BRESEQ :: Evidence

Predicted mutation
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RA	NC_000913	4,310,789	T→C	intergenic (‑219/‑140)	b4089 ← / → rpiB	RpiR/ribose 5‑phosphate isomerase B

Read alignment evidence...
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*	NC_000913	4,310,789	0	T	C	100.0%	413.6 / NA	119	intergenic (‑219/‑140)	b4089/rpiB	RpiR/ribose 5‑phosphate isomerase B
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                                                                         ttGCTGGATGGTGAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGgtgt                >  2:4222078/1‑93 (MQ=255)

                                                                            cTGGATGGTGAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGtttt             >  2:4374617/1‑93 (MQ=255)

                                                                                aTGGTGAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAAt         <  2:989221/93‑1 (MQ=255)

                                                                                 tGGTGAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAAtt        >  2:2911212/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  ggTGAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTc       >  1:2944124/1‑93 (MQ=255)

                                                                                  ggTGAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTc       >  2:5178009/1‑93 (MQ=255)

                                                                                    tGAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCAt     <  1:4650183/93‑1 (MQ=255)

                                                                                     gAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCAtt    <  1:5943240/93‑1 (MQ=255)

                                                                                     gAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCAtt    <  1:2124477/93‑1 (MQ=255)

                                                                                     gAGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCAtt    >  2:4763394/1‑93 (MQ=255)

                                                                                      aGTGCCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTa   >  2:5424476/1‑93 (MQ=255)

                                                                                       gtgcCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTaa  <  2:1309348/93‑1 (MQ=255)

                                                                                       gtgcCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTaa  >  2:1987543/1‑93 (MQ=255)

                                                                                       gtgcCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTaa  >  2:3178133/1‑93 (MQ=255)

TAAAATTTTATTTCATTTAATTAGTTTAAAAACATGATGTTATTTGTTTTTCTGGTTTTTTAGATGATAGATGTTGCTGGATGGTGAGTGTCTTTAACGCTATTGCGCTGTCAGATGTAACTCTGTAAAACAGATCAGGAAGGCGTAATTCATCGATTTTGGGTGTTTTTAATTCATTAA  >  NC_000913/4310699‑4310878

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): `ATCG/ATCG` `< 3 ≤` `ATCG/ATCG` `< 26 ≤` `ATCG/ATCG` `< 31 ≤` `ATCG/ATCG` `< 35 ≤` `ATCG/ATCG` `< 41 ≤` `ATCG/ATCG`
Unaligned base: `atcg` Masked matching base: `atcg` Alignment gap: `‑` Deleted base: `‑`