:5885300‑M1/93‑2 (MQ=255) gAACAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAg < 2:5585718‑M1/93‑2 (MQ=255) aCAGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggc < 2:912284‑M1/93‑4 (MQ=255) aGCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcgg > 1:275470‑M1/1‑88 (MQ=255) gCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggt < 2:1707493‑M1/93‑7 (MQ=255) gCCGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggt > 2:2510554‑M1/1‑87 (MQ=255) ccGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggtt > 1:4648191‑M1/1‑86 (MQ=255) cGGAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggtta > 2:5008313‑M1/1‑85 (MQ=255) gAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaat > 2:2445284‑M1/1‑83 (MQ=255) gAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaat < 1:1604356‑M1/93‑11 (MQ=255) gAAGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaat > 2:5326727‑M1/1‑83 (MQ=255) aGCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgc > 1:5212230‑M1/1‑81 (MQ=255) gCCTTTGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgcc < 2:4316000‑M1/93‑14 (MQ=255) tttGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttc > 2:2348501‑M1/1‑77 (MQ=255) tttGTTGCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttc > 2:632759‑M1/1‑77 (MQ=255) ttgttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttct < 2:3865374‑M1/93‑18 (MQ=255) tgttgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttcta > 2:648493‑M1/1‑75 (MQ=255) tgCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataa > 1:3638878‑M1/1‑72 (MQ=255) gCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaa < 2:2922517‑M1/93‑23 (MQ=255) gCCGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaa > 2:322364‑M1/1‑71 (MQ=255) ccGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaa < 1:730979‑M1/93‑24 (MQ=255) cGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaac > 1:1934949‑M1/1‑69 (MQ=255) cGAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaac > 2:6064611‑M1/1‑69 (MQ=255) gAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacc > 1:6388707‑M1/1‑68 (MQ=255) gAACTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacc > 1:2319772‑M1/1‑68 (MQ=255) aaCTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacca > 1:2555382‑M1/1‑67 (MQ=255) aaCTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacca > 2:2635043‑M1/1‑67 (MQ=255) aaCTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacca > 2:5754709‑M1/1‑67 (MQ=255) aCTCTTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccac < 2:841152‑M1/93‑28 (MQ=255) ctctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGCCTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacc > 2:2701434‑M1/1‑65 (MQ=255) ctctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacc < 1:3881898‑M1/93‑29 (MQ=255) ctctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacc < 2:3348236‑M1/93‑29 (MQ=255) ctctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacc > 1:4304250‑M1/1‑65 (MQ=255) tctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacct > 1:5616577‑M1/1‑64 (MQ=255) tctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacct < 2:1387968‑M1/93‑30 (MQ=255) tctTTGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccacct < 1:4312717‑M1/93‑30 (MQ=255) tttGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttc < 2:3617712‑M1/93‑32 (MQ=255) tttGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttc < 1:1373689‑M1/93‑32 (MQ=255) tttGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttc > 1:297603‑M1/1‑62 (MQ=255) tGAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaa < 1:4018997‑M1/93‑34 (MQ=255) gAACATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaag > 2:3986208‑M1/1‑59 (MQ=255) aaCATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaaga < 2:4194375‑M1/93‑36 (MQ=255) cATATTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacg > 1:5808559‑M1/1‑56 (MQ=255) atatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacgg > 2:4438428‑M1/1‑55 (MQ=255) atatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacgg > 1:2155061‑M1/1‑55 (MQ=255) atatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacgg < 1:3022164‑M1/93‑39 (MQ=255) atatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacgg > 1:2648339‑M1/1‑55 (MQ=255) tatTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggc > 1:6159866‑M1/1‑54 (MQ=255) atTGCTGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggcc > 2:2228910‑M1/1‑53 (MQ=255) tctGATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccgccttcaagacggccaat < 1:1070515‑M1/92‑44 (MQ=255) gATTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataat > 2:727627‑M1/1‑47 (MQ=255) aTTATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatc < 1:469297‑M1/93‑48 (MQ=255) aTTATAGCGGGCGGTGGACGTCGATGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaccctccttcaagacggccaataatc < 1:1050414‑M1/93‑48 (MQ=255) ttATAGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcc < 1:5571726‑M1/93‑49 (MQ=255) tataGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatccc > 1:551139‑M1/1‑44 (MQ=255) taGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccga > 2:2713859‑M1/1‑42 (MQ=255) aGCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgat < 2:4105472‑M1/93‑53 (MQ=255) gCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatg > 2:1589069‑M1/1‑40 (MQ=255) gCTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatg > 2:3717860‑M1/1‑40 (MQ=255) cTGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatga < 2:1167351‑M1/93‑55 (MQ=255) tGGCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaa < 2:2774755‑M1/93‑56 (MQ=255) ggCCGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaag > 2:1194082‑M1/1‑37 (MQ=255) ggggggAGGTGGGTGTTTTCCGCCTCTAACCG‑CA‑‑AGGGGTTTAATGCCTTCAATAAAACCACCTTCAAGACGGCGAATAATCCCGATGAAGat < 1:5535956/89‑1 (MQ=255) ccGTGGCCTTCGGTGGTTTCCTACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaacctccttcaagacggccaataatcccgatgaagat < 2:5883695‑M1/93‑59 (MQ=255) ccGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagat > 2:4303800‑M1/1‑35 (MQ=255) ccGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagat < 2:1891339‑M1/93‑59 (MQ=255) ccGTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagat < 2:3701921‑M1/93‑59 (MQ=255) gTGGACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatat > 2:407561‑M1/1‑33 (MQ=255) ggACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgc < 1:5021461‑M1/93‑63 (MQ=255) ggACGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgc < 2:3574252‑M1/93‑63 (MQ=255) aCGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaa < 1:5952097‑M1/93‑65 (MQ=255) cGTGGGTGGTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaa < 2:1998589‑M1/93‑66 (MQ=255) gggtggTTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatag > 2:5278340‑M1/1‑25 (MQ=255) ggtggtTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaataga > 1:3792327‑M1/1‑24 (MQ=255) gtggtTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttgaagacggccaataatcccgatgaagataagcaaatagaa > 2:5056545‑M1/1‑23 (MQ=255) gtggtTTCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaa > 1:260083‑M1/1‑23 (MQ=255) tttCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggc > 1:6256847‑M1/1‑19 (MQ=255) tCCGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaa < 2:1645712‑M1/93‑77 (MQ=255) ccGACTCTTCCCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccgccttcaagacggccaatagtcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaat < 1:3073611‑M1/93‑78 (MQ=255) ccGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaat < 1:90758‑M1/93‑78 (MQ=255) ccGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaat > 1:3586361‑M1/1‑16 (MQ=255) ccGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaat < 2:3100399‑M1/93‑78 (MQ=255) cGACTCTTACCGCCAggcggttaatgccttctataaaaccaccttcaagacggccaataatcccgatgaagatatgcaaatagaacggcaatt < 2:4873447‑M1/93‑79 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |