Predicted mutation | ||||||
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RA | BA000036 | 364,912 | A→C | E363D (GAA→GAC) | Cgl0344 → | ATPases involved in chromosome partitioning |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BA000036 | 364,912 | 0 | A | C | 99.4% | 708.3 / NA | 175 | E363D (GAA→GAC) | Cgl0344 | ATPases involved in chromosome partitioning |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); major base C (84/89); minor base T (0/1); total (84/91) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
TAAACCTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGAAAAGGTCATTGCGGAGCTTGAGGAAAGCTTTGATTATGTGATCATCGATGCCCCTCCGGCGTTGGCGGTTACCGATGCTGCAGTTATTGGTCATGGCAAGGCTGGCATCCTGATTGCGGTCTCCGCAGGTTCTACAAAGAAGCCTGAGTTGGAAGCTACGCTGTCCACGCTTGAGAATGCGGATGCCAATGTTGTTGGCGTTGTCGCTACGATGCTCCCGCCTAAGTCTGTGGCTGGTTATGGCTA > BA000036/364668‑365157 | aaaCCTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGt < 1:132435/249‑1 (MQ=255) aaaCCTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGt < 1:132434/249‑1 (MQ=255) cTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGTCAtt < 2:132436/249‑1 (MQ=255) cTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGTCAtt > 2:132580/1‑249 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |