Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,982,766 | C→T | P109P (CCG→CCA) | araG ← | ATP‑binding component of high‑affinity L‑arabinose transport system |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,982,766 | 0 | C | T | 99.6% | 859.8 / NA | 221 | P109P (CCG→CCA) | araG | ATP‑binding component of high‑affinity L‑arabinose transport system |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (108/112); minor base G (0/1); total (108/113) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 224 total aligned reads displayed.
GTGTCCGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGCGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCCGCGTTAAG > NC_000913/1982677‑1982855 | gtgtCCGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAACGCCGCCTTTATGTGGc > 1:1847808/1‑93 (MQ=255) tgtCCGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAACCCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCa < 1:2795262/93‑1 (MQ=255) tgtCCGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCa < 1:761296/93‑1 (MQ=255) tgtCCGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCa > 1:1572353/1‑93 (MQ=255) tgtCCGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCa > 2:1550796/1‑93 (MQ=255) tgtCCGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCa > 2:1685250/1‑93 (MQ=255) tgtCCGGGTCAATATCCATACAAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCa < 1:3629382/93‑1 (MQ=255) tCCGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTTGCAGc > 1:1711739/1‑93 (MQ=255) ccGGGTCAATATCCATCCCAAAATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCt < 2:5563585/93‑1 (MQ=255) ccGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACACGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCt > 1:5337022/1‑93 (MQ=255) cGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTg > 1:1476055/1‑93 (MQ=255) cGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTg < 1:5210973/93‑1 (MQ=255) gggTCAATCTCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTgg > 1:6299176/1‑93 (MQ=255) ggTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAACCCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGc < 2:6331766/93‑1 (MQ=255) ggTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGc > 1:3835027/1‑93 (MQ=255) cAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCga < 1:4279620/93‑1 (MQ=255) aaaTATCCACACCAAGATGTTTAAGTTGTAATCCCTCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCga < 1:5566486/92‑1 (MQ=255) atatCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCgaga > 2:5809058/1‑93 (MQ=255) atatCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCgaga > 2:569752/1‑93 (MQ=255) atatCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCgaga < 2:5965587/93‑1 (MQ=255) atatCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCgaga > 1:3155029/1‑93 (MQ=255) atatCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCgaga > 1:3062305/1‑93 (MQ=255) atCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGagata < 1:4774738/93‑1 (MQ=255) atCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGagata < 1:75285/93‑1 (MQ=255) cATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGagatagat > 1:4007094/1‑93 (MQ=255) cATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGagatagat < 2:4601974/93‑1 (MQ=255) cATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGagatagat > 1:4215027/1‑93 (MQ=255) aTACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATg > 1:2292007/1‑93 (MQ=255) aTACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATg < 1:4129575/93‑1 (MQ=255) tACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGt > 2:6096948/1‑93 (MQ=255) tACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGt < 2:3978521/93‑1 (MQ=255) tACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGt < 2:4916695/93‑1 (MQ=255) acaaaGATGTTTAAGTTGTAACCCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGtt < 1:5514041/90‑1 (MQ=255) ccAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGttt < 1:3177050/93‑1 (MQ=255) cAAGATGTTTAAGTTGTAACCCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGtttt < 1:2135327/93‑1 (MQ=255) cAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGtttt > 1:1992099/1‑93 (MQ=255) aaGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTc < 1:1742238/93‑1 (MQ=255) aaGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTc > 1:583496/1‑93 (MQ=255) aGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTcc > 2:4228684/1‑93 (MQ=255) aGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTcc < 1:5917398/93‑1 (MQ=255) gATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCcg > 1:4478816/1‑93 (MQ=255) gATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCcg > 1:3377116/1‑93 (MQ=255) gATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCcg < 1:5295540/93‑1 (MQ=255) aTGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCcgc > 1:896080/1‑93 (MQ=255) tGTTTAAGTTGTAACCCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCcgcg < 2:1239860/93‑1 (MQ=255) tttaaaGTTTAAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGa < 2:5600135/89‑1 (MQ=255) gTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGa > 1:682872/1‑93 (MQ=255) tttAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGAc < 1:5064807/93‑1 (MQ=255) tttAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGAc > 1:3972927/1‑93 (MQ=255) ttAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACg < 2:5877208/93‑1 (MQ=255) aaGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGt > 2:2898643/1‑93 (MQ=255) aGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTc > 2:2577839/1‑93 (MQ=255) gTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCa > 2:5323310/1‑93 (MQ=255) ttGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCAt > 2:3401234/1‑93 (MQ=255) ttGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCAt < 2:706716/93‑1 (MQ=255) tAACCCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTc < 2:3619633/93‑1 (MQ=255) tAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTc < 2:6020044/93‑1 (MQ=255) tAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTc < 2:2138036/93‑1 (MQ=255) aaccccGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTcc < 2:2435767/90‑1 (MQ=255) aaaCCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTcc < 1:6436344/93‑1 (MQ=255) aaCCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCg > 1:83735/1‑93 (MQ=255) ccGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCa < 1:5265324/93‑1 (MQ=255) cGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCAc < 1:226283/93‑1 (MQ=255) gCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACg > 2:4021919/1‑93 (MQ=255) tAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGc < 2:5257145/93‑1 (MQ=255) aaTTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCa < 1:5643885/93‑1 (MQ=255) aTTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAg > 1:4925650/1‑93 (MQ=255) ttCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGt < 1:4089046/93‑1 (MQ=255) tCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGtt > 2:1084948/1‑93 (MQ=255) cAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTc < 1:3681071/93‑1 (MQ=255) cAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTc > 2:386691/1‑93 (MQ=255) aTGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGt > 2:4422351/1‑93 (MQ=255) aTGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGt > 1:1385958/1‑93 (MQ=255) tGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTa < 2:5366091/93‑1 (MQ=255) tGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTa < 1:5757258/93‑1 (MQ=255) aGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTaaa < 2:2674683/93‑1 (MQ=255) gCGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAaat < 1:586074/93‑1 (MQ=255) cGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAaata > 2:5734089/1‑93 (MQ=255) cGATTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAaata < 1:6099846/93‑1 (MQ=255) aTTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAaataat > 1:3723211/1‑93 (MQ=255) aTTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAaataat < 2:5118671/93‑1 (MQ=255) aTTCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAaataat < 1:2310610/93‑1 (MQ=255) ttCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATc < 1:2666481/93‑1 (MQ=255) ttCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATc < 1:948147/93‑1 (MQ=255) tCACAATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCg > 2:3287390/1‑93 (MQ=255) caATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCa > 1:4536597/1‑93 (MQ=255) caATGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATAGCCa > 2:1300970/1‑93 (MQ=255) aaTGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCAc > 2:5584290/1‑93 (MQ=255) aTGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACg > 2:3012016/1‑93 (MQ=255) aTGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACg > 2:1974728/1‑93 (MQ=255) tGCCGCCTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGc < 1:2602099/93‑1 (MQ=255) ccgccTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGccc > 2:1355939/1‑93 (MQ=255) cgccTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCcg > 1:1222550/1‑93 (MQ=255) cgccTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCcg < 1:166426/93‑1 (MQ=255) gccTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCcgc > 1:441961/1‑93 (MQ=255) gccTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCcgc > 2:3838570/1‑93 (MQ=255) ccTTTATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCcgcg > 2:1028812/1‑93 (MQ=255) tttATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCCGCGtt < 1:2965054/93‑1 (MQ=255) tttATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCCGCGtt > 2:391413/1‑93 (MQ=255) tATGTGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCCGCGTTaa < 1:4697182/93‑1 (MQ=255) | GTGTCCGGGTCAATATCCATACCAAGATGTTTAAGTTGTAAACCCGCCTCATAATTCAGCAATGAGCGATTCACAATGCCGCCTTTATGCGGCAGCTGGCCGAGATAGATGTTTTCCGCGACGGTCATTTCCGGCACGAGATGCAGTTCCTGGTAAATAATCGCCACGCCCGCGTTAAG > NC_000913/1982677‑1982855 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |