| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | = 994389 | 434 (1.680) | 4 (0.020) | 4/514 | 22.0 | 0.93% | coding (380/642 nt) | ycfM | predicted outer membrane lipoprotein |
| ? | AP012306 | = 994637 | 436 (1.750) | coding (628/642 nt) coding (6/825 nt) |
ycfM ycfN |
predicted outer membrane lipoprotein thiamin kinase |
|||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 435 total aligned reads displayed.
AGTGAAACCAGCGCCGGAACAACCAGCCGAGCCACAACAGCCTGTCCCCACAGTGCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACGTGCTGTACTCCAGCGCCTCTGGCAACGTTAACGCTCCGACCCTACAAATGCAGCTGATGCTGGTGCAGACGGGCGAAATTATCTGGTCAGGTAAAGGTGCCGTTTCGCAGCAATAATCCCATCACGCGCGACGAAT > AP012306/994102‑994671 | agTGAAACCAGCGCCGGAACAACCAGCCGAGCCACAACAGCCTGTCCCCACAGTGCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAAt > 1:1962214/1‑289 (MQ=255) tGAAACCAGCGCCGGAACAACCAGCCGAGCCACAACAGCCTGTCCCCACAGTGCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACGGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATTCCGCAGAATCGACCGAAACGCTGCGAAATgc > 2:1937263/1‑289 (MQ=255) aacccAGCGCCGGAACACCCAGCCGAGCCACAACAGCCTGTCCCCACAGTGCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg < 1:1917992/285‑1 (MQ=255) aaCCAGCGCCGGAACACCCAGCGGAGCCCCACCAGCCTGTCCCACCAGGGCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCGGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg < 2:41851/287‑1 (MQ=255) ccAGCCGAGCCACACCAGCCTGTCCCCACAGTGCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAAt < 1:615260/289‑1 (MQ=255) gCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg < 1:1182917/238‑1 (MQ=255) gCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGGTGGCTAATAACCGGAAATTTACCCTGGTTTTCGCCCAGCAACTGGCGATg > 2:1214937/1‑289 (MQ=255) gCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACttacgctt > 2:889943/1‑282 (MQ=255) gCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATg > 1:1866714/1‑289 (MQ=255) gCCCTCGGTGCCGACGATCCCGCAGCAGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATg > 2:539930/1‑289 (MQ=255) cccGCAGCCGCCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCTCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTCTTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCCCTGGCCAATAACGGGAAATTTACCGTGGTTTCCGCCCACCAACTGTCGATGTCGAAGCAAGAGttcagt > 2:1193666/1‑285 (MQ=255) ctgaaccAGGCCCAAGTGAGCACGCAGGTCAAACTGCACCGCCTGCTCTGGCAGTTCGCCATTATGACGGGAATGGCGAAATGGAGCAGATGGTCAGTAAGGTGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTACTGCTGGTGGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGGGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTAGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGt < 2:1957425/283‑1 (MQ=255) gcCAGGCCCAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg < 2:1142860/211‑1 (MQ=255) cccAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGTGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAgg < 1:249559/287‑1 (MQ=255) cccAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAgg < 1:384192/287‑1 (MQ=255) cccAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAgg < 1:1761757/287‑1 (MQ=255) cccAATTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGa < 1:1936113/288‑1 (MQ=255) ccaaaTTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGa < 2:518926/285‑1 (MQ=255) ccAATTGGGAACGAAGACCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCTAATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGAc < 2:932916/288‑1 (MQ=255) aTTGAGCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGTTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGACATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTAACCTGGGTTCCTCCCAGCAACTGTCGATGGCGCAGCAACAGTTAGGTTTGTCTCCGCACGACAggt > 2:1349681/1‑287 (MQ=255) gCACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAgg < 1:547686/288‑1 (MQ=255) cACGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGc > 2:650325/1‑288 (MQ=255) cGAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCAcc < 1:179549/289‑1 (MQ=255) gAAGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCAccc > 1:643929/1‑289 (MQ=255) aGATCAAACTGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCgt > 2:90518/1‑289 (MQ=255) tGCACCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGc > 2:1106571/1‑288 (MQ=255) aCCGCCTGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGTAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGCCAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATa > 2:241125/1‑289 (MQ=255) tGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCAtt < 1:1077191/289‑1 (MQ=255) tGCGCCGCATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCAtt > 1:7729/1‑289 (MQ=255) gccgcATATTCGCCATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAgg > 1:420913/1‑282 (MQ=255) cATTATGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGgcg < 1:1203721/289‑1 (MQ=255) aTTAGGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGgcgc < 1:46327/289‑1 (MQ=255) aTGACTGGAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTGAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCa < 2:500167/289‑1 (MQ=255) gcTGGATGGGGGCAATGCAGCGGATGGTCAGTAGGATGCTTGGGGCGGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCAtt < 2:319433/287‑1 (MQ=255) tgcatgggggcAATGCAGCGGCTGGTCAGTAAAATGCTGGGGGCTGCCGGGGGGACGGGGGGTACCGTCATGGTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTGATGGTTCGCGGAATACCGCAGCAGGGACCGAAACGCTGGGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTGGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACg < 2:1510742/280‑1 (MQ=255) ggAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATgcg > 1:738381/1‑146 (MQ=255) ggAATGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCCAAATGCGCCGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCCCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGGTTCAGCCCCCGTAGTAAACCCCTAGGCCTTTCCCGCAACTGCGGCGCTCACTACGt > 2:1899619/1‑289 (MQ=255) aaTGGCGCAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACGt > 1:267880/1‑287 (MQ=255) cgcAATGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACGTGCTGt > 1:1819922/1‑287 (MQ=255) tGCGGCCGATGGTCAGGAAGATGATTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGGTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACGTGCTGTACTCCAg < 2:1728594/289‑1 (MQ=255) tGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGa < 2:1045352/217‑1 (MQ=255) tGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACGTGCTGTACTCCa > 1:1728594/1‑288 (MQ=255) tGCAGCCGATGGTCAGTAAGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACGTGCTGTACTCCAg < 1:851132/289‑1 (MQ=255) 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aaGATGCTTGGGGGTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACGTGCTGTACTCCAGCGCCTCTGGCAACGtt < 1:218668/288‑1 (MQ=255) aaGATGCTTGGGGCGGACGGGGGGAGTGCGGGTGTCGTCCTGCTGGTGGATCGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACGTGCTGTACTCCAGCGCCTCTGGCAACGTTa < 2:1076585/289‑1 (MQ=255) aGATGCTTGGGGCTGACGGGGTGACTGCGGGTAGCGTCCTGCTGGTTGATAGCGTTAACAACCGTACTAACGGTTCGCTGAATGCCGCAGAAGCGACCGAAACGCTGCGAAATGCGCTGGCTAATAACGGGAAATTTACCCTGGTTTCCGCCCAGCAACTGTCGATGGCGAAGCAACAGTTAGGTTTGTCGCCGCAGGACAGTTTAGGCACCCGTAGTAAAGCCATAGGCATTGCCCGCAATGTCGGCGCTCATTACGTGCTGTACTCCAGCGCCTCTGGCAACGTTaa < 2:728078/289‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |