Predicted mutation | ||||||
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RA | BA000036 | 364,912 | A→C | E363D (GAA→GAC) | Cgl0344 → | ATPases involved in chromosome partitioning |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | BA000036 | 364,912 | 0 | A | C | 99.5% | 833.2 / NA | 209 | E363D (GAA→GAC) | Cgl0344 | ATPases involved in chromosome partitioning |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (107/101); minor base G (1/0); total (108/101) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 209 total aligned reads displayed.
AACCTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGAAAAGGTCATTGCGGAGCTTGAGGAAAGCTTTGATTATGTGATCATCGATGCCCCTCCGGCGTTGGCGGTTACCGATGCTGCAGTTATTGGTCATGGCAAGGCTGGCATCCTGATTGCGGTCTCCGCAGGTTCTACAAAGAAGCCTGAGTTGGAAGCTACGCTGTCCACGCTTGAGAATGCGGATGCCAATGTTGTTGGCGTTGTCGCTACGATGCTCCCGCCTAAGTCTGTGGCTGGTTATGGCTA > BA000036/364670‑365157 | ccTAGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGTCAt < 1:156117/249‑1 (MQ=255) aGCTTTGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGTCATTGc < 2:156119/249‑1 (MQ=255) tttGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGTCATTGCggn > 1:156254/1‑248 (MQ=255) tttGGCGCTTGCAGAGGCCGGCTCCCGTGTAGCGCTGATCGAAGCTGATCTTCGCTTGCCACGAGTGAGCAAGTACCTCGGAGTTGAGGGCAACGCAGGTCTGACTGACATTCTCATTGGCAAGGCCGAGGTTAATGATGTGTTGCAGCGTTGGGGTAGGACTCAGTTGTACTATCTCCCGGCAGGGCGCATTCCGCCGAACCCGAGTGAGTTGCTTGGTTCAGCTGAGATGGACAAGGTCATTGCGGa > 1:156195/1‑249 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |