| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | BA000036 | 1,326,108 | A→G | D444G (GAT→GGT) | Cgl1259 → | Asp‑tRNAAsn/Glu‑tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | BA000036 | 1,326,108 | 0 | A | G | 99.5% | 752.3 / NA | 190 | D444G (GAT→GGT) | Cgl1259 | Asp‑tRNAAsn/Glu‑tRNAGln amidotransferase B subunit (PET112 homolog) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base G (97/92); minor base T (0/1); total (97/93) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 192 total aligned reads displayed.
TGGTGGGTTTCTTACATCTCTCAGAAGGCTAACGAGTCTGGTGTCGAGCTCGATGCTCTCGGTGTTGCGCCAGCTCACGTTGCTCGCGTCGTTGCGCTTGTTTCTGAAGGCAAGCTGACCAATAAGCTGGCACGTCAGGCTATCGACGGCGTTATTGCTGGCGAAGGCGATGTGGACGCGGTTGTTGCTGCTCGTGGACTGGAAGTTGTTCGCGATGACGGCGCAATTGAAAAGGCTGTCGATGATGCCTTGGCTGCAAACCCAGACATCGTGGAGAAGTACCGCGCTGGCAACACCAAGGTCACCGGCGCCATCGTTGGTGCTGTCATGAAGGCGACCCGCGGTAAGGCTGACCCAGCTCAGGTGAACCAGCTGATCGCAAAGAAGTTGGCTTAAGCTTTTTGCCGTTGAGCTGCTAAAAGTCTCGCATTAAAGGACTGCTTCCCTTCGGGGGAGCATTTCTTTTTAACTAATTACTTGACACGTCAA > BA000036/1325864‑1326352 | tggtggGTTTCTTACATCTCTCAGAAGGCTAACGAGTCTGGTGTCGAGCTCGATGCTCTCGGTGTTGCGCCAGCTCACGTTGCTCGCGTCGTTGCGCTTGTTTCTGAAGGCAAGCTGACCAATAAGCTGGCACGTCAGGCTATCGACGGCGTTATTGCTAGCGAAGGCGATGTGGACGCGGTTGTTGCTGCTCGTGGACTGGAAGTTGTTCGCGATGACGGCGCAATTGAAAAGGCTGTCGATGGTGcc > 2:542705/1‑249 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |