Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | BA000036 | 1,175,384 | 0 | T | C | 23.2% | 341.8 / 30.2 | 142 | P296P (CCA→CCG) | Cgl1129 | Pyruvate and 2‑oxoglutarate dehydrogenases, E1 component |
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Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CATCCCAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATGCCACCTGGGTTGGTCAA‑GGAAACGGTAACGCCCTGGTAGTCATCCATGGTGAGCTTGCCCTTGCGGGAGCGTGCCACGATGTCTTCGTAGGCTGCGAGGAACTCGGAGAAGTTCATCTTCTCGGTTTCCTTGATGGCTGCTACGACAAGTGCGCGGGAGCCGTCCTTCTGAGGAAGGTCGATAGCAAGGCCCAGGTTGATGTGCTCAGGCACGATCAGGGTTGGCTTGCCGTCGATGACGTCGTAGGAGTTGTT > BA000036/1175137‑1175632 | cATCCCAGAAGGAATCATCGGTGAGCAGGCGAGACATGGTGCGCAGGAATTCACCGGACACAGCACCCTGGATCACGCGGTGATCGTAGGTGGAGGTGATGGTGACAAGTTTGCCAACGCCGAGCTCTGCAAGGCGGTCTTCTGAAGCGCCCTGGAACTCTGCTGGGTAATCCATGGAACCGACACCGATGATGGTGCCCTGGCCCTTGGTTAGACGTGGAACAGAGTGGCGGGTACCGATGCCACCTg < 1:482758/249‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |