Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | BA000036 | 2,981,097 | C→T | L201L (CTG→CTA) | Cgl2796 ← | NAD‑dependent aldehyde dehydrogenases |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BA000036 | 2,981,097 | 0 | C | T | 99.5% | 861.4 / NA | 207 | L201L (CTG→CTA) | Cgl2796 | NAD‑dependent aldehyde dehydrogenases |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (96/110); minor base A (0/1); total (96/111) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
GAAGGCGTCATCCTGTGACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATCAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCGATTGCCAGTGG > BA000036/2980851‑2981342 | aGGCGTCATCCTGTGACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGAt < 1:1174538/249‑1 (MQ=255) ggCGTCATCCTGTGACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATa < 2:1174540/249‑1 (MQ=255) gCGTCATCCTGTGACAGAACATCGGAGGAGAAGATGGATGTGGACTTACCGTCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTATAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATAc < 1:1174544/249‑1 (MQ=255) gCGTCATCCTGTGACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATAc < 2:1174542/249‑1 (MQ=255) cGTCATCCTGTGACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACa < 2:1174545/249‑1 (MQ=255) tCATCCTGTGACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGACGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACaaa > 1:1174676/1‑249 (MQ=255) cATCCTGTGACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACaaaa < 2:1174548/249‑1 (MQ=255) ccTGTGACAGAACCTCTGAGAAGAAGCTGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTAGTTGGAACCGGTAAAAGCAATCTTTCCAAACAGATTAGAGCCGGACAGGGCAGCGCCTGCTTCACCTCCGAGTACGTTGGATATGTTTAGGACGCTCTCTGGGATGATATCGCAGATGAAGTTAATTAGATACAAAATgg > 2:1174869/1‑249 (MQ=255) ccTGTGACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATgg < 1:1174550/249‑1 (MQ=255) gtgACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATg < 2:1174551/249‑1 (MQ=255) gACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCt < 1:1174553/249‑1 (MQ=255) cATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCt < 1:1174556/249‑1 (MQ=255) aTCGGAGAAGAAGATGGATGGGGCCTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTg < 2:1174557/249‑1 (MQ=255) tCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGc > 2:1174699/1‑249 (MQ=255) cGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCt > 1:1174713/1‑249 (MQ=255) cGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCt > 1:1174755/1‑249 (MQ=255) cGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCt > 2:1174707/1‑249 (MQ=255) agaagaagaTGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAg > 1:1174619/1‑249 (MQ=255) agaagaTGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTg < 2:1174560/249‑1 (MQ=255) gaagaTGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTgg < 1:1174561/249‑1 (MQ=255) atggatggGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTc > 1:1174726/1‑249 (MQ=255) tggGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGAc > 2:1174638/1‑249 (MQ=255) ggggACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACg < 1:1174565/249‑1 (MQ=255) ggACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGAt > 2:1174622/1‑249 (MQ=255) ggACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGAt < 2:1174566/249‑1 (MQ=255) gACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATc > 1:1174644/1‑249 (MQ=255) gACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATc < 1:1174568/249‑1 (MQ=255) aCCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGtt < 1:1174570/249‑1 (MQ=255) ccgAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCt < 2:1174573/249‑1 (MQ=255) cgAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTg > 2:1174686/1‑249 (MQ=255) aGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGGTCGCGTTACCTgcn > 1:1174685/1‑248 (MQ=255) cTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTgcagc > 1:1174649/1‑249 (MQ=255) cTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTgcagc > 2:1174736/1‑249 (MQ=255) cTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTgcagc < 2:1174575/249‑1 (MQ=255) cAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAg < 1:1174577/249‑1 (MQ=255) gTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGcc < 2:1174578/249‑1 (MQ=255) gACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCgg < 1:1174581/249‑1 (MQ=255) aCAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGTTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGt > 1:1174701/1‑249 (MQ=255) cAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTg < 1:1174583/249‑1 (MQ=255) aGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGc > 2:1174693/1‑249 (MQ=255) ggAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGCCGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCg > 2:1174779/1‑249 (MQ=255) ggAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCg < 2:1174584/249‑1 (MQ=255) ggAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTACATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCg > 2:1174815/1‑249 (MQ=255) gAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCgn > 2:1174648/1‑248 (MQ=255) aTGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGc < 2:1174586/249‑1 (MQ=255) tGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACTGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCAt > 1:1174761/1‑249 (MQ=255) tGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCAt > 1:1174659/1‑249 (MQ=255) gCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATg > 1:1174728/1‑249 (MQ=255) cAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGa < 2:1174589/249‑1 (MQ=255) aGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAg < 1:1174590/249‑1 (MQ=255) tGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGa > 2:1174696/1‑249 (MQ=255) gATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGan > 1:1174780/1‑248 (MQ=255) aTCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAg < 1:1174592/249‑1 (MQ=255) tGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAg > 1:1174674/1‑249 (MQ=255) gACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAAt < 1:1174595/249‑1 (MQ=255) aCCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATg < 2:1174596/249‑1 (MQ=255) aCCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACcaac > 1:1174893/1‑249 (MQ=255) ccGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACcaaca < 1:1174600/249‑1 (MQ=255) cGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACcaacaa < 2:1174601/249‑1 (MQ=255) cGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGATGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGGTCCCAGGAATGATCTGACcaacaa > 2:1174734/1‑249 (MQ=255) gTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAacaaca < 1:1174603/249‑1 (MQ=255) aaaGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCg < 1:1174605/249‑1 (MQ=255) aaGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGa < 2:1174606/249‑1 (MQ=255) aGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGAt > 2:1174710/1‑249 (MQ=255) aGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGAt > 2:1174748/1‑249 (MQ=255) aGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGAt < 2:1174609/249‑1 (MQ=255) gCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGAtt < 1:1174610/249‑1 (MQ=255) aaTCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTgg > 1:1174793/1‑249 (MQ=255) aTCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGc > 2:1174663/1‑249 (MQ=255) cTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTc > 1:1174720/1‑249 (MQ=255) ttGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCg > 2:1174786/1‑249 (MQ=255) cAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGa < 2:1174613/249‑1 (MQ=255) aaTCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGaa < 2:1174615/249‑1 (MQ=255) agCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCaa > 1:1174666/1‑249 (MQ=255) ccGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAAcn > 1:1174751/1‑248 (MQ=255) gACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGTCGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCTGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAgtg < 1:1174617/249‑1 (MQ=255) gCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTgg < 2:1174619/249‑1 (MQ=255) cACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAgg < 1:1174622/249‑1 (MQ=255) gAGTCCGGTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATc < 1:1174625/249‑1 (MQ=255) gTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTg > 1:1174822/1‑249 (MQ=255) cGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCAc < 2:1174626/249‑1 (MQ=255) gATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACg < 2:1174629/249‑1 (MQ=255) tGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGa > 1:1174746/1‑249 (MQ=255) cGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAg > 1:1174744/1‑249 (MQ=255) cccTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCa < 1:1174631/249‑1 (MQ=255) nngggATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGt < 2:1174632/247‑1 (MQ=255) ctGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGt > 2:1174712/1‑249 (MQ=255) ctGGGATGAGATCGCCGATGACGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTAACTGCAGCAAGTACCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTTACCATCAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAGCTGTGTTGTGGACGATCTGCGAGGCAACAACTCCCTTAGCACGGACCGCGCCAGCAAAGt > 2:1174800/1‑249 (MQ=255) gggATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAg > 2:1174759/1‑249 (MQ=255) ggATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGc < 1:1174634/249‑1 (MQ=255) gATGAGATCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCg < 1:1174636/249‑1 (MQ=255) tCGCCGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTgg > 1:1174814/1‑249 (MQ=255) ccGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCg > 2:1174725/1‑249 (MQ=255) ccGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCg < 1:1174638/249‑1 (MQ=255) cGATGATGTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCGa < 2:1174640/249‑1 (MQ=255) atgatgTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCGAtt > 2:1174716/1‑249 (MQ=255) atgatgTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCGAtt < 2:1174642/249‑1 (MQ=255) atgatgTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCGAtt < 1:1174641/249‑1 (MQ=255) tgTTAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCGATTGCCa < 2:1174644/249‑1 (MQ=255) ttAATTAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCGATTGCCAGt > 1:1174737/1‑249 (MQ=255) | GAAGGCGTCATCCTGTGACAGAACATCGGAGAAGAAGATGGATGGGGACTTACCGCCGAGCTCCAGGGTGACAGGAATGATCTTGTCGGATGCAGCGCGGTTGATCAGCTTGCCGACCTCGGTGGAACCGGTGAAAGCAATCTTGCCAATCCGATTAGAGCCGGACAGTGCAGCGCCTGCTTCACCGCCGAGTCCGTTGACGATGTTGAGGACGCCCTCTGGGATGAGATCGCCGATGATGTTAATCAGATACAAAATGGATGCTGGGGTCTGCTCAGCTGGCTTCATGACGATCGCGTTACCTGCAGCAAGTGCCGGTGCGAGCTTCCAGGTAGCCATGAGGATTGGGAAGTTCCAAGGAATGATCTGACCAACAACACCGATTGGCTCGTTGAAGTGGTAAGCAACAGTGTTGTGGTCGATCTGTGAGGAACGATCTTCCTGAGCACGGATCGCGCCAGCAAAGTAGCGGAAGTGGTCGATTGCCAGTGG > BA000036/2980851‑2981342 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |