BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
evidence	seq id	position	mutation	annotation	gene	description
RA	NC_000913	878,307	A→G	T115A (ACT→GCT)	yliI →	putative dehydrogenase

Read alignment evidence...
	seq id	position		ref	new	freq	score (cons/poly)	reads	annotation	genes	product
*	NC_000913	878,307	0	A	G	100.0%	620.7 / NA	181	T115A (ACT→GCT)	yliI	putative dehydrogenase
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (76/105); total (76/105)

Only 100 of 186 total aligned reads displayed.

TGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC  >  NC_000913/878218‑878396

tgctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctg                                                                                        >  1:5126739/1‑93 (MQ=255)

 gctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgc                                                                                       <  1:1530962/93‑1 (MQ=255)

 gctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgc                                                                                       <  2:5574600/93‑1 (MQ=255)

  ctgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAgctgct                                                                                      >  2:4198154/1‑93 (MQ=255)

   tgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgctg                                                                                     >  2:3051939/1‑93 (MQ=255)

   tgGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGctgctg                                                                                     >  1:2160567/1‑93 (MQ=255)

    ggACGTGGTTTTAGCTCCTGATTGTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgt                                                                                    <  2:2221532/93‑1 (MQ=255)

     gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg                                                                                   >  1:5975958/1‑93 (MQ=255)

     gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg                                                                                   <  1:2656837/93‑1 (MQ=255)

     gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg                                                                                   <  1:5456742/93‑1 (MQ=255)

     gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg                                                                                   <  1:219581/93‑1 (MQ=255)

     gACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCtgtg                                                                                   <  2:4783182/93‑1 (MQ=255)

      aCGTGGTTTTAGCGCGTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTgg                                                                                  <  1:531144/93‑1 (MQ=255)

      aCGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTgg                                                                                  >  2:150451/1‑93 (MQ=255)

         tGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGtt                                                                               >  1:2839005/1‑93 (MQ=255)

         tGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGtt                                                                               >  1:767762/1‑93 (MQ=255)

         tGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGGTAAGTTATTCCGAAGCTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGtt                                                                               >  1:5630470/1‑93 (MQ=255)

           gTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTAt                                                                             <  1:682944/93‑1 (MQ=255)

           gTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTAt                                                                             <  1:989537/93‑1 (MQ=255)

             tttAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATgg                                                                           <  1:2524913/93‑1 (MQ=255)

               tAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGcc                                                                         <  2:3981460/93‑1 (MQ=255)

                 gcgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGc                                                                       <  1:6362793/93‑1 (MQ=255)

                 gcgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGc                                                                       <  1:3096391/93‑1 (MQ=255)

                 gcgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGc                                                                       >  2:1138502/1‑93 (MQ=255)

                  cgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCt                                                                      <  2:6436394/93‑1 (MQ=255)

                  cgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCt                                                                      >  2:6114660/1‑93 (MQ=255)

                  cgcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCt                                                                      <  2:701329/93‑1 (MQ=255)

                   gcCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCtt                                                                     >  1:4983469/1‑93 (MQ=255)

                     cTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGCGGGTTATGGCCGCTTaa                                                                   >  1:4059798/1‑93 (MQ=255)

                      tGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAg                                                                  >  1:5518727/1‑93 (MQ=255)

                       gATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGt                                                                 <  2:5661932/93‑1 (MQ=255)

                        aTTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtg                                                                >  2:384479/1‑93 (MQ=255)

                        aTTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtg                                                                <  1:5014708/93‑1 (MQ=255)

                         ttttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtga                                                               <  1:1802395/93‑1 (MQ=255)

                         ttttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtga                                                               <  2:463830/93‑1 (MQ=255)

                          tttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgat                                                              <  1:1618214/93‑1 (MQ=255)

                          tttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgat                                                              <  2:2061482/93‑1 (MQ=255)

                           ttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatg                                                             <  2:833537/93‑1 (MQ=255)

                           ttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatg                                                             <  1:2408915/93‑1 (MQ=255)

                           ttGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatg                                                             <  2:5927624/93‑1 (MQ=255)

                            tGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatga                                                            >  2:907701/1‑93 (MQ=255)

                            tGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGtgatga                                                            <  2:2367135/93‑1 (MQ=255)

                             gCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTgatgat                                                           >  2:5104323/1‑93 (MQ=255)

                              cTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGGGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtc                                                          <  1:2967634/93‑1 (MQ=255)

                                cAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtctc                                                        <  1:1994420/93‑1 (MQ=255)

                                  gTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtctctc                                                      <  2:3713975/93‑1 (MQ=255)

                                  gTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGAtctctc                                                      >  2:2404102/1‑93 (MQ=255)

                                       gccgcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAg                                                 >  1:4209748/1‑93 (MQ=255)

                                       gccgcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGCGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAg                                                 <  1:3539914/93‑1 (MQ=255)

                                        ccgcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGt                                                >  1:3454129/1‑93 (MQ=255)

                                        ccgcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGt                                                <  1:4848177/93‑1 (MQ=255)

                                          gcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa                                              <  1:3298932/93‑1 (MQ=255)

                                          gcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa                                              <  2:2463452/93‑1 (MQ=255)

                                          gcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa                                              <  2:4996994/93‑1 (MQ=255)

                                          gcATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa                                              <  1:3722015/93‑1 (MQ=255)

                                          ccATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGTTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGa                                              <  1:1007869/92‑1 (MQ=255)

                                           cATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAc                                             <  2:3851027/93‑1 (MQ=255)

                                            aTCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAcg                                            >  2:1368064/1‑92 (MQ=255)

                                            aTCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGAcc                                            >  2:618570/1‑93 (MQ=255)

                                             tCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCg                                           >  2:2110311/1‑93 (MQ=255)

                                              cTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTTCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGa                                          <  1:3146409/93‑1 (MQ=255)

                                               tGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGAc                                         <  1:4509980/93‑1 (MQ=255)

                                                ggTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACt                                        <  2:4332926/93‑1 (MQ=255)

                                                ggTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACt                                        <  2:1427293/93‑1 (MQ=255)

                                                 gTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACtt                                       <  1:4415631/93‑1 (MQ=255)

                                                 gTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACtt                                       >  1:2489241/1‑93 (MQ=255)

                                                  ttAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTc                                      <  1:6447238/93‑1 (MQ=255)

                                                  ttAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTc                                      <  2:4034581/93‑1 (MQ=255)

                                                   tAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTcc                                     <  2:5787777/93‑1 (MQ=255)

                                                   tAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTcc                                     <  1:2105993/93‑1 (MQ=255)

                                                    aaGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCg                                    >  2:2073176/1‑93 (MQ=255)

                                                        tATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCAcc                                <  2:3589873/93‑1 (MQ=255)

                                                        tATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCAcc                                >  1:1361148/1‑93 (MQ=255)

                                                            ccGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCt                            <  2:6304249/93‑1 (MQ=255)

                                                             cGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCtt                           >  1:5945870/1‑93 (MQ=255)

                                                             cGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCtt                           <  1:5977452/93‑1 (MQ=255)

                                                              gAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCttt                          <  1:3795284/93‑1 (MQ=255)

                                                                  ttGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGcc                      >  1:3936579/1‑93 (MQ=255)

                                                                   tGGCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCa                     <  2:5769221/93‑1 (MQ=255)

                                                                    ggCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAg                    >  2:2965350/1‑93 (MQ=255)

                                                                    ggCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAg                    >  1:625985/1‑93 (MQ=255)

                                                                     gCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGa                   <  1:1030688/93‑1 (MQ=255)

                                                                     gCGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGa                   <  2:5447839/93‑1 (MQ=255)

                                                                      cGATGATGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGAt                  <  2:667117/93‑1 (MQ=255)

                                                                       gatgatGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATg                 <  2:5357776/93‑1 (MQ=255)

                                                                       gatgatGGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATg                 >  2:5907391/1‑93 (MQ=255)

                                                                        atgatgGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGc                <  1:782578/93‑1 (MQ=255)

                                                                           atgGCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCaa             >  1:5114368/1‑93 (MQ=255)

                                                                             ggCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCaaaa           <  1:3239418/93‑1 (MQ=255)

                                                                             ggCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCAGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTATTTCGCCAGATGCCaaaa           >  2:349744/1‑93 (MQ=255)

                                                                              gCAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAAc          <  2:1874892/93‑1 (MQ=255)

                                                                               cAAAGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACt         >  1:2343340/1‑93 (MQ=255)

                                                                                aaaGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTg        >  2:379035/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 aaGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGt       >  1:2252954/1‑93 (MQ=255)

                                                                                 aaGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGGGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATCCCAAAACTGt       >  2:3158945/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  aGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTc      >  2:5610271/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  aGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTc      <  1:3216354/93‑1 (MQ=255)

                                                                                  aGCCGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGAACGGTCTTTCGGCCGCTGCCCAAACTGTc      >  2:5163005/1‑93 (MQ=255)

                                                                                    ccGGAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTa    <  1:986957/93‑1 (MQ=255)

                                                                                      ggAGCTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTAcc  >  2:4834257/1‑93 (MQ=255)

TGCTGGACGTGGTTTTAGCGCCTGATTTTGCTCAGTCTCGCCGCATCTGGTTAAGTTATTCCGAAGTTGGCGATGATGGCAAAGCCGGAACTGCTGTGGGTTATGGCCGCTTAAGTGATGATCTCTCAAAAGTGACCGACTTCCGCACCGTCTTTCGCCAGATGCCAAAACTGTCTACC  >  NC_000913/878218‑878396

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 20 ≤` `ATCG/ATCG` `< 28 ≤` `ATCG/ATCG` `< 34 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`