| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | AP012306 | 2905748 = | 230 (0.910) | 3 (0.010) | 3/520 | 22.6 | 1.4% | intergenic (+2/‑128) | trkA/mscL | NAD‑binding component of TrK potassium transporter/mechanosensitive channel |
| ? | AP012306 | 2905776 = | 210 (0.870) | intergenic (+30/‑100) | trkA/mscL | NAD‑binding component of TrK potassium transporter/mechanosensitive channel | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 230 total aligned reads displayed.
AGATATTGTTGGTGTTTCCTCATTGCGCCGCGGCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGTTAGACTTATGGTTGTCGGCTTCATAGGGAGAATAACATGAGCATTATTAAAGAATTTCGCGAATTTGCGATGCGCGGGAACGTGGTGGATTTGGCGGTGGGTGTCATTATCGGTGCGGCATTCGGGAAGATTGTCTCTTCACTGGTTGCCGATATCATCATGCCTCCTCTGGGCTTATTAATTGGCGGGATCGAT > AP012306/2905464‑2906034 | aGATATTGTTGGTGTTTCCTCATTGCGCCGCGGCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGtaattaat < 1:957745/288‑1 (MQ=255) tcttgttgGTGTTTCGTCCTTGCGCCGCGGCGTGGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGCTGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAg < 2:344058/286‑1 (MQ=255) tatTGTTTGTGTTTCCTCATTGCGCCGCGGCGTAGCAAAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATtaata < 1:1267499/286‑1 (MQ=255) tatTGTTGGTGTTTCCTCATTGCGCCGCGGCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAg < 1:1630840/288‑1 (MQ=255) tatTGTTGGTGTTTCCTCATTGCGCCGCGGCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAg < 2:846109/288‑1 (MQ=255) tgGTGTTTCCTCATTGCGCCGCGGCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTa > 1:919959/1‑289 (MQ=255) tgtTTCCTCATTGCGCCGCGGCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAAt < 2:368072/288‑1 (MQ=255) gttaccacgttGCCCCGCGGCGTGGAAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTAACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGa < 2:245451/280‑1 (MQ=255) gtTTCCTCATTGCGCCGCGGCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGa < 1:85151/289‑1 (MQ=255) tCCTCATTGCGCCGCGGCGGAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGc < 2:913819/289‑1 (MQ=255) 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ttGCGCCGCGGCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCttatt > 2:285804/1‑289 (MQ=255) cgcggcGCCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCAGTTGCTCACGGTGATGAAAGAACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTtattat < 2:589459/288‑1 (MQ=255) gccgcGGCGTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTattatt < 2:1507993/288‑1 (MQ=255) gcgTAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCtt < 1:551463/288‑1 (MQ=255) tAGCAGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGCAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGAt > 1:1323314/1‑289 (MQ=255) aGAAGCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATc < 1:1029861/289‑1 (MQ=255) gCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAgg > 1:1087285/1‑289 (MQ=255) gCTATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAgg > 1:1387283/1‑289 (MQ=255) tATTGAAGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGat > 1:1137028/1‑289 (MQ=255) aGCCGTTGCTCACGGTGATGAAAGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGattaatta > 1:40866/1‑289 (MQ=255) aaGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGaaaa < 1:1700025/289‑1 (MQ=255) aaGCACCTCACGCGTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGaaaa < 1:387366/289‑1 (MQ=255) 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aCGCGTTGTCGGAAGAGGCATTGACGAAATCAAGCGAACGCCAAGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAAc < 2:1705626/289‑1 (MQ=255) gcgTTGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACAt > 1:21024/1‑289 (MQ=255) tGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTATCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGt < 1:1660900/289‑1 (MQ=255) tGTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGt < 1:1104217/289‑1 (MQ=255) gTCGGCAGAGTCATTGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAGGCGTCTAATGACGCCTTATTATTTCCCTTTGATTATCAAGGATTAATTAAATTCATTCCTGGCAGGAAAATGGCTTAACATTTGtt > 1:466851/1‑289 (MQ=255) ttGACGAAATCAAGCTACCGCCAGGAACGATTATTGGAGCGGTGGTACGTGGAAACGACGTGATGATTGCCAATGACAATCTGCGCATTGAGCAAGGCGATCACGTAATTATGTTCCTCACAGATAAAAAGTTTATTACCGACGTCGAAAGACTCTTCCAGCCAAGCCCTTTCTTCTTGTAATTAATAAg < 2:131987/190‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |