| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,027,599 | T→C | A321A (GCA→GCG) | fadB ← | 4‑enzyme protein: 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,027,599 | 0 | T | C | 99.6% | 853.6 / ‑5.6 | 246 | A321A (GCA→GCG) | fadB | 4‑enzyme protein: 3‑hydroxyacyl‑CoA dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (112/133); total (113/133) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.59e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.94e-01 | |||||||||||
Only 100 of 254 total aligned reads displayed.
GAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAAT > NC_000913/4027509‑4027688 | gAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGc > 2:362567/1‑93 (MQ=255)gAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCAGc > 2:2013283/1‑93 (MQ=255) aGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCa > 2:4804007/1‑93 (MQ=255) gggTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCAc > 1:6196598/1‑93 (MQ=255) ggTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCAcc < 2:3044255/93‑1 (MQ=255) gTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCAccc < 1:2473635/93‑1 (MQ=255) ttAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCa > 1:615977/1‑93 (MQ=255) tAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAg > 1:4421325/1‑93 (MQ=255) aCGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCa > 1:1012522/1‑93 (MQ=255) gACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCAcc < 2:3705305/93‑1 (MQ=255) cTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACcgc > 1:5731624/1‑93 (MQ=255) ttGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACcgcg < 1:2368827/93‑1 (MQ=255) cGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCt < 1:1341976/93‑1 (MQ=255) gTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTg < 2:1310109/93‑1 (MQ=255) gTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTg > 1:949085/1‑93 (MQ=255) ttGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGt > 1:3887061/1‑93 (MQ=255) tGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGtt < 2:5794225/93‑1 (MQ=255) tGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGtt > 1:4979682/1‑93 (MQ=255) atatCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTc > 1:5222529/1‑93 (MQ=255) atCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCgg < 2:3548574/93‑1 (MQ=255) tCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCggg > 2:551315/1‑93 (MQ=255) ttCATGACACCCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGtt < 1:1763832/93‑1 (MQ=255) ttCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGtt < 1:5010056/93‑1 (MQ=255) aTGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCa < 2:1109750/93‑1 (MQ=255) tGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCaa < 2:2583706/93‑1 (MQ=255) gACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAc < 1:26153/93‑1 (MQ=255) gACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAc > 2:6462114/1‑93 (MQ=255) gACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAAc > 1:1112472/1‑93 (MQ=255) aCAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGCTTCAACg > 2:223904/1‑93 (MQ=255) cAACCGGCCCGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCCATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGt < 2:156846/93‑1 (MQ=255) aCCGGCACCCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCt > 1:4633386/1‑93 (MQ=255) ccGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCtt < 1:2281836/93‑1 (MQ=255) ccGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCtt < 2:1730495/93‑1 (MQ=255) cGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCttt < 1:3247914/93‑1 (MQ=255) ggCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTg > 2:5363828/1‑93 (MQ=255) ggCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTg < 1:2734718/93‑1 (MQ=255) gCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTgg > 2:241265/1‑93 (MQ=255) cACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGt < 1:3375683/93‑1 (MQ=255) cACGCCTTTCCACCCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGt < 1:1876180/93‑1 (MQ=255) aCGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTg < 1:5084587/93‑1 (MQ=255) aCGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTg > 2:3535234/1‑93 (MQ=255) aCGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCCCCCATAATGCCCGCACTCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGAGTTCCAACGTCTTTGGTg > 1:3577947/1‑93 (MQ=255) cGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGa < 2:5113719/93‑1 (MQ=255) cGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGa < 2:5195248/93‑1 (MQ=255) gCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAg < 2:1760745/93‑1 (MQ=255) gCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAg < 2:4165690/93‑1 (MQ=255) ccTTTCCCCGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGt < 2:4966444/93‑1 (MQ=255) cTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGTCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTCTCGGGGTTTCTACGTCTTTGGTGAGtt > 1:6474991/1‑93 (MQ=255) cTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGtt < 2:2937637/93‑1 (MQ=255) tttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGTGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGttt > 2:4293790/1‑93 (MQ=255) tttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGttt < 2:1362387/93‑1 (MQ=255) ttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttc > 2:290085/1‑93 (MQ=255) ttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttc < 2:5908907/93‑1 (MQ=255) ttCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttc < 2:6440411/93‑1 (MQ=255) tCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttct > 2:468320/1‑93 (MQ=255) ccACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttctt < 2:6193191/93‑1 (MQ=255) cACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTttcttc < 1:1690935/93‑1 (MQ=255) cGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGc < 2:2034601/93‑1 (MQ=255) gCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCt < 1:2245098/93‑1 (MQ=255) gCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCt < 1:3777522/93‑1 (MQ=255) cAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCtt < 1:3040229/93‑1 (MQ=255) cAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCtt < 1:3747475/93‑1 (MQ=255) aGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCttt > 2:5505322/1‑93 (MQ=255) aGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCttt < 1:73822/93‑1 (MQ=255) aGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCttt > 2:2428744/1‑93 (MQ=255) aGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCttt > 1:3495816/1‑93 (MQ=255) gACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTg > 2:5219221/1‑93 (MQ=255) aCTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGc < 2:6321379/93‑1 (MQ=255) tGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCt > 1:2915053/1‑93 (MQ=255) ggTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCtt > 2:4606286/1‑93 (MQ=255) ggTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCtt > 2:3139535/1‑93 (MQ=255) ggTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCtt < 1:6109879/93‑1 (MQ=255) gTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCGGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCttt > 2:559589/1‑93 (MQ=255) aGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTAc < 1:3662808/93‑1 (MQ=255) aGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTAc > 2:4109103/1‑93 (MQ=255) aGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTATCTTCGCTTTGCCTTTTAc < 1:6324901/93‑1 (MQ=255) gCGATGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACa < 1:5337591/93‑1 (MQ=255) aTGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACatat > 1:2806064/1‑93 (MQ=255) aTGCCGCCGCCCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACatat < 1:137638/93‑1 (MQ=255) ccgccgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGa < 1:1510645/93‑1 (MQ=255) ccgccgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGa > 2:1830281/1‑93 (MQ=255) gccgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATc > 2:796863/1‑93 (MQ=255) cgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGt < 1:5899005/93‑1 (MQ=255) cgccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGt < 1:15464/93‑1 (MQ=255) gccCATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGtt > 1:3999045/1‑93 (MQ=255) cccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTa < 1:3870091/93‑1 (MQ=255) cccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTa > 2:5161616/1‑93 (MQ=255) cccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTa > 1:1837198/1‑93 (MQ=255) ccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGTGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTaa < 1:2521961/93‑1 (MQ=255) ccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTaa < 1:5483055/93‑1 (MQ=255) ccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTaa > 1:4782636/1‑93 (MQ=255) ccATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTaa < 2:4457339/93‑1 (MQ=255) cATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAg < 1:4097583/93‑1 (MQ=255) cATAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAg < 2:277515/93‑1 (MQ=255) tAATGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGa > 1:6328354/1‑93 (MQ=255) aaTGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaa > 1:4190131/1‑93 (MQ=255) aTGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaaa > 1:782016/1‑93 (MQ=255) tGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaaaa < 2:3847177/93‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaaaa < 2:57228/93‑1 (MQ=255) tGCCCGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGaaaa < 1:4319236/93‑1 (MQ=255) | GAGGGTTAACGACTTGTCGTTGATATCTTTCATGACAACCGGCACGCCTTTCCACGCAGACTGGTAAGCGATGCCGCCGCCCATAATGCCTGCACCCAGCACCGCGGCCTGTTTCGGGGTTTCAACGTCTTTGGTGAGTTTCTTCGCTTTGCCTTTTACATATTGATCGTTAAGGAAAAT > NC_000913/4027509‑4027688 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |