| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | BA000036 | 1,175,384 | 0 | T | C | 21.2% | 394.6 / 28.2 | 152 | P296P (CCA→CCG) | Cgl1129 | Pyruvate and 2‑oxoglutarate dehydrogenases, E1 component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (28/91); new base C (32/0); total (60/92) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.76e-16 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
TCATCCCAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATGCCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTCATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGATGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGATGACGTCGTAGGAGTTGT > BA000036/1175136‑1175631 | tcATCCCAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTGCCCATGGCACCt > 2:500316/1‑249 (MQ=255) 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TCATCCCAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATGCCACCTGGGTTGGTCAAGGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTCATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGATGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGATGACGTCGTAGGAGTTGT > BA000036/1175136‑1175631 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |