Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,766,847 | T→C | intergenic (+582/‑125) | yibG → / → b4549 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,766,847 | 0 | T | C | 98.8% | 583.0 / ‑4.1 | 167 | intergenic (+582/‑125) | yibG/b4549 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/1); new base C (91/74); total (92/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.31e-01 |
Only 100 of 171 total aligned reads displayed.
TTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTG > NC_000913/3766757‑3766936 | tttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCa < 1:248659/93‑1 (MQ=255) ttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCag < 2:2430891/93‑1 (MQ=255) ttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCag < 2:2271545/93‑1 (MQ=255) ttGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCag > 2:4619063/1‑93 (MQ=255) ggTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCagag > 2:5245085/1‑93 (MQ=255) gTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGc < 1:4107750/93‑1 (MQ=255) tCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGcc > 2:5618638/1‑93 (MQ=255) tCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGcc > 2:1667806/1‑93 (MQ=255) cGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAg > 2:5283956/1‑93 (MQ=255) cGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAg > 1:4721676/1‑93 (MQ=255) gTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGa > 1:3708743/1‑93 (MQ=255) gTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGa > 2:4815861/1‑93 (MQ=255) tCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGAt > 1:566552/1‑93 (MQ=255) cTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATa > 1:4350864/1‑93 (MQ=255) tttAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAg > 1:3921648/1‑93 (MQ=255) tttAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAg > 2:3359769/1‑93 (MQ=255) ttAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGc > 2:4710522/1‑93 (MQ=255) ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca > 1:873493/1‑93 (MQ=255) ggACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGcaca > 1:1131691/1‑93 (MQ=255) tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc < 2:5113340/93‑1 (MQ=255) tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc > 2:829948/1‑93 (MQ=255) tCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAAc > 2:3559910/1‑93 (MQ=255) cGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTACCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACa < 2:5317916/93‑1 (MQ=255) gATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAg > 2:5520838/1‑93 (MQ=255) aTTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGt > 1:5351171/1‑93 (MQ=255) aTTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGt > 2:1050308/1‑93 (MQ=255) ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt > 1:1530829/1‑93 (MQ=255) ttCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGtt > 1:1349320/1‑93 (MQ=255) tCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTa > 1:5127486/1‑93 (MQ=255) cTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTAc > 2:2816210/1‑93 (MQ=255) tGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACg > 1:5494884/1‑93 (MQ=255) tCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGAc < 2:872056/93‑1 (MQ=255) tCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGAc > 2:4193819/1‑93 (MQ=255) ccGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTCATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACt < 1:5199609/93‑1 (MQ=255) ccGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACt > 1:5610899/1‑93 (MQ=255) gAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaa > 1:2662306/1‑93 (MQ=255) gAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaa < 2:6335600/93‑1 (MQ=255) gAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaa > 1:2652276/1‑93 (MQ=255) gggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaa > 1:3243509/1‑93 (MQ=255) ggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaaa < 2:6058893/93‑1 (MQ=255) ggTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTaaaaa < 2:3437058/93‑1 (MQ=255) tttataACTGGTTTATCTAATCACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAata < 2:4475734/91‑1 (MQ=255) tGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAata < 1:2790909/93‑1 (MQ=255) tGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAata > 1:4977555/1‑93 (MQ=255) gTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAatat < 1:333395/93‑1 (MQ=255) ataACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATgg > 1:4818458/1‑93 (MQ=255) aaCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCa > 1:1727039/1‑93 (MQ=255) aCTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCaa < 1:120961/93‑1 (MQ=255) cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg < 2:3948090/93‑1 (MQ=255) cTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAg < 1:736008/93‑1 (MQ=255) ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt < 1:923425/93‑1 (MQ=255) ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt < 1:1117116/93‑1 (MQ=255) ggTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGt < 1:1070687/93‑1 (MQ=255) gTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGtt < 1:2119981/93‑1 (MQ=255) tttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGtta > 1:3581380/1‑93 (MQ=255) tttATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGtta < 1:4759794/93‑1 (MQ=255) tATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttatt < 2:6287286/93‑1 (MQ=255) tATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGttatt < 2:5677082/93‑1 (MQ=255) cTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAc > 1:1578549/1‑93 (MQ=255) cTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAc > 2:1191584/1‑93 (MQ=255) cTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAAc < 2:3804518/93‑1 (MQ=255) aaTGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACaa > 1:32919/1‑93 (MQ=255) aTGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAt < 2:4991973/93‑1 (MQ=255) aTGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAt < 2:4077740/93‑1 (MQ=255) tGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAAtt > 1:883218/1‑93 (MQ=255) gACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTg > 2:3394045/1‑93 (MQ=255) aCATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGt > 1:6383757/1‑93 (MQ=255) aCATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGt < 2:3148892/93‑1 (MQ=255) cATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTa < 2:5395319/93‑1 (MQ=255) aTGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAt > 2:1326337/1‑93 (MQ=255) tGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt < 2:2102262/93‑1 (MQ=255) agCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtt < 1:4558606/92‑1 (MQ=255) gCAAAAATTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAttt < 1:5256598/93‑1 (MQ=255) aaaaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTAtttttt > 2:6011427/1‑93 (MQ=255) aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc > 1:6140465/1‑93 (MQ=255) aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc > 1:5777009/1‑93 (MQ=255) aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc > 1:2127357/1‑93 (MQ=255) aaTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtc < 2:540928/93‑1 (MQ=255) aTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtct < 1:4201175/93‑1 (MQ=255) aTTAAATGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTtct < 1:1651921/93‑1 (MQ=255) aaaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTa < 1:4602885/93‑1 (MQ=255) aaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAt < 1:5537637/93‑1 (MQ=255) aaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAt < 1:1278173/93‑1 (MQ=255) aaTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAt < 1:5177037/93‑1 (MQ=255) aTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAtt < 1:3227437/93‑1 (MQ=255) aTGAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTAtt < 1:5038598/93‑1 (MQ=255) gAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTc > 1:3488159/1‑93 (MQ=255) gAGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTc < 1:2843610/93‑1 (MQ=255) aGTTAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCt > 2:5961514/1‑93 (MQ=255) tAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCg < 2:4093613/93‑1 (MQ=255) tAATATTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCg > 2:3016134/1‑93 (MQ=255) atatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAg < 2:3816358/93‑1 (MQ=255) atatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAg > 1:4905819/1‑93 (MQ=255) atatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGGTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAg > 1:3195349/1‑93 (MQ=255) tatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGt < 1:5635041/93‑1 (MQ=255) tatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGt > 1:5688053/1‑93 (MQ=255) tatTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGt > 1:4605848/1‑93 (MQ=255) atTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTg > 1:6214056/1‑93 (MQ=255) atTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTg > 1:2734746/1‑93 (MQ=255) atTCTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTg > 2:4994864/1‑93 (MQ=255) | TTTTGGTCCGTCTTTAGGACCTCGATTCTGTTCCGAGGGTTGTATAACTGGTTTATCTAATGACATGCAAAAATTAAATGAGTTAATATTTTCAGAGCCAGATAGCACATTAACAGTTACGGACTAAAAAATATGGCAAGGTTATTAACAATTGTATTTTTTTCTCTATTTCTGCGAGTG > NC_000913/3766757‑3766936 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |