| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NZ_CP025268 | 2,033,768 | (C)5→6 | pseudogene (190/920 nt) | yedA → | drug/metabolite exporter YedA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NZ_CP025268 | 2,033,763 | 1 | . | C | 97.3% | 2043.9 / 41.2 | 601 | pseudogene (185/920 nt) | yedA | drug/metabolite exporter YedA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (12/4); new base C (269/314); total (282/319) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.89e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 663 total aligned reads displayed.
TGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑CC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033625‑2033897 | tataTCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑c < 2:1989948/140‑1 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGACAGCTGGCGTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCCGCCGGTATGTTATAGCTGGCCTGTTTGCTAATGCGCGGACACAAAC‑T‑cg‑c‑c > 2:1055334/1‑140 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTTGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGAGGACACAAAC‑T‑cc‑c‑c > 2:2942813/1‑140 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑c‑c > 1:515464/1‑140 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑c‑c > 2:3816888/1‑140 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑c‑c < 2:6118071/140‑1 (MQ=255) atatCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTACTGGAAGCCGCTATTTTAGTGCTTGAATATATGAAACTGCTCGGACACAAAC‑A‑cc‑c‑c > 2:5291234/1‑140 (MQ=255) atCATTTGGGGCTCTACCTAATTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTTATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑cc‑c‑ccc < 2:3242241/140‑2 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGTCCTACGTTAATGATGGCGGTCGTTCTATTCCTGGCAGCCGGTATTATATTGCTGGCATATTTGCTAATGCGCGGAAACAAAC‑T‑CC‑CACCGCTActa > 2:8137699/1‑138 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTCTTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGt > 2:6847440/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCTTTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGt > 2:7542742/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACACAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGt > 2:8761495/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAATC‑TCCC‑C‑CCGCTACGt > 2:1587910/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACga > 1:3180366/1‑139 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGt > 1:3044904/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGt > 1:8008759/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGt > 1:6843636/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGt > 1:6566259/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGt > 1:6260124/1‑140 (MQ=255) ggggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCATGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGAGAGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACga > 2:9453030/1‑139 (MQ=255) gggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTc < 2:9098270/140‑1 (MQ=255) gggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGAGTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTc < 2:7764642/140‑1 (MQ=255) gggCTCAACCTACCTGGACCTTCGGAATCGCGTGGAACGCGGGCCTCCGTGACTGCTGGCGGGCGTTCGATTCCTGCCAGCCGGTATTTTCTTGCTGGCAATTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTc < 2:4371058/140‑1 (MQ=255) ggCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTcc > 2:2183618/1‑140 (MQ=255) gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCg < 1:4761409/140‑1 (MQ=255) gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCg < 1:1484569/140‑1 (MQ=255) gCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCg < 1:8986682/140‑1 (MQ=255) cAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCgctg > 1:7267416/1‑140 (MQ=255) aaCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCgctgc > 1:3772053/1‑140 (MQ=255) aCCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCgctgct < 1:7659032/140‑1 (MQ=255) aTTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAAt > 1:124577/1‑140 (MQ=255) ttttGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATg < 1:2757258/140‑1 (MQ=255) gTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgc > 2:6196839/1‑140 (MQ=255) tCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCcgcg < 1:1896557/140‑1 (MQ=255) aTTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCt > 2:4510220/1‑140 (MQ=255) cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 1:4055200/140‑1 (MQ=255) cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 1:2394021/140‑1 (MQ=255) cGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt > 1:8537742/1‑140 (MQ=255) cGGATTGGCGCGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATGCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTGTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGAt < 1:6984444/140‑1 (MQ=255) gATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTg < 1:5347579/140‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg < 1:1011964/140‑1 (MQ=255) aTTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTgg < 1:8176102/140‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGc < 2:4183225/140‑1 (MQ=255) ttGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGc < 1:6173294/140‑1 (MQ=255) tGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGcc < 1:9420124/140‑1 (MQ=255) gCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTg > 2:919610/1‑140 (MQ=255) cGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGt > 1:8859734/1‑140 (MQ=255) aaaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGGTCGATTGAGGGACTCGGGTAGTCAAATGCTGGCAAAATTGCAACTGCGAGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGGCTGGTTTTg > 1:5006560/1‑140 (MQ=255) aaGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGNCACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgc < 1:5591820/140‑1 (MQ=255) cTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctgg > 1:5716645/1‑140 (MQ=255) tGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggc < 2:5436655/140‑1 (MQ=255) gCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTgctggctg > 2:7629765/1‑140 (MQ=255) ttAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa < 2:7338410/140‑1 (MQ=255) ttAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTAGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTaa < 1:2530228/140‑1 (MQ=255) tAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAAt < 2:3431359/140‑1 (MQ=255) atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg < 2:9301407/140‑1 (MQ=255) atgatgGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATgg < 1:2669689/140‑1 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGc > 1:9537282/1‑109 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATgg > 1:4885417/1‑140 (MQ=255) ggcgggcgTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑CCAC‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGTCTGTCGGTAATGGCATgg > 2:3985141/1‑140 (MQ=255) gcgggcgTTCGCTTCCTGGCAGCCGGTAGTTGATTGCTGGGATGTTGGCGACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGGCGCGCTGATAGGCCGGTTATTGCTGGGTGTCGGTCCTGGCATggg > 2:2548134/1‑139 (MQ=255) ttCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGtt > 1:7842666/1‑140 (MQ=255) aaTTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGcc < 2:6775681/139‑1 (MQ=255) aTTCCTGGCAGCCGGTATTTTAGAGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCg < 2:8420032/140‑1 (MQ=255) tGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACAt < 1:4321983/140‑1 (MQ=255) gCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGATACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCa > 2:8620046/1‑140 (MQ=255) aGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACTGTTGCCGAACATCaaa < 1:2183618/140‑1 (MQ=255) aGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCaaa > 2:8012678/1‑140 (MQ=255) ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAATC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGGTGCCGAACATCAatat > 2:6955073/1‑140 (MQ=255) ccGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAAt > 1:1077531/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 2:7178440/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt < 1:457556/140‑1 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 1:6418955/1‑140 (MQ=255) cTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCAt > 2:1284324/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 2:272871/1‑140 (MQ=255) ggCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcg > 1:3574096/1‑140 (MQ=255) gCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgc < 2:522993/140‑1 (MQ=255) gCATTTTTGCGACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATcgc < 1:5871910/140‑1 (MQ=255) tGCTCCGGCGCCGACACAAACAC‑CC‑C‑CCGCTTCGGCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATGGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 2:5672206/140‑1 (MQ=255) tGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 2:5843110/140‑1 (MQ=255) tGCTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTa < 2:6268752/140‑1 (MQ=255) cTACTGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGt < 1:1752389/140‑1 (MQ=255) tGCGCGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGtt < 2:3682149/140‑1 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg > 1:2037920/1‑140 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg > 2:891673/1‑140 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg > 2:7391464/1‑140 (MQ=255) gcgcGGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCGGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACAGCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg > 2:2284444/1‑140 (MQ=255) gcgcGGACACAAAA‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTAGTGCTGTCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTg < 2:1461319/140‑1 (MQ=255) cgGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCaa < 1:8732452/140‑1 (MQ=255) cgGACACAAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCaa < 2:2431296/140‑1 (MQ=255) acaAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTg < 1:6721958/140‑1 (MQ=255) acaAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTg < 2:4813229/140‑1 (MQ=255) acaAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTg < 1:5953922/140‑1 (MQ=255) acaAAC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTg < 1:4230578/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCACTGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:6552687/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCTCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:1899306/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:340606/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 2:4918636/140‑1 (MQ=255) aaaC‑TCCC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGATGGCTGTCGGTAATGGCATTGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:2881792/140‑1 (MQ=255) aaaC‑T‑CC‑CTCCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGcc < 1:9251921/140‑1 (MQ=255) | TGTATATCATTTGGGGCTCAACCTATTTTGTCATTCGGATTGGCGTGGAAAGCTGGCCTCCGTTAATGATGGCGGGCGTTCGATTCCTGGCAGCCGGTATTTTATTGCTGGCATTTTTGCTACTGCGCGGACACAAAC‑T‑CC‑C‑CCGCTACGTCCGCTGCTCAATGCCGCGCTGATTGGCCTGTTATTGCTGGCTGTCGGTAATGGCATGGTGACGGTTGCCGAACATCAAAATGTTCCTTCCGGCATCGCCGCCGTAGTGGTTGCAACCGTGCC > NZ_CP025268/2033625‑2033897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |