Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 440,417 | C→T | A51T (GCC→ACC) | xseB ← | exonuclease VII small subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 440,417 | 0 | C | T | 99.5% | 697.6 / ‑5.1 | 185 | A51T (GCC→ACC) | xseB | exonuclease VII small subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (89/95); total (89/96) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.02e-01 |
Only 100 of 189 total aligned reads displayed.
CTCATTGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGCCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTCCAGACGGGTTACAA > NC_000913/440328‑440506 | cTCATTGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTg > 1:4070242/1‑93 (MQ=255) cATTGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGcc > 1:3810637/1‑93 (MQ=255) cATTGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGcc > 1:1673132/1‑93 (MQ=255) cATTGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGcc > 2:5995082/1‑93 (MQ=255) aTTGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGccc < 1:3554269/93‑1 (MQ=255) ttGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGcccc < 2:6263059/93‑1 (MQ=255) tGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCt < 2:3121700/93‑1 (MQ=255) tGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCt < 2:5489189/93‑1 (MQ=255) tGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCt < 2:962093/93‑1 (MQ=255) tGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCt < 1:514520/93‑1 (MQ=255) ccGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGAc > 2:3183031/1‑93 (MQ=255) ggTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGt < 1:949436/93‑1 (MQ=255) ggTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGt < 1:1284902/93‑1 (MQ=255) gtgtAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTg > 1:5798701/1‑93 (MQ=255) tgtAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGc < 2:2203552/93‑1 (MQ=255) aaaaGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAg > 1:1598440/1‑93 (MQ=255) aaaGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGc > 1:1003595/1‑93 (MQ=255) aaGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCt < 1:791602/93‑1 (MQ=255) aaGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCt < 1:5778061/93‑1 (MQ=255) aaGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCt > 1:5329143/1‑93 (MQ=255) aaGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCt < 1:5160314/93‑1 (MQ=255) aGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTg < 2:6345556/93‑1 (MQ=255) aGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTg > 1:4862195/1‑93 (MQ=255) ggggTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGc > 2:4428403/1‑93 (MQ=255) gggTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCa < 2:2451632/93‑1 (MQ=255) gggTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCa > 2:5919530/1‑93 (MQ=255) gTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCAcg < 2:5388362/93‑1 (MQ=255) ttAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCAcgc < 1:1930887/93‑1 (MQ=255) ttAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCAcgc < 2:3811329/93‑1 (MQ=255) gagGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGt > 2:5618733/1‑93 (MQ=255) gagGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGt < 2:3025137/93‑1 (MQ=255) gagGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGt < 1:4967510/93‑1 (MQ=255) agGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGtt > 2:4998629/1‑93 (MQ=255) agGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGtt < 2:3906630/93‑1 (MQ=255) agGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGtt < 1:3991749/93‑1 (MQ=255) ggCGTCGTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTc < 1:2871691/93‑1 (MQ=255) gCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCg < 2:335208/93‑1 (MQ=255) gCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCg > 2:4781276/1‑93 (MQ=255) cGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGa > 2:5233588/1‑93 (MQ=255) gTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGaa > 1:1506767/1‑93 (MQ=255) tCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAAc > 2:6038057/1‑93 (MQ=255) tCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAAc > 1:3967728/1‑93 (MQ=255) tCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAAc > 2:5989693/1‑93 (MQ=255) tCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAAc < 2:2497282/93‑1 (MQ=255) ttCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTc > 2:821456/1‑93 (MQ=255) ttCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTc > 1:5007054/1‑93 (MQ=255) ttCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTc < 2:5557939/93‑1 (MQ=255) ttCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTc < 2:518462/93‑1 (MQ=255) tCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCg > 1:5706834/1‑93 (MQ=255) tCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCg > 1:3368211/1‑93 (MQ=255) tCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCg < 1:1696711/93‑1 (MQ=255) cATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGt > 2:1277384/1‑93 (MQ=255) aTTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGtt > 2:5755897/1‑93 (MQ=255) ttGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTc > 2:2959579/1‑93 (MQ=255) ttGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTc < 1:1316878/93‑1 (MQ=255) tGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCa < 2:2287885/93‑1 (MQ=255) gTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAg > 1:5559053/1‑93 (MQ=255) tCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAgc < 1:3192761/93‑1 (MQ=255) cAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAgcg > 2:415001/1‑93 (MQ=255) gACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGcc > 2:1869845/1‑93 (MQ=255) cagcagAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCctc < 2:3682115/93‑1 (MQ=255) agcagAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGGctct > 2:3439120/1‑93 (MQ=255) agcagAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCctct < 1:4946123/93‑1 (MQ=255) gcagAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCtt < 2:3416784/93‑1 (MQ=255) gcagAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCAGCGTTCGAACTCGTTCAGAGCCTCtt > 2:5286753/1‑93 (MQ=255) cagAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTc < 1:4691883/93‑1 (MQ=255) cagAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTc < 2:5019861/93‑1 (MQ=255) agAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTcc > 2:4888446/1‑93 (MQ=255) gAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCa < 1:5491023/93‑1 (MQ=255) gAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCa > 1:4582407/1‑93 (MQ=255) gAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCa > 1:673759/1‑93 (MQ=255) aTTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGc > 1:53071/1‑93 (MQ=255) tGTCCGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGc < 1:1984316/93‑1 (MQ=255) tGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGc < 1:1889505/93‑1 (MQ=255) tGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGc > 1:2655425/1‑93 (MQ=255) gTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCa > 2:1470439/1‑93 (MQ=255) tACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAg < 2:606347/93‑1 (MQ=255) gcgcTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTc < 2:4083583/93‑1 (MQ=255) gcgcTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTc < 1:6091760/93‑1 (MQ=255) gcgcTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTc > 2:2865064/1‑93 (MQ=255) cgcTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCg > 2:2403239/1‑93 (MQ=255) cgcTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCg > 1:4126507/1‑93 (MQ=255) tGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCa < 1:1418525/93‑1 (MQ=255) gTTCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCAc < 1:1193638/93‑1 (MQ=255) ttCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACt < 2:1913712/93‑1 (MQ=255) ttCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACt < 1:4654800/93‑1 (MQ=255) tCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACtt < 1:336706/93‑1 (MQ=255) tCGGCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACtt > 1:245724/1‑93 (MQ=255) cGGCTTTTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGCCGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACttt < 2:2789887/93‑1 (MQ=255) ggCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTc > 1:2205686/1‑93 (MQ=255) ggCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCAAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCCCTTTc > 2:2011358/1‑93 (MQ=255) gCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTcc < 2:854294/93‑1 (MQ=255) gCTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGGCGGCACCTTcc > 1:2370858/1‑93 (MQ=255) cTTGTTGTAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTCCa > 2:112579/1‑93 (MQ=255) ttgtAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTCCAGACg > 2:1410614/1‑93 (MQ=255) tAATTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTCCAGACGGGt < 1:4902045/93‑1 (MQ=255) aaTTTGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTCCAGACGGGtt > 2:6427440/1‑93 (MQ=255) tttGGTGTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTCCAGACGGGTTAc < 1:6046539/93‑1 (MQ=255) tttGGTCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTCCAGACGGGTTAc < 2:720452/93‑1 (MQ=255) ttGGCCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTCCAGACGGGTTACa < 2:1803669/93‑1 (MQ=255) | CTCATTGTCCGGTGTAAAAGGGGTTAGAGAGGCGTCTTCATTGTCAGACAGCAGAATTTGTACGCGCTGTTCGGCTTGTTGTAATTTGGCCTGCCCCTGACGTGCCAGCTGCACGCCGCGTTCGAACTCGTTCAGCGCCTCTTCCAGCGGCAGGTCGCCACTTTCCAGACGGGTTACAA > NC_000913/440328‑440506 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |